Articulo de referencia

PrimPol

PrimPol es una proteína codificada por el gen PRIMPOL en humanos. [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] PrimPol es una proteína eucariota con actividades de ADN polimerasa y ADN primasa involucrada...

PrimPol es una proteína codificada por el gen PRIMPOL en humanos. [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] PrimPol es una proteína eucariota con actividades de ADN polimerasa y ADN primasa involucradas en la síntesis de ADN translesional . A diferencia de la mayoría de las primasas eucariotas, su actividad de cebado utiliza desoxirribonucleótidos en lugar de ribonucleótidos . [ 6 ] [ 7 ] También es la primera proteína identificada en las mitocondrias que tiene actividades de síntesis de ADN translesional.

Etimología

PrimPol fue identificada en un estudio bioinformático y, en un principio, se supuso que solo tenía actividad primasa . [ 8 ] Estudios posteriores in vitro e in vivo han demostrado que posee actividades primasa y polimerasa , las cuales se localizan en el dominio catalítico de PrimPol. [ 6 ] [ 7 ] [ 9 ] Por esta razón, a esta proteína se le asignó el nombre de PrimPol.

Función

PrimPol es una primasa y polimerasa de ADN implicada en la replicación del ADN . A diferencia de la mayoría de las polimerasas de ADN, PrimPol puede iniciar la replicación sin necesidad de un cebador de ARN y puede extenderse a partir de cebadores producidos por PrimPol. [ 6 ] [ 7 ] PrimPol inicia preferentemente la replicación utilizando desoxinucleótidos , en lugar de ribonucleótidos , y solo se extenderá a partir de una cadena de ADN naciente utilizando desoxinucleótidos. PrimPol muestra un sesgo de 1000 veces hacia el apareamiento de bases de Watson-Crick al extender cadenas de ADN. PrimPol desempeña un papel aún no identificado en la replicación no perturbada; las células con deficiencia de PrimPol ralentizan la progresión de la horquilla de replicación, proliferan más lentamente y muestran un aumento de focos de RPA . [ 6 ] [ 7 ]

Síntesis de ADN translesional

Se predice que PrimPol desempeña un papel en la síntesis de ADN translesional. Cuando la horquilla de replicación llega a un sitio de daño en el ADN, se detiene, lo que puede provocar huecos monocatenarios letales y roturas de doble cadena. PrimPol es una de las polimerasas que pueden reclutarse para replicar más allá de los sitios de daño en el ADN. PrimPol se localiza en la cromatina tras la irradiación UV. [ 6 ] PrimPol es capaz de sortear los dímeros de pirimidina altamente distorsionadores producidos como resultado de la irradiación UV del ADN in vitro . [ 6 ] [ 7 ] PrimPol requiere su actividad primasa para sortear las lesiones UV in vivo sin detenerse. [ 9 ] [ 10 ] En conjunto, estos datos sugieren que PrimPol tiene dos modos de acción distintos para sortear las lesiones: uno en la lectura directa de las lesiones de forma clásica mediante la síntesis de ADN translesional y otro en el cebado aguas abajo de la lesión y el relleno del hueco postreplicativo.

Además de las lesiones por radiación UV, PrimPol es capaz de sortear las bases de 8-oxoguanina que se producen en respuesta al estrés oxidativo , lo cual es de particular importancia en el entorno oxidativo de las mitocondrias . [ 7 ] La ADN polimerasa replicativa identificada en las mitocondrias, pol γ , maneja estas lesiones de manera deficiente. Además, PrimPol es capaz de sortear un sitio AP en aproximadamente el 80% de los casos. [ 7 ]

Estructura

PrimPol está formada por dos dominios proteicos : un dominio catalítico de primasa-polimerasa y un dominio de dedo de zinc. [ 6 ] [ 7 ] Las funciones catalíticas de primasa y polimerasa de PrimPol se localizan en el dominio de primasa-polimerasa, pero la actividad de primasa de PrimPol requiere el dominio de dedo de zinc. [ 9 ] [ 10 ]

localización subcelular

Se ha descubierto que la PrimPol se localiza principalmente en el citosol (47%), con fracciones importantes también encontradas en las mitocondrias (34%) y los compartimentos nucleares (19%). [ 7 ] La fracción mitocondrial de PrimPol se encuentra en la matriz mitocondrial, a diferencia de la membrana o el espacio intermembrana.

