Articulo de referencia

REEP5

La proteína potenciadora de la expresión del receptor 5 es una proteína que en humanos está codificada por el gen REEP5 . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] La proteína potenciadora de la expres...

La proteína potenciadora de la expresión del receptor 5 es una proteína que en humanos está codificada por el gen REEP5 . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] La proteína potenciadora de la expresión del receptor es una proteína codificada en humanos por el gen REEP5.

Gene

REEP5 se localiza en el cromosoma 5 entre los pares de bases 112876385 y 112922289 en la cadena negativa. [ 8 ] El gen incluye cinco exones. [ 8 ] Los genes DCP2 y SRP19 se localizan corriente arriba y corriente abajo de REEP5 en humanos. [ 9 ]

Proteína

La proteína es miembro de la familia REEP, que generalmente facilita el tráfico intracelular a través de alteraciones en el retículo endoplasmático, y que tiene la capacidad de mejorar la actividad de los receptores acoplados a proteínas G. [ 10 ] La proteína humana tiene 189 aminoácidos de longitud, contiene dos regiones transmembrana y una región denominada TB2_DP1_HVA22, [ 11 ] La masa de la proteína antes de la modificación es de 21,5 kdal. [ 12 ] En comparación con la colección SwissProt de proteínas humanas, REEP5 está compuesta por porcentajes normales de todos los aminoácidos. [ 12 ] Aparte de un largo tramo de aminoácidos eléctricamente neutros, no aparecen patrones significativos. [ 12 ] Existe una segunda isoforma en humanos, y tiene 131 aminoácidos de longitud como resultado de un cambio después del aminoácido 117. [ 13 ] La mayor parte del quinto exón no está incluida.

Topología de la proteína humana REEP5 predicha por PROTTER

Regulación

Nivel genético

Expresión tisular

REEP5 se expresa en varios tejidos a un nivel relativamente alto, con al menos 20 lecturas por kilobase de transcrito, por millón de lecturas mapeadas que aparecen en los tejidos suprarrenal, adiposo, vesícula biliar, corazón, riñón, próstata, pulmón y vejiga urinaria. [ 14 ] La expresión es aún más elevada en los tejidos cerebral y tiroideo. [ 14 ]

Los datos de secuenciación de ARN del eje hipotalámico-pituitario-adrenal (HPA) para REEP5 muestran una alta expresión en el cerebro y la tiroides.

Factores de transcripción

El factor de crecimiento nervioso (EGR) es un factor de transcripción con un sitio de unión potencial en el promotor REEP5, que promueve la plasticidad neuronal y, por lo tanto, podría explicar los niveles elevados de la proteína 5 potenciadora de la expresión del receptor en el cerebro. [ 15 ]

Además, dos factores de transcripción relacionados con el desarrollo y la función del corazón tienen posibles sitios de unión en el promotor. La caja de transcripción 20 (TBX20) está relacionada con el desarrollo del corazón, y las deficiencias de proteínas están vinculadas a una función cardíaca deficiente en ratones adultos y a la muerte en lactantes antes de la gestación. [ 16 ] MyoD es un regulador miogénico que se ha detectado en los corazones embrionarios de algunas aves en las células de Purkinje, que están relacionadas con la función contráctil.

Nivel de proteínas

A nivel subcelular, REEP5 se expresa en el retículo endoplasmático . [ 17 ] La tinción inmunoquímica lo localiza allí. [ 18 ]

Se predijeron computacionalmente varias modificaciones postraduccionales en humanos y ortólogos cercanos. Se predijo la acetilación del segundo aminoácido. [ 19 ] Se predijo la fosforilación del aminoácido 150 en humanos, ratones y pollos. [ 20 ] También se predijeron adiciones de O-GlcNAc en los sitios 128, 188 y 189. [ 21 ] Se predijeron sitios de sumoilación en los aminoácidos 147, 175, 186 y 187. [ 22 ] Se detectó la escisión del propéptido en el aminoácido 11. [ 23 ] Se predijo la glicación en los aminoácidos 16, 117, 164, 186 y 187. [ 24 ]

Homología

Parálogos

REEP5 tiene cinco parálogos en humanos: REEP1, REEP2, REEP3, REEP4 y REEP. [ 25 ]

Ortólogos

REEP5 tiene ortólogos tan distantes de los humanos como Symbiodinium microadriacticum, una especie de protista . [ 25 ] La identidad de secuencia es alta en vertebrados, pero disminuye significativamente fuera de este grupo. La región DP1/TB2/HVA22 está bien conservada en comparación con las dos regiones transmembrana.

Tasa de evolución

La tasa de evolución de la proteína REEP5 es moderadamente alta, situándose entre la del citocromo c y la del fibrinógeno alfa. Se prevé que las mutaciones neutras se produzcan aproximadamente una vez cada millón de años.

