Articulo de referencia

Radiogenómica

El término radiogenómica se utiliza en dos contextos: para referirse al estudio de la variación genética asociada con la respuesta a la radiación (genómica de la radiación) o pa...

El término radiogenómica se utiliza en dos contextos: para referirse al estudio de la variación genética asociada con la respuesta a la radiación (genómica de la radiación) o para referirse a la correlación entre las características de las imágenes de cáncer y la expresión genética (genómica de las imágenes).

Genómica de la radiación

En la genómica de la radiación, el término radiogenómica se utiliza para referirse al estudio de la variación genética asociada con la respuesta a la radioterapia . La variación genética, como los polimorfismos de un solo nucleótido , se estudia en relación con el riesgo de un paciente con cáncer de desarrollar toxicidad después de la radioterapia . [1] [2] [3] También se utiliza en el contexto del estudio de la genómica de la respuesta tumoral a la radioterapia . [4] [5]

El término radiogenómica fue acuñado en 2002 por Andreassen et al. (2002) [6] como analogía con la farmacogenómica , que estudia la variación genética asociada con las respuestas a los fármacos. Véase también West et al. (2005) [7] y Bentzen (2006). [8]

El Consorcio de Radiogenómica

En 2009, [9] [10] se creó un Consorcio de Radiogenómica (RGC) para facilitar y promover la colaboración multicéntrica de investigadores que vinculan las variantes genéticas con la respuesta a la radioterapia. El Consorcio de Radiogenómica (http://epi.grants.cancer.gov/radiogenomics/) es un Consorcio de Epidemiología del Cáncer respaldado por el Programa de Investigación de Epidemiología y Genética del Instituto Nacional del Cáncer de los Institutos Nacionales de Salud. [11] Los investigadores del RGC han completado numerosos estudios clínicos que identificaron variantes genéticas asociadas con toxicidades por radiación en pacientes con cáncer de próstata, mama, pulmón, cabeza y cuello, y otros cánceres.

Reuniones pasadas

  • 2009 - Manchester, Reino Unido. Se propone un consorcio.
  • 2010 - Nueva York, Estados Unidos.
  • 2011 - Londres, Reino Unido.
  • 2012 - Boston, Estados Unidos.
  • 2013 - Cambridge (también lanzamiento de REQUITE), Reino Unido.
  • 2014 - Heidelberg, Alemania.
  • 2015 - Montpellier, Francia.
  • 2016 - Maastricht, Países Bajos.
  • 2017 - Barcelona, ​​España.
  • 2018 - Manchester, Reino Unido.
  • 2019 - Rochester, Estados Unidos.
  • 2020 - En línea.
  • 2021 - En línea.
  • 2022 - Groningen, Países Bajos.
  • 2023 - Manchester, Reino Unido.

Genómica de imágenes[12]

Las imágenes radiológicas se utilizan para diagnosticar enfermedades a gran escala: las imágenes de tejidos se correlacionan con la patología tisular . La incorporación de datos genómicos, incluidos microarrays de ADN , miRNA y RNA-Seq, permite realizar nuevas correlaciones entre la genómica celular y las imágenes a escala tisular.

