RAB2B

La proteína Rab-2B, relacionada con Ras, es una proteína que en los seres humanos está codificada por el gen RAB2B .

RAB2B es necesaria para el transporte de proteínas desde el retículo endoplasmático al complejo de Golgi . Pertenece a la superfamilia de GTPasas pequeñas, específicamente a la familia de proteínas RAB . ^{[ 5 ]} Las GTPasas pequeñas son un tipo de enzimas hidrolasas que pueden unirse a un GTP para formar un GDP. Este proceso hace que las GTPasas pequeñas sean activas cuando están unidas a un GTP e inactivas cuando están unidas a un GDP. Dentro de esta superfamilia de GTPasas pequeñas podemos encontrar la subfamilia RAS. Esta familia se divide en 5 grupos: GTPasas Ras, Rho, Ran, Rab y Arf. La función principal de RAB2B es regular el transporte de vesículas y la fusión de membranas.

RAB2B es una proteína humana cuyo gen se localiza en el cromosoma catorce. Posee un núcleo compuesto por elementos básicos como oxígeno, carbono, nitrógeno y fósforo. Su estructura secundaria consta de ocho hélices alfa y seis láminas beta. Además, contiene un ion magnesio y una molécula de GDP. ^{[ 6 ]}

La proteína RAB2B madura contiene tres modificaciones postraduccionales : una fosfoserina en la posición 202 en lugar de una serina normal, y dos lipidaciones en las posiciones 215-216. Presenta un dominio de motivo entre los aminoácidos 35 y 43.

Debido al empalme alternativo , existen dos isoformas de esta misma proteína. La isoforma 1 es la secuencia canónica, es decir, la más común, con un peso molecular de 24 214 Da. ^{[ 7 ]} La isoforma 2 consta de tan solo 151 aminoácidos, con una masa de 16 667 Da.

Las pequeñas GTPasas de la superfamilia RAB son reconocidas como actores clave de la maquinaria proteica involucrada en el transporte vesicular ^{[ 8 ]} y la dinámica de orgánulos en células eucariotas. RAB2B sigue principalmente vías exocíticas, desde el retículo endoplasmático hasta el complejo de Golgi. Las proteínas RAB participan en el acoplamiento y la fusión de vesículas de transporte con sus membranas diana. Estas proteínas se asocian con proteínas efectoras (GARIL4 y GARIL5) para formar complejos.

Para realizar su función biológica, RAB2B debe cambiar de la forma GDP a la forma GTP, lo cual es posible gracias a la catálisis de las proteínas GEF, que son factores de intercambio de guanina. Por otro lado, cuando RAB2B está inactivo en el citosol, la forma GDP se mantiene debido a la interacción con las proteínas GDI, que son proteínas de disociación de GDP. ^{[ 9 ]}

Los estudios también han demostrado que RAB2B afecta la respuesta antiviral del IFN inducida por el ADN citosólico. Por ello, la deficiencia de RAB2B permite que el virus vaccinia se replique. Tras la estimulación con ADN, RAB2B se une al aparato de Golgi, junto con el estimulador de genes de interferón (STING) , el mediador de la señal descendente de cGAS. Para que RAB2B se adhiera al aparato de Golgi, se requiere su actividad de unión a GTP, así como el reclutamiento de GARIL5, para que se forme el complejo RAB2B-GARIL5. También se ha demostrado que la deficiencia de GARIL5 afecta la respuesta antiviral del IFN, lo que indica que todo el complejo RAB2B-GARIL5 regula el eje de señalización cGAS-STING , promoviendo así las respuestas de IFN contra el ADN citosólico ( virus de ADN ). ^{[ 10 ]}

La reducción de la expresión de la isoforma RAB2B afecta la morfología del complejo de Golgi en mamíferos, induciendo su fragmentación. ^{[ 11 ]} Aunque estas proteínas de la familia RAB son altamente homólogas entre sí ( RAB2A y RAB2B tienen un 85,8 % de identidad de aminoácidos), la reducción de la expresión de cualquiera de ellas (desde RAB1A hasta RAB8A) provoca que el complejo de Golgi se disperse por el citoplasma celular. Debido a esto, el complejo RAB2B-GARIL5 deja de funcionar correctamente, afectando la respuesta al IFN ^{[ 10 ]} y potenciando la replicación de muchos virus, como se ha visto anteriormente.

El patrón de expresión del gen humano RAB2B revela un transcrito en riñón, próstata, pulmón, timo y colon, y un nivel de expresión menor en placenta, páncreas y músculo esquelético. Además, se ha demostrado que el transcrito se sobreexpresa en el adenocarcinoma de colon , así como en el cáncer de páncreas. ^{[ 12 ]} Esta observación implica que esta proteína podría tener una estrecha relación con los tumores de colon. ^{[ 13 ]}

• Resumen de toda la información estructural disponible en el PDB para UniProt : Q8WUD1 (proteína Rab-2B relacionada con Ras) en el PDBe-KB .