Gráfico que muestra la tasa de evolución de REEP5 en comparación con el citocromo C y el fibrinógeno alfa.

Socios que interactúan

REEP5 interactúa con varias proteínas, incluido el Regulador de la señalización de la proteína G 2, que se detectó mediante hibridación en levadura 2. RGS2 participa en las vías de señalización de la proteína G 2 y en la contracción de los tejidos musculares lisos. Derlin 2 (Derl2) interactúa con REEP5, como se detectó mediante co-inmunoprecipitación con anti-etiqueta, y degrada las glicoproteínas mal plegadas en el retículo endoplasmático. [ 26 ] El receptor colinérgico muscarínico 5 se detectó como interactuante mediante reconstrucción de ubiquitina. [ 27 ] CHRM5 se une a la acetilcolina y puede afectar la función de los sistemas nerviosos central y periférico. [ 28 ]

También se detectó el regulador de la señalización de la proteína G 2 mediante hibridación en levadura 2, y es un regulador del receptor de la proteína G que puede estar involucrado en la contracción del músculo liso vascular. [ 27 ] [ 29 ]

Se detectaron experimentalmente cuatro proteínas en varios artículos. [ 30 ] Tres de ellas, Atlastin GTPase 1, Atlastin GTPase 2 y Zinc Finger FYVE-Type Containing 27, están relacionadas con la estructuración del retículo endoplasmático (túbulos en particular), el desarrollo de axones o el crecimiento neuronal. [ 17 ] [ 31 ] La cuarta es REEP6, que es responsable del transporte de receptores a la superficie celular, así como de la regulación de la estructura del retículo endoplasmático. [ 32 ]

SARS-CoV-2

REEP5 es una de las muchas proteínas humanas que interactúan con el SARS-CoV-2 . Específicamente, la proteína del coronavirus P0DTC5, que aparece en el compartimento intermedio entre el retículo endoplasmático y el aparato de Golgi, interactúa con REEP5. P0DTC5 es una proteína de la envoltura viral crucial para la morfogénesis viral, lo que hace posible que REEP5 esté relacionada de alguna manera con el empaquetamiento o la liberación del virus de las células humanas. [ 33 ]

Importancia clínica

Las investigaciones han relacionado el gen REEP5 con diversas enfermedades y trastornos.

En el cáncer de colon, la expresión de REEP5 aumenta la actividad de CXCR1, un receptor proteico que contribuye al crecimiento y la propagación de las células cancerosas. Los investigadores han descubierto que la baja expresión de REEP5 reduce la eficacia de CXCR1 y disminuye la capacidad de las células de cáncer de pulmón para metastatizar. [ 10 ] Esto proporciona tanto una diana potencial para la terapia contra el cáncer como evidencia adicional de que REEP5 funciona como una proteína que aumenta la actividad de otras proteínas receptoras. Otro tipo de cáncer relacionado con REEP5 es el cáncer de colon, en el que la proteína normalmente interactúa con HCCR1 y la neutraliza, una proteína que de otro modo interferiría con P53 y contribuiría a la progresión del cáncer. [ 34 ]

REEP5 también se ha relacionado con trastornos cardíacos, y la investigación sobre esta conexión ha revelado que ayuda a organizar el retículo sarcoplásmico de unión en los miocitos. REEP5 alinea el retículo sarcoplásmico de unión con los túbulos T, lo que promueve la liberación eficaz de iones de calcio. Cuando la función de la proteína se ve alterada, la unión se desalinea y la liberación de iones de calcio se vuelve menos eficaz. Dada la importancia de los iones de calcio para las contracciones musculares que impulsan el corazón, la modulación de REEP5 podría ser una opción terapéutica en algunos trastornos. [ 35 ]

Además, existe cierta evidencia estadística que vincula ciertos SNP encontrados en el ARNm de REEP5 con el trastorno depresivo mayor. [ 36 ] Sin embargo, no se ha confirmado un mecanismo biológico y el estudio solo analizó una población limitada. [ 36 ]