Véase también

Referencias

  1. ^ Barnett GC, Elliott RM, Alsner J, Andreassen CN, Abdelhay O, Burnet NG, Chang-Claude J, Coles CE, Gutiérrez-Enríquez S, Fuentes-Raspall MJ, Alonso-Muñoz MC, Kerns S, Raabe A, Symonds RP, Seibold P, Talbot CJ, Wenz F, Wilkinson J, Yarnold J, Dunning AM, Rosenstein BS, West CM, Bentzen SM (2012). "El metaanálisis de datos de pacientes individuales no muestra asociación entre el SNP rs1800469 en TGFB y la toxicidad tardía de la radioterapia". Radiother Oncol . 105 (3): 289–95. doi :10.1016/j.radonc.2012.10.017. PMC  3593101 . PMID  23199655.
  2. ^ Barnett GC, Coles CE, Elliott RM, Baynes C, Luccarini C, Conroy D, Wilkinson JS, Tyrer J, Misra V, Platte R, Gulliford SL, Sydes MR, Hall E, Bentzen SM, Dearnaley DP, Burnet NG, Pharoah PD, Dunning AM, West CM (2012). "Validación independiente de genes y polimorfismos que se ha informado que están asociados con la toxicidad de la radiación: un estudio de análisis prospectivo". Lancet Oncol . 13 (1): 65–77. doi : 10.1016/S1470-2045(11)70302-3 . PMID  22169268.
  3. ^ Talbot CJ, Tanteles GA, Barnett GC, Burnet NG, Chang-Claude J, Coles CE, Davidson S, Dunning AM, Mills J, Murray RJ, Popanda O, Seibold P, West CM, Yarnold JR, Symonds RP (2012). "Una asociación replicada entre polimorfismos cerca de TNFα y riesgo de reacciones adversas a la radioterapia". Br J Cancer . 107 (4): 748–53. doi :10.1038/bjc.2012.290. PMC 3419947 . PMID  22767148. 
  4. ^ Das, AK; Bell MH; Nirodi CS; Story MD; Minna JD (2010). "Radiogenómica que predice las respuestas tumorales a la radioterapia en el cáncer de pulmón". Sem Radiat Oncol . 20 (3): 149–55. doi :10.1016/j.semradonc.2010.01.002. PMC 2917342 . PMID  20685577. 
  5. ^ Yard, Brian D.; Adams, Drew J.; Chie, Eui Kyu; Tamayo, Pablo; Battaglia, Jessica S.; Gopal, Priyanka; Rogacki, Kevin; Pearson, Bradley E.; Phillips, James (25 de abril de 2016). "Una base genética para la variación en la vulnerabilidad del cáncer al daño del ADN". Nature Communications . 7 : 11428. Bibcode :2016NatCo...711428Y. doi :10.1038/ncomms11428. ISSN  2041-1723. PMC 4848553 . PMID  27109210. 
  6. ^ Andreassen, CN; Alsner J; Overgaard J (2002). "¿Tiene la variabilidad en las reacciones de los tejidos normales después de la radioterapia una base genética? ¿Dónde y cómo buscarla?". Radiother Oncol . 64 (2): 131–40. doi :10.1016/s0167-8140(02)00154-8. PMID  12242122.
  7. ^ West CM, McKay MJ, Hölscher T, Baumann M, Stratford IJ, Bristow RG, Iwakawa M, Imai T, Zingde SM, Anscher MS, Bourhis J, Begg AC, Haustermans K, Bentzen SM, Hendry JH (2005). "Marcadores moleculares que predicen la respuesta a la radioterapia: informe y recomendaciones de una reunión técnica de la Agencia Internacional de Energía Atómica". Int J Radiat Oncol Biol Phys . 62 (5): 1264–73. doi :10.1016/j.ijrobp.2005.05.001. PMID  16029781.
  8. ^ Bentzen, SM (2006). "Prevención o reducción de los efectos secundarios tardíos de la radioterapia: la radiobiología se encuentra con la patología molecular". Nat Rev Cancer . 6 (9): 702–13. doi :10.1038/nrc1950. PMID  16929324. S2CID  1190053.
  9. ^ West C, Rosenstein BS, Alsner J, Azria D, Barnett G, Begg A, Bentzen S, Burnet N, Chang-Claude J, Chuang E, Coles C, De Ruyck K, De Ruysscher D, Dunning A, Elliott R, Fachal L, Hall J, Haustermans K, Herskind C, Hoelscher T, Imai T, Iwakawa M, Jones D, Kulich C, EQUAL-ESTRO, Langendijk JH, O'Neils P, Ozsahin M, Parliament M, Polanski A, Rosenstein B, Seminara D, Symonds P, Talbot C, Thierens H, Vega A, West C, Yarnold J (2010). "Establecimiento de un consorcio de radiogenómica". Revista internacional de oncología radioterápica, biología y física . 76 (5): 1295–1296. doi :10.1016/j.ijrobp.2009.12.017.PMID 20338472  .
  10. ^ West, C; Rosenstein BS (2010). "Establecimiento de un consorcio de radiogenómica". Radiother Oncol . 94 (1): 117–8. doi :10.1016/j.radonc.2009.12.007. PMID  20074824.
  11. ^ "Instituto Nacional del Cáncer de Salud - Programa de Investigación en Epidemiología y Genómica".
  12. ^ Radiómica

