Riboswitch PreQ1-II

Los ribointerruptores PreQ1-II forman una clase de ribointerruptores que se unen específicamente a la pre-queuosina ₁ (PreQ ₁ ), un precursor del nucleósido modificado queuosina . ^{[ 1 ]} Se encuentran en ciertas especies de Streptococcus y Lactococcus , y fueron identificados originalmente como una estructura secundaria de ARN conservada llamada "motivo COG4708". ^{[ 2 ]} Todos los miembros conocidos de esta clase de ribointerruptores parecen controlar miembros de los genes COG4708. Se predice que estos genes codifican proteínas unidas a la membrana y se ha propuesto que sean un transportador de preQ ₁ , o un metabolito relacionado, basándose en su asociación con ribointerruptores que se unen a preQ _{1 .}^{[ 1 ]} Los ribointerruptores PreQ1-II no tienen similitudes aparentes en secuencia o estructura con los ribointerruptores preQ1-I , una clase de ribointerruptores que se unen a preQ ₁ descubierta previamente . De este modo, PreQ ₁ se une a la S-adenosilmetionina como el segundo metabolito descubierto que actúa como ligando de más de una clase de ribointerruptores.

Estructura secundaria consensuada de los ribointerruptores PreQ ₁ -II. La disposición es similar a la utilizada en representaciones publicadas anteriormente. ^{[ 2 ]}^{[ 1 ]}

Referencias

1 2 3 Meyer MM, Roth A, Chervin SM, Garcia GA, Breaker RR (2008). "Confirmación de una segunda clase de aptámeros preQ1 naturales en bacterias Streptococcaceae" . RNA . 14 ( 4): 685– 695. doi : 10.1261/rna.937308 . PMC 2271366. PMID 18305186 .
1 2 Weinberg Z, Barrick JE, Yao Z, et al. (2007). "Identificación de 22 ARN estructurados candidatos en bacterias utilizando la plataforma de genómica comparativa CMfinder" . Nucleic Acids Res . 35 (14): 4809– 4819. doi : 10.1093/nar/gkm487 . PMC 1950547. PMID 17621584 .

Enlaces externos

Página para PreQ1-II_riboswitch en Rfam

[meyer-1] 1 2 3 Meyer MM, Roth A, Chervin SM, Garcia GA, Breaker RR (2008). "Confirmación de una segunda clase de aptámeros preQ1 naturales en bacterias Streptococcaceae" . RNA . 14 ( 4): 685– 695. doi : 10.1261/rna.937308 . PMC 2271366. PMID 18305186 .

[Weinberg2007-2] 1 2 Weinberg Z, Barrick JE, Yao Z, et al. (2007). "Identificación de 22 ARN estructurados candidatos en bacterias utilizando la plataforma de genómica comparativa CMfinder" . Nucleic Acids Res . 35 (14): 4809– 4819. doi : 10.1093/nar/gkm487 . PMC 1950547. PMID 17621584 .

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