Referencias

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000129625 Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000005873 Ensembl , mayo de 2017
  3. "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. Clark AJ, Metherell LA, Cheetham ME, Huebner A (diciembre de 2005). "La insensibilidad hereditaria a la ACTH ilumina los mecanismos de acción de la ACTH". Trends in Endocrinology and Metabolism . 16 (10): 451–7 . doi : 10.1016/j.tem.2005.10.006 . PMID 16271481. S2CID 27450434 .  
  6. Saito H, Kubota M, Roberts RW, Chi Q, Matsunami H (noviembre de 2004). "Los miembros de la familia RTP inducen la expresión funcional de los receptores de olores de mamíferos" . Cell . 119 ( 5): 679– 91. doi : 10.1016/j.cell.2004.11.021 . PMID 15550249. S2CID 13555927 .  
  7. "Gen Entrez: proteína accesoria del receptor REEP5 5" .
  8. 1 2 "Proteína accesoria del receptor REEP5 5 [ Homo sapiens (humano) ] - Gen - NCBI" . www.ncbi.nlm.nih.gov . Consultado el 30 de julio de 2020 .
  9. "Húmero hg38 chr5:112,865,773-113,003,301 Navegador del genoma UCSC v401" . genome.ucsc.edu . Consultado el 31 de julio de 2020 .
  10. 1 2 Park CR, You DJ, Park S, Mander S, Jang DE, Yeom SC, et al. (diciembre de 2016). " Las proteínas accesorias REEP5 y REEP6 refinan las respuestas celulares mediadas por CXCR1 y la progresión del cáncer de pulmón" . Scientific Reports . 6 39041. Bibcode : 2016NatSR...639041P . doi : 10.1038/srep39041 . PMC 5155276. PMID 27966653 .   
  11. "Proteína 5 que mejora la expresión del receptor [ Homo sapiens ] - Proteína - NCBI" . www.ncbi.nlm.nih.gov . Consultado el 22 de junio de 2020 .
  12. 1 2 3 "SAPS < Estadísticas de secuencias < EMBL-EBI" . www.ebi.ac.uk. Consultado el 31 de julio de 2020 .
  13. "UniProtKB - Q00765 (REEP5_HUMAN)" . UniProt . 17 de junio de 2020. Consultado el 30 de julio de 2020 .
  14. 1 2 "Expresión del gen REEP5 - Gen - NCBI" . www.ncbi.nlm.nih.gov . Consultado el 30 de julio de 2020 .
  15. Levkovitz Y, Baraban JM (mayo de 2002). "Un inhibidor dominante negativo de Egr bloquea el crecimiento de neuritas inducido por el factor de crecimiento nervioso al suprimir la activación de c-Jun: papel de un complejo Egr/c-Jun" . The Journal of Neuroscience . 22 (10): 3845–54 . doi : 10.1523/JNEUROSCI.22-10-03845.2002 . PMC 6757642. PMID 12019303 .  
  16. ^ Stennard FA, Costa MW, Lai D, Biben C, Furtado MB, Solloway MJ, et al. (mayo de 2005). "El factor de transcripción Tbx20 de caja T murina actúa como represor durante el desarrollo del corazón y es esencial para la integridad, función y adaptación del corazón en adultos" . Desarrollo . 132 (10): 2451– 62. doi : 10.1242/dev.01799 . PMID 15843414 . S2CID 1021757 .   
  17. 1 2 Chang J, Lee S, Blackstone C (septiembre de 2013). "La protrudina se une a las atlastinas y a las proteínas que dan forma al retículo endoplasmático y regula la formación de redes" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 110 (37): 14954– 9. Bibcode : 2013PNAS..11014954C . doi : 10.1073/pnas.1307391110 . PMC 3773775. PMID 23969831 .  
  18. "REEP5 ] Anticuerpos primarios" . www.thermofisher.com . Consultado el 31 de julio de 2020 .
  19. "Servidor NetAcet 1.0" . www.cbs.dtu.dk. Consultado el 1 de agosto de 2020 .
  20. "Servidor NetPhos 3.1" . www.cbs.dtu.dk. Consultado el 1 de agosto de 2020 .
  21. "Servidor YinOYang 1.2" . www.cbs.dtu.dk. Consultado el 1 de agosto de 2020 .
  22. "GPS-SUMO: Predicción de sitios de SUMOilación y motivos de interacción de SUMO" . sumosp.biocuckoo.org . Archivado del original el 10 de mayo de 2013. Consultado el 1 de agosto de 2020 .
  23. "Servidor ProP 1.0" . www.cbs.dtu.dk. Consultado el 1 de agosto de 2020 .
  24. "Servidor NetGlycate 1.0" . www.cbs.dtu.dk. Consultado el 1 de agosto de 2020 .
  25. 1 2 "Protein BLAST: búsqueda en bases de datos de proteínas mediante una consulta de proteínas" . blast.ncbi.nlm.nih.gov . Consultado el 31 de julio de 2020 .
  26. Oda Y, Okada T, Yoshida H, Kaufman RJ, Nagata K, Mori K (enero de 2006). "Derlin-2 y Derlin-3 están regulados por la respuesta de proteínas desplegadas de mamíferos y son necesarios para la degradación asociada al RE" . The Journal of Cell Biology . 172 (3): 383–93 . doi : 10.1083/jcb.200507057 . PMC 2063648. PMID 16449189 .  
  27. 1 2 "La base de datos de interacción molecular: un recurso central de ELIXIR" . Consultado el 2 de agosto de 2020 .
  28. "CHRM5 receptor colinérgico muscarínico 5 [ Homo sapiens (humano) ] - Gen - NCBI" . www.ncbi.nlm.nih.gov . Consultado el 2 de agosto de 2020 .
  29. "RGS2 regulador de la señalización de la proteína G 2 [ Homo sapiens (humano) ] - Gene - NCBI" . www.ncbi.nlm.nih.gov . Consultado el 2 de agosto de 2020 .
  30. "PSICQUIC View" . www.ebi.ac.uk. Consultado el 2 de agosto de 2020 .
  31. "ZFYVE27 dedo de zinc tipo FYVE que contiene 27 [ Homo sapiens (humano) ] - Gen - NCBI" . www.ncbi.nlm.nih.gov . Consultado el 2 de agosto de 2020 .
  32. Referencia GH. "Gen REEP6" . Genetics Home Reference . Consultado el 2 de agosto de 2020 .
  33. "InterPro" . www.ebi.ac.uk. Consultado el 2 de agosto de 2020 .
  34. Shin SM, Chung YJ, Oh ST, Jeon HM, Hwang LJ, Namkoong H, et al. (junio de 2006). "La molécula que interactúa con HCCR-1, "eliminada en la poliposis 1", desempeña un papel supresor de tumores en la carcinogénesis de colon" . Gastroenterology . 130 (7): 2074–86 . doi : 10.1053/j.gastro.2006.03.055 . PMID 16762630 .  
  35. Yao L, Xie D, Geng L, Shi D, Huang J, Wu Y, et al. (febrero de 2018). "REEP5 (proteína accesoria del receptor 5) actúa como un escultor de la membrana del retículo sarcoplásmico para modular la función cardíaca" . Journal of the American Heart Association . 7 (3) e007205. doi : 10.1161/JAHA.117.007205 . PMC 5850239. PMID 29431104 .   
  36. 1 2 Yang Z, Ma X, Wang Y, Wang J, Xiang B, Wu J, et al. (2012-09-01). "Asociación de polimorfismos de los genes APC y REEP5 con el trastorno depresivo mayor y la respuesta al tratamiento con antidepresivos en una población china Han". Psiquiatría del Hospital General . 34 (5): 571– 7. doi : 10.1016/j.genhosppsych.2012.05.015 . PMID 22795047 .  