Lectura adicional

  • https://epi.grants.cancer.gov/radiogenomics/
  • Kerns, Sarah L.; Dorling, Leila; Fachal, Laura; Bentzen, Søren; Pharoah, Paul DP; Barnes, Daniel R.; Gómez-Caamaño, Antonio; Carballo, Ana M.; Dearnaley, David P.; Peleteiro, Paula; Gulliford, Sarah L.; Hall, Emma; Michailidou, Kyriaki; Carracedo, Ángel; Sia, Michael; Stock, Richard; Stone, Nelson N.; Sydes, Matthew R.; Tyrer, Jonathan P.; Ahmed, Shahana; Parliament, Matthew; Ostrer, Harry; Rosenstein, Barry S.; Vega, Ana; Burnet, Neil G.; Dunning, Alison M.; Barnett, Gillian C.; West, Catharine ML; Radiogenomics, Consortium. (Agosto de 2016). "Metaanálisis de estudios de asociación de todo el genoma identifica marcadores genéticos de toxicidad tardía tras radioterapia para cáncer de próstata". eBioMedicina . 10 : 150–163. doi :10.1016/j.ebiom.2016.07.022. PMC  5036513 . PMID  27515689.
  • Zinn, Pascal O.; Sathyan, Pratheesh; Mahajan, Bhanu; Bruyere, John; Hegi, Monika; Majumder, Sadhan; Colen, Rivka R. (2012). Lesniak, Maciej S (ed.). "Una nueva clasificación de glioblastoma por volumen-edad-KPS (VAK) identifica una firma pronóstica de microARN-gen cognado". PLOS ONE . ​​7 (8): e41522. Bibcode :2012PLoSO...741522Z. doi : 10.1371/journal.pone.0041522 . PMC  3411674 . PMID  22870228.
  • Segal, Eran; Sirlin, Claude B; Ooi, Clara; Adler, Adam S; Gollub, Jeremy; Chen, Xin; Chan, Bryan K; Matcuk, George R; et al. (2007). "Descodificación de programas globales de expresión génica en cáncer de hígado mediante imágenes no invasivas". Nature Biotechnology . 25 (6): 675–80. doi :10.1038/nbt1306. PMID  17515910. S2CID  10499664.
  • Andreassen CN, Barnett GC, Langendijk JA, Alsner J, De Ruysscher D, Krause M, Bentzen SM, Haviland JS, Griffin C, Poortmans P, Yarnold JR (2012). "Realización de investigaciones radiogenómicas: no olvide tener en cuenta cuidadosamente los datos clínicos". Radiother Oncol . 105 (3): 337–40. doi :10.1016/j.radonc.2012.11.004. PMID  23245646.
  • West, CM; Barnett GC (2011). "Genética y genómica de la toxicidad de la radioterapia: hacia la predicción". Genome Med . 3 (8): 52. doi : 10.1186/gm268 . PMC  3238178 . PMID  21861849.
  • Oh, JH; Kerns, S; Ostrer, H; Powell, SN; Rosenstein, B; Deasy, JO (2017). "Métodos computacionales que utilizan estudios de asociación de todo el genoma para predecir complicaciones de radioterapia e identificar procesos moleculares correlativos". Sci Rep . 7 : 43381. Bibcode :2017NatSR...743381O. doi :10.1038/srep43381. PMC  5324069 . PMID  28233873.
  • Hall, William A.; Bergom, Carmen; Thompson, Reid F.; Baschnagel, Andrew M.; Vijayakumar, Srinivasan; Willers, Henning; Li, X. Allen; Schultz, Christopher J.; Wilson, George D.; West, Catharine ML; Capala, Jacek; Coleman, C. Norman; Torres-Roca, Javier F.; Weidhaas, Joanne; Feng, Felix Y. (junio de 2018). "Oncología de precisión y radioterapia guiada genómicamente: un informe de la Conferencia sobre medicina de precisión de la Sociedad Estadounidense de Oncología Radioterapéutica/Asociación Estadounidense de Físicos en Medicina/Instituto Nacional del Cáncer". Revista internacional de oncología radioterapéutica, biología y física . 101 (2): 274–284. doi :10.1016/j.ijrobp.2017.05.044. PMID  28964588.
  • Lee, S; Kerns, S; Ostrer, H; Rosenstein, B; Deasy, JO; Oh, JH (2018). "