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La primera parte comienza el día de Año Nuevo, cuando Jeff Luty, un joven de 17 años, y su amigo Carlos Tucay están a punto de lanzar cohetes en la playa de Stinson . Los dos chicos, interesados ​​en la incipiente pero creciente industria de la nanotecnología, sueñan con fundar Lu-Tuc Space Tech y han insertado nanorobots en los cohetes. Tras la micción de un perro sobre el cohete, vuelven a encenderlos. Sin embargo, el cohete falla y una pieza de lanzamiento se clava en el ojo derecho de Carlos, causándole la muerte.

La primera parte avanza rápidamente varios años, donde Jeff es el director ejecutivo de Nantel, la empresa líder mundial en nanotecnología. Uno de los empleados más destacados de la compañía es el ingeniero Ond Lutter, quien trabaja en un proyecto para crear "nants". Sin embargo, Jeff, aún afligido por la muerte de Carlos, se enfrenta a Ond por la creación de una Tierra virtual con los nants. El gobierno estadounidense compra los nants, y el presidente, Dick Dibbs, anuncia que la Tierra será devorada por los nants y convertida en una versión virtual de la Tierra, o "vEarth". Ond y su familia, sin embargo, no están de acuerdo. Ond, despedido tras discutir con Luty y desafiarlo, se dispone a escribir a mano un código que debería desactivar a los nants y construye una antena para resistir su avance hasta que su casa sea el último refugio que persista en la Tierra física. Sin embargo, Chu, el hijo de nueve años de Ond, es un genio autista capaz de memorizar el código escrito por su padre y salta hacia el muro de nants que ha crecido en la casa de los Lutter. Posteriormente, Chu salta de nuevo fuera del muro de nants y estos comienzan a retroceder. Al día siguiente, los nants han revertido casi por completo su avance por la Tierra y la restauran en su totalidad, hasta que regresan a la Luna y, aparentemente, son destruidos por un satélite chino.

Tras la reversión y destrucción de los nants, Dibbs es arrestado por el gobierno y ejecutado por su participación en la conspiración "vEarth" (clasificada como "traición"). Luty se convierte en un fugitivo buscado y se esconde; Ond, recontratado por Nantel, ahora rebautizada como ExaExa Labs, se inspira en la nanorrobótica para crear un nuevo tipo de nanorobot, conocido como "orphids". Sin embargo, cuando les cuenta a las familias de él y de su compañero Craigor Lundquist en una reunión en la Bahía de San Francisco, Nektar se enfurece con Ond y discute con él sobre los nants, por temor a que se repitan los sucesos. Chu, irritado por los gritos, toma el frasco y rompe el vidrio, liberando a los orphids para que se autorrepliquen rápidamente. En cuestión de horas, los orphids, fuertemente conectados a Internet, se extienden por gran parte de la Costa Oeste, y Ond es buscado por el Departamento de Policía de San Francisco . Los órfidos también proporcionan pantallas para la realidad aumentada , eliminando la necesidad de lentes de contacto de realidad aumentada (o "ojos web"), micrófonos de garganta y otras herramientas de realidad aumentada.

La ciudad tiene dificultades para adaptarse a los órfidos y a la versión sensorialmente inmersiva de Internet, o "orfidnet", que estos ofrecen. Las avanzadas propiedades de la orfidnet permiten oportunidades imposibles con las tecnologías informáticas anteriores, como teleconferencias avanzadas , telepatía e incluso sexo remoto entre parejas físicamente separadas. Sin embargo, esto deja poco espacio para la privacidad , ya que los órfidos apenas permiten que ningún ser vivo esté desconectado de la orfidnet, lo que significa que Ond es el objetivo de una turba que busca lincharlo por la "Noche de los Órfidos".

Nektar, irritada por la liberación de los nants por parte de Ond, se separa de ella y entabla una relación íntima con un cocinero de un restaurante cercano al que conoció a través de la red de orfidos, dejando a Ond al cuidado de Chu. Además, Ond y Chu descubren la existencia de una dimensión de inteligencia superior que refleja en cierta medida la Tierra. Gladax, uno de los gobernantes de la versión "Hibrane" de San Francisco, intenta eliminar el acceso de los "Lobrane" a la Hibrane para mantener alejados a los Lobrane, llegando incluso a penetrar la mente de Chu. La persecución de Ond y Chu por parte de Gladax y la turba anti-nant/orfido finalmente los teletransporta desde el Barco Merz a la versión Hibrane de San Francisco, donde todo es más lento y grande.

