quinasa de polifosfato

Las enzimas de la superfamilia CYTH , que incluyen polifosfato polimerasas, hidrolizan sustratos que contienen trifosfato y requieren cationes metálicos como cofactores . Poseen un sitio activo único ubicado en el centro de un túnel de barril beta antiparalelo de ocho hebras (el túnel de trifosfato). El nombre CYTH se originó a partir de la designación genética de las adenilil ciclasas bacterianas de clase IV (CyaB) y de la tiamina trifosfatasa (THTPA). Las adenilato ciclasas de clase IV catalizan la conversión de ATP a AMP cíclico 3',5' (cAMP) y PPi. La tiamina trifosfatasa es una enzima citosólica soluble que convierte el trifosfato de tiamina en difosfato de tiamina. Esta superfamilia de dominios también contiene ARN trifosfatasas, polifosfato polimerasas asociadas a membrana, tripolifosfatasas, nucleósido trifosfatasas, nucleósido tetrafosfatasas y otras proteínas con funciones desconocidas.

La reacción generalizada catalizada por las polimerasas de polifosfato vectoriales es: ^{[ 5 ]}

ATP + (fosfato) _n en el citoplasma${\displaystyle \rightleftharpoons }$ADP + (fosfato) _n+1 en el lumen vacuolar

VTC2 posee tres dominios reconocidos: un dominio SPX N-terminal , un dominio central grande similar a CYTH y un dominio transmembrana más pequeño VTC1 (DUF202). El dominio SPX se encuentra en Syg1, Pho81, XPR1 (SPX) y proteínas relacionadas. Este dominio se localiza en los extremos amino terminales de diversas proteínas. En la proteína de levadura Syg1, el extremo N-terminal se une directamente a la subunidad beta de la proteína G e inhibe la transducción de la señal de la feromona de apareamiento . De manera similar, el extremo N-terminal de la proteína humana XPR1 se une directamente a la subunidad beta del heterotrímero de la proteína G, lo que conduce a una mayor producción de AMPc. Por lo tanto, este dominio participa en la transducción de señales asociada a la proteína G. Los extremos N-terminales de varias proteínas implicadas en la regulación del transporte de fosfato, incluidos los supuestos sensores del nivel de fosfato, Pho81 de Saccharomyces cerevisiae y NUC-2 de Neurospora crassa , poseen este dominio.

Los dominios SPX de los transportadores de fosfato de baja afinidad de S. cerevisiae , Pho87 y Pho90, autorregulan la captación y previenen el eflujo. Esta inhibición dependiente de SPX está mediada por una interacción física con Spl2. NUC-2 contiene varias repeticiones de anquirina . Varios miembros de esta familia están anotados como proteínas XPR1: el receptor de retrovirus xenotrópico y politrópico confiere susceptibilidad a la infección con virus de leucemia murina (MLV) xenotrópicos y politrópicos. La infección por estos retrovirus puede inhibir la señalización de cAMP mediada por XPR1 y provocar toxicidad y muerte celular. Se ha observado la similitud entre los reguladores de fosfato Syg1 y las secuencias XPR1, así como la similitud adicional con varias proteínas predichas de función desconocida, de Drosophila melanogaster , Arabidopsis thaliana , Caenorhabditis elegans , Schizosaccharomyces pombe , S. cerevisiae y muchos otros organismos diversos. ^{[ 5 ]}

Hasta 2015, se habían resuelto varias estructuras para esta clase de enzimas, con los códigos de acceso PDB PDB : 1XDO ​,PDB : 1XDP ​,PDB : 2O8R ​,PDB : 3CZP ​,PDB : 3CZQ ​,PDB : 3RHF ​.