Mutaciones de PrimPol

Se ha correlacionado una mutación en el gen PRIMPOL con la miopía . [ 11 ] [ 12 ] Se ha demostrado que esta mutación de tirosina a aspartato (Y89D) produce una variante poco procesiva de la proteína PrimPol, y esta variante Y89D impide las horquillas de replicación in vivo . [ 12 ]

Referencias

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000164306 Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000038225 Ensembl , mayo de 2017
  3. "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. "Entrez Gene: Entrez Gene: Primasa y polimerasa PRIMPOL (dirigida por ADN)" .
  6. 1 2 3 4 5 6 7 8 Bianchi J, Rudd SJ, Jozwiakowski SK, Bailey LJ, Soura V, Taylor E, Stevanovic I, Green AJ, Stracker TH, Lindsay HD, Doherty AJ (noviembre de 2014). "PrimPol evita los fotoproductos UV durante la replicación del ADN cromosómico eucariota" . Molecular Cell . 52 (4): 566– 73. doi : 10.1016/j.molcel.2013.10.035 . PMC 4228047. PMID 24267451 .  
  7. 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 García-Gómez S, Reyes A, Martínez-Jiménez MI, Chocrón ES, Mourón S, Terrados G, Powell C, Salido E, Méndez J, Holt IJ, Blanco L (noviembre de 2014). "PrimPol, una primasa/polimerasa arcaica que opera en células humanas" . Célula molecular . 52 (4): 541– 53. doi : 10.1016/j.molcel.2013.09.025 . PMC 3899013 . PMID 24207056 .  
  8. Iyer LM, Koonin EV, Leipe DD, Aravind L (julio de 2005). "Origen y evolución de la superfamilia de primasas arqueo-eucariotas y proteínas relacionadas con dominios de palma: perspectivas estructurales y nuevos miembros" . Nucleic Acids Research . 33 (12): 3875–96 . doi : 10.1093/nar/gki702 . PMC 1176014. PMID 16027112 .  
  9. 1 2 3 Keen BA, Jozwiakowski SK, Bailey LJ, Bianchi J, Doherty AJ (marzo de 2014). "Disección molecular de la arquitectura de dominios y actividades catalíticas de la PrimPol humana" . Nucleic Acids Research . 42 (9): 5830– 45. doi : 10.1093/nar/gku214 . PMC 4027207. PMID 24682820 .  
  10. 1 2 Mourón S, Rodriguez-Acebes S, Martínez-Jiménez MI, García-Gómez S, Chocrón S, Blanco L, Méndez J (noviembre de 2013). "Recebado de la síntesis de ADN en bifurcaciones de replicación detenidas por PrimPol humano". Naturaleza Biología estructural y molecular . 20 (12): 1383– 9. doi : 10.1038/nsmb.2719 . hdl : 10261/98409 . PMID 24240614 . S2CID 28904104 .  
  11. Zhao F, Wu J, Xue A, Su Y, Wang X, Lu X, Zhou Z, Qu J, Zhou X (abril de 2013). "La secuenciación del exoma revela una mutación en CCDC111 asociada con miopía alta". Human Genetics . 132 (8): 913–21 . doi : 10.1007/s00439-013-1303-6 . PMID 23579484. S2CID 16845466 .  
  12. 1 2 Keen BA, Bailey LJ, Jozwiakowski SK, Doherty AJ (septiembre de 2014). "Mutación humana PrimPol asociada con miopía alta tiene un defecto de replicación del ADN" . Nucleic Acids Research . 42 (19): 12102–11 . doi : 10.1093/nar/gku879 . PMC 4231748. PMID 25262353 .