Articulo de referencia

QRICH2

La proteína rica en glutamina 2 es una proteína que en humanos está codificada por el gen QRICH2 en el cromosoma 17 humano. [ 5 ] [ 6 ] La función de la proteína QRICH2 es en gr...

La proteína rica en glutamina 2 es una proteína que en humanos está codificada por el gen QRICH2 en el cromosoma 17 humano. [ 5 ] [ 6 ] La función de la proteína QRICH2 es en gran parte desconocida, pero se ha demostrado que el gen QRICH2 contiene un dominio de glutenina de alto peso molecular y un dominio involucrado en la ATPasa . [ 6 ] El gen QRICH2 se expresa en gran medida en los testículos , [ 7 ] y la proteína QRICH2 se localiza subcelularmente en el núcleo. [ 8 ]

Gene

El ARNm de QRICH2 tiene una longitud de 5411 pb y su ubicación cromosómica en humanos es 17q25.1. El ARNm de QRICH2 tiene 19 exones y contiene dos dominios funcionales principales: un dominio de glutenina de alto peso molecular (aminoácidos 446-979) y un dominio involucrado en la ATPasa (aminoácidos 1036-1413). QRICH2 se localiza entre el gen UBAL D2 y el gen PRPSAP1 en el cromosoma 17. [ 9 ] No se predice ninguna estructura de bucle de tallo en el ARNm de QRICH2 porque no hay secuencias de ARN complementarias. [ 10 ]

Proteína

La proteína QRICH2 tiene 1663 aminoácidos de longitud, y el 10,9% de estos aminoácidos son glutamina (Q). El 38% de la estructura secundaria de la proteína QRICH2 es hélice alfa , el 39% es lámina beta y el 13% es giro. [ 11 ] [ 12 ] El tipo de tejido humano con el nivel más alto de expresión de QRICH2 es el testículo , y este resultado también se confirma mediante el perfil de expresión génica para ratón y perro. [ 13 ] La localización subcelular de la proteína QRICH2 es el núcleo. QRICH2 es una proteína soluble, su hidrofobicidad promedio es -0,5995. [ 14 ] La proteína QRICH2 interactúa con varias otras proteínas, incluidas SSSCA1, TSSC1 , GAPDH , NUP98 y SNAI1 . [ 5 ]

Homología

Fuente: [ 15 ]

parálogos

Las secuencias de ARNm de FLJ25737 [ 16 ] coinciden perfectamente con dos regiones del ARNm de QRICH2 (los pares de bases 3157-4302 de QRICH2 coinciden con los pares de bases 1-1146 de FLJ25737, y los pares de bases 4998-5307 de QRICH2 coinciden con los pares de bases 1140-1499 de FLJ25737). Sin embargo, FLJ25737 se localiza en el cromosoma 7 y QRICH2 en el cromosoma 17.

Ortólogos

La proteína QRICH2 posee ortólogos bien conservados en numerosas especies. Las secuencias de las proteínas ortólogas coinciden muy bien en la región donde se encuentran el dominio de glutenina de alto peso molecular y el dominio implicado en la actividad ATPasa.

Función

La función de la proteína QRICH2 es mayormente desconocida. Se ha demostrado que QRICH2 pertenece a los grupos de expresión comunes en el cromosoma 17 humano. Los siguientes genes pertenecen a los grupos de expresión comunes en el cromosoma 17: [ 17 ] NCOR1 , GFAP , QRICH2, ANAPC11 y PER1 . QRICH2 también puede ser un gen regulado positivamente involucrado en la adhesión celular y la morfogénesis celular . [ 18 ] La alta expresión del gen QRICH2 en el testículo puede sugerir que la proteína QRICH2 tiene algunas funciones relacionadas con la producción de hormonas en los hombres. La proteína QRICH2 tiene algunas similitudes de secuencia con la proteína 1 similar a N(1)-acetilo de espermidina / espermina en varias especies. [ 15 ]

Referencias

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000129646 Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000070331 Ensembl , mayo de 2017
  3. "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. 1 2 "Genecards: QRICH2" . Genecards, El Compendio de Genes Humanos.
  6. 1 2 "NCBI Nucleótido: QRICH2" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Base de Datos de Nucleótidos. 26 de enero de 2014.
  7. "NCBI Gene Expression Omnibus (GEO): expresión de QRICH2 en varios tejidos humanos" .
  8. "Predicción PSORT II" .
  9. "NCBI Gene: QRICH2" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Base de Datos de Genes.
  10. "Diagrama de puntos de ácidos nucleicos" . Archivado del original el 19 de agosto de 2015. Recuperado el 14 de mayo de 2013 .
  11. "Herramienta CHOFAS" . Centro de Supercomputación de San Diego.
  12. Chou PY, Fasman GD (1978). "Predicción de la estructura secundaria de las proteínas a partir de su secuencia de aminoácidos". Avances en enzimología y áreas relacionadas de la biología molecular . Predicción de la estructura secundaria de las proteínas a partir de su secuencia de aminoácidos. Vol. 47. págs. 45–148 . doi : 10.1002/9780470122921.ch2 . ISBN   978-0-470-12292-1. PMID 364941 . 
  13. "Datos de expresión (perfil EST) para QRICH2" . Unigene NCBI. Archivado del original el 12 de junio de 2015.
  14. "SOSUI, Clasificación y Predicción de Estructura Secundaria" . Portal de Recursos Bioinformáticos Expasy.
  15. 1 2 "NCBI BLAST" . Herramienta básica de búsqueda de alineación local.
  16. "NCBI FLJ25737" . Base de datos de nucleótidos del NCBI. 13 de septiembre de 2006.
  17. Zaravinos A, Lambrou GI, Boulalas I, Delakas D, Spandidos DA (2011). "Identificación de genes comunes expresados ​​diferencialmente en el cáncer de vejiga urinaria" . PLOS ONE . 6 (4) e18135. Bibcode : 2011PLoSO...618135Z . doi : 10.1371/journal.pone.0018135 . PMC 3070717. PMID 21483740 .  
  18. Król M, Pawłowski KM, Szyszko K, Maciejewski H, Dolka I, Manuali E, Jank M, Motyl T (2012). "Perfiles de expresión génica de células de cáncer de mama canino cultivadas con fibroblastos asociados al carcinoma (CAF) en cocultivo in vitro" . BMC Vet. Res . 8 : 35. doi : 10.1186/1746-6148-8-35 . PMC 3355042. PMID 22453032 .