Años después, San Francisco se ha vuelto dependiente de la red clandestina, y la historia se centra en un grupo de adolescentes residentes, conocidos como "kiqqies", que no tienen hogar pero dependen de rebuscar en la basura y de una parte específica de la red clandestina llamada "el Gran Cerdo". El Cerdo se considera una adicción para aquellos con la mente despejada, ya que permite a sus usuarios obtener información rápidamente mientras estén conectados.

Jayjay, Thuy, Sonic y Kitty finalmente conocen a Nektar, quien se ha convertido en la chef principal de un restaurante popular y la personalidad principal de una serie de telerrealidad, Founders , que se transmite a los espectadores a través de la red Orphidnet. Nektar estaba siendo torturada psicológicamente y chantajeada por los "escarabajos" de Orphidnet por criticar al candidato presidencial Dick Too Dibbs (y negarse a emitir los anuncios de Dibbs), primo del expresidente caído en desgracia, y los cuatro visitan su casa para deshacerse de los escarabajos. Después de comer con los otros miembros del elenco, Craigor y Jil, y salir de la casa de Nektar, los kiqqies se topan con el cuerpo de un antiguo jugador de juegos cuánticos de alto puntaje que se volvió adicto al Gran Cerdo y murió de hambre, lo que motiva a los kiqqies a visitar el centro Natural Mind para calmar sus mentes lejos del Gran Cerdo.

Los cuatro visitan las oficinas de Natural Mind en el San Francisco Armory y son invitados a la oficina del director del centro, Andrew Topping, quien les ofrece contratar a Sonic y Thuy por sus habilidades (Sonic es un jugador de juegos cuánticos y Thuy escribe "metanovelos"). Cuando los cuatro sospechan de la relación de Topping con Jeff Luty y rechazan la oferta, Topping agarra a Thuy e intenta arrojarla a la rejilla. Los cuatro se enfrentan a Topping, y cuando Sonic forcejea con él para quitarle el arma, JayJay se abalanza sobre él, empujándolo (accidentalmente) a Sonic sin derramar sangre a través de la rejilla. Los tres restantes —Thuy, JayJay y Kittie— huyen del edificio de Natural Mind.

Dos meses después del incidente de Natural Mind, Thuy se está recuperando de su adicción al Big Pig y se centra más en desarrollar su metanovela semiautobiográfica, Wheenk . Cuando comienza a presentar una parte de su metanovela a un pequeño público, el evento es interrumpido por un ataque de shoon. Thuy sale corriendo al otro lado de la calle y es rescatada por JayJay, quien demuestra su reciente dominio de la teletransportación a través de la orphidnet para llevarlos al Merz Boat de Jil y Craigor. Debido a la infidelidad crónica de Craigor, Jil se ha vuelto adicta al sudocoke y tiene un comportamiento errático. Cuando el barco es atacado por ataques de shoons que se sospecha que provienen de Jeff Luty, los cuatro defienden el barco, solo para descubrir por uno de los shoons cómo Sonic había sido chantajeado por Luty para crear ataques de shoons para que Luty los usara contra sus enemigos, incluida Thuy. Tras teletransportarse desde el barco, JayJay y Thuy se detienen en la casa de Nektar antes de ser perseguidos por otro ataque.

Los dos se teletransportan a la Isla de Pascua , donde descansan, reúnen armas y obtienen información de Azaroth y otros Hibraners. También descubren una masacre organizada por Luty en su complejo ExaExa para retrasar a las fuerzas del orden, su plan para liberar de nuevo a los nants en el mundo para un Vearth 2.0, y las intenciones del Gran Cerdo hacia los nants. Los dos se teletransportan de vuelta al Barco Merz para recoger a Craigor y Jil, pero no sin antes curar a Jil de las nanomáquinas que estaban dentro del sudocoke que inhaló. Los cuatro se teletransportan al complejo ExaExa en medio de un tiroteo, luchando contra guardias armados y rescatando a Sonic antes de que Sonic, Thuy y Jil sean capturados por los agentes de Luty, incluido Topping. Luty afirma sus planes para liberar a los nants de su "arca", pero exige sin éxito que Thuy contacte a Ond, que todavía está en Hibrane. Antes de que Topping cumpla la amenaza de Luty de matar a Sonic delante de ella, aparece Gladax y acaba con los agentes. Sonic atraviesa la rejilla cercana y destruye gran parte de la maquinaria con una granada, presumiblemente muriendo en el proceso. Luty escapa por lo que queda de la rejilla. Antes de que se teletransporten fuera del complejo, Jil rompe con Craigor y pone fin a su matrimonio.