Lecturas adicionales

  • Kinzler KW, Nilbert MC, Su LK, Vogelstein B, Bryan TM, Levy DB, et  al. (agosto de 1991). "Identificación de genes del locus FAP del cromosoma 5q21". Science . 253 (5020): 661– 5. Bibcode : 1991Sci...253..661K . doi : 10.1126/science.1651562 . PMID 1651562 . 
  • Nishisho I, Nakamura Y, Miyoshi Y, Miki Y, Ando H, Horii A, et  al. (agosto de 1991). "Mutaciones de genes del cromosoma 5q21 en pacientes con FAP y cáncer colorrectal". Science . 253 (5020): 665– 9. Bibcode : 1991Sci...253..665N . doi : 10.1126/science.1651563 . PMID 1651563 . 
  • Spirio L, Joslyn G, Nelson L, Leppert M, White R (noviembre de 1991). "Una repetición CA de 30 a 70 KB corriente abajo del gen de la poliposis adenomatosa del colon (APC)" . Nucleic Acids Research . 19 (22): 6348. doi : 10.1093/ nar /19.22.6348 . PMC 329171. PMID 1659692 .  
  • Joslyn G, Carlson M, Thliveris A, Albertsen H, Gelbert L, Samowitz W, et  al. (agosto de 1991). "Identificación de mutaciones por deleción y tres nuevos genes en el locus de la poliposis familiar". Cell . 66 ( 3): 601–13 . doi : 10.1016/0092-8674(81)90022-2 . PMID 1678319. S2CID 33965913 .  
  • Prieschl EE, Pendl GG, Harrer NE, Baumruker T (marzo de 1996). "El homólogo murino de TB2/DP1, un gen del locus de la poliposis adenomatosa familiar (PAF)". Gene . 169 (2): 215–8 . doi : 10.1016/0378-1119(95)00827-6 . PMID 8647449 . 
  • Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, Ota T, Nishikawa T, Yamashita R, et  al. (enero de 2006). " Diversificación de la modulación transcripcional: identificación y caracterización a gran escala de promotores alternativos putativos de genes humanos" . Genome Research . 16 (1): 55– 65. doi : 10.1101/gr.4039406 . PMC 1356129. PMID 16344560 .  
  • Shin SM, Chung YJ, Oh ST, Jeon HM, Hwang LJ, Namkoong H, et  al. (junio de 2006). "La molécula "deleted in polyposis 1", que interactúa con HCCR-1, desempeña un papel supresor de tumores en la carcinogénesis de colon" . Gastroenterology . 130 (7): 2074–86 . doi : 10.1053/j.gastro.2006.03.055 . PMID 16762630 .