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Articulo de referencia

Bioinformática QFAB

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QFAB Bioinformatics es una organización con sede en Queensland dedicada a la provisión de recursos en bioinformática , bioestadística y plataformas informáticas especializadas . QFAB opera en toda Australia y es un contribuyente clave al Recurso de Bioinformática de EMBL Australia . [ 1 ]

Historia

QFAB se estableció en 2007, [ 2 ] con financiación del Programa de Alianzas de Investigación Nacional e Internacional del Gobierno de Queensland, [ 3 ] como una empresa conjunta entre la Universidad de Queensland , la Universidad Tecnológica de Queensland , la Universidad Griffith , el Centro Australiano de Investigación de Salud Electrónica de CSIRO y el Departamento de Agricultura, Pesca y Silvicultura del Gobierno de Queensland .

Mark Ragan del Instituto de Biociencias Moleculares (IMB) y Anthony Maeder del Centro Australiano de Investigación en Salud Electrónica lideraron el establecimiento de QFAB y nombraron a Jeremy Barker como director ejecutivo (2007-2014) para abordar tres cuestiones críticas que entonces enfrentaba la bioinformática en Queensland : [ 4 ]

  1. datos integrados y computación de alto rendimiento en un entorno seguro
  2. Ancho de banda de red asequible
  3. acceso a personal experto

En 2015, Dominique Gorse se convirtió en CEO de QFAB y lideró la alianza estratégica con QCIF, la Fundación de Infraestructura Cibernética de Queensland; las dos organizaciones se fusionaron en abril de 2016. [ 5 ] QCIF opera importantes recursos de computación de alto rendimiento , computación en la nube y almacenamiento de datos, y forma parte de la infraestructura nacional de investigación electrónica.

Fundación de Infraestructura Cibernética de Queensland

QFAB Bioinformatics es una unidad de la Queensland Cyber ​​Infrastructure Foundation (QCIF), una organización sin ánimo de lucro basada en la membresía.

Miembros

Miembro afiliado

Galaxia Australia

QFAB y QCIF, junto con el Centro de Bioinformática de Melbourne de la Universidad de Melbourne y el Centro de Computación para la Investigación de la Universidad de Queensland, construyeron y operan conjuntamente Galaxy Australia, que es una característica importante del Laboratorio Virtual de Genómica, [ 6 ] basado en el sistema de flujo de trabajo científico Galaxy (biología computacional) .

Referencias

  1. ↑ Schneider, Maria Victoria; Griffin, Philippa C; Tyagi, Sonika; Flannery, Madison; Dayalan, Saravanan; Gladman, Simon; Watson-Haigh, Nathan; Bayer, Philipp E; Charleston, Michael; Cooke, Ira; Cook, Rob; Edwards, Richard J; Edwards, David; Gorse, Dominique; McConville, Malcolm; Powell, David; Wilkins, Marc R; Lonie, Andrew (2008). "Establecimiento de una infraestructura nacional de investigación distribuida que proporciona apoyo bioinformático a investigadores de ciencias de la vida en Australia" . Briefings in Bioinformatics . 20 (2): 384– 389. doi : 10.1093/bib/bbx071 . PMC 6433737. PMID 29106479 .  
  2. ↑ Ragan, MA; Littlejohn, T.; Ross, Bruce (2008). "Biología computacional y bioinformática a escala genómica en Australia" . PLOS Computational Biology . 4 (8) e1000068. Bibcode : 2008PLSCB...4E0068R . doi : 10.1371/journal.pcbi.1000068 . PMC 2440818. PMID 18769502 .  
  3. ↑ "El gobierno de Queensland otorga a IMB más de 2,5 millones de dólares en financiación" . UQ News . 2006. Consultado el 30 de mayo de 2019 .
  4. ↑ "Instalación de Queensland para Bioinformática Avanzada (QFAB) (2006–2010)" . Investigadores de la UQ . 2006. Consultado el 30 de mayo de 2019 .
  5. ↑ "QCIF - QCIF en 2017: Un año en retrospectiva" . archivo-www.qcif.edu.au . Archivado del original el 2 de junio de 2021. Recuperado el 31 de mayo de 2021 .
  6. ↑ Afgan, Enis; Sloggett, Clare; Goonasekera, Nuwan; Makunin, Igor; Benson, Derek; Crowe, Mark; Gladman, Simon; Kowsar, Yousef; Pheasant, Michael; Horst, Ron; Lonie, Andrew (2015). "Genomics Virtual Laboratory: A Practical Bioinformatics Workbench for the Cloud" . PLOS ONE . 10 (10) e0140829. Bibcode : 2015PLoSO..1040829A . doi : 10.1371/journal.pone.0140829 . PMC 4621043. PMID 26501966 .