Ahora, con el arca en su poder, Thuy y JayJay regresan a la Isla de Pascua para idear una forma de destruir a los nants. Sin embargo, el Gran Cerdo regresa exigiendo que se abra el arca. Tras ser torturado, JayJay accede a abrir la caja, solo para descubrir que está llena de una trampa mortal con una sustancia viscosa de nant que consume gran parte de su cuerpo ante los ojos de Thuy. El dolor de presenciar el incidente lleva a Thuy a terminar su metanovela y encontrar la manera de teletransportarse por su cuenta al Hibrane. Sin embargo, el Gran Cerdo le asegura a Thuy que su novio no solo no está muerto, sino que Thuy podría salvarlo y potencialmente detener la destrucción de la Tierra por los nants si regresa al Lobrane con Ond y Chu antes de medianoche. Desesperada, Thuy se teletransporta al Hibrane.

Thuy se teletransporta, a través de una zona habitada por monstruos conocidos como "subbies", a la versión hibrana de la Isla de Pascua. El mundo de esta dimensión y sus habitantes, como Gladax y Azaroth, son gigantescos y lentos en comparación con los habitantes lobranos como Thuy. Gladax regresa e intenta capturar a Thuy, pero ella escapa y, con la ayuda remota de Azaroth, se teletransporta a San Francisco hibrano. Los dos corren disfrazados a la casa de Gladax, donde Ond y Chu son encarcelados por Gladax para evitar una posible invasión de nants desde Lobrane a Hibrane. Ond le dice a Thuy que si logra devolver a Lobrane la capacidad de etiquetar memoria semántica infinita y telepatía a cada objeto desplegando la octava dimensión (integrada en un arpa propiedad de Gladax), se eliminaría la necesidad de que los nants reconvirtieran la Tierra lobrana a vEarth. El grupo ideó un plan y se puso en marcha. Ond entregó a Thuy a Gladax y el grupo se teletransportó a la habitación de Gladax, donde se encontraba el arpa. Cuando Gladax la dejó atrapada en una red al salir para regañar a sus jardineros (con Azaroth distrayéndola), Thuy se liberó, tomó el arpa y se teletransportó con Ond y Chu. Sin embargo, el grupo dejó caer el arpa en las aguas de la frontera de Planck (o "Subdee" en la jerga hibraner), y Thuy se separó del grupo para regresar al Lobrane mientras intentaba rescatar el arpa, solo para terminar capturada por los subbies.

Mientras tanto, Jayjay permanece en la Tierra en coma, siendo utilizado por el Gran Cerdo para simular una vida entera de 60 años en su cabeza en seis horas. En la realidad simulada , Jayjay espera el regreso de Thuy, pero el Gran Cerdo libera a los nants y transforma la Tierra en vEarth, donde Jayjay se convierte en físico y aprende muchos de los mismos conceptos que Ond y Chu aprendieron en la vida real. Tras dos matrimonios, Jayjay experimenta las presiones de la vida en Vearth y las limitaciones de la dependencia de los recursos computacionales. Jayjay experimenta su muerte a la edad simulada de ochenta y seis años, esperando a Thuy. Mientras tanto, Thuy lucha por escapar de las garras de los subbies que planean devorarla, y su líder es un subbie con aspecto de escarabajo que posee la piel de Luty, quien fue devorado por los subbies al caer en el Subdee. Ella escapa con el arpa y regresa con Jayjay en la Isla de Pascua de Lobrane, solo para que el Gran Cerdo abra el arca de los nants. Los dos se teletransportan a la casa de Nektar en San Francisco, donde Jayjay intenta tocar el "Acorde Perdido" que desplegará la octava dimensión mientras los nants se acumulan y amenazan con devorar el mundo de nuevo. Thuy y Jayjay entran en una habitación para tener sexo, y Jayjay redescubre el Acorde Perdido de su experiencia en la simulación, y lo toca, desplegando la octava dimensión y poniendo fin a la invasión de los nants. El despliegue resulta en la creación de nuevos seres llamados "silps" que copian los datos y el conocimiento tanto de los nants como de los orphids y luego los destruyen a ambos. Los silps se constituyen a sí mismos como un alma superior planetaria conocida como Gaia, y el Gran Cerdo se rediseña a sí mismo como una interfaz para Gaia.

Las vidas de los personajes principales cambian tras los acontecimientos: Jil se divorcia de Craigor y se casa con Ond, Nektar inicia una relación sentimental con Kittie, Chu logra curar su autismo y Jayjay y Thuy se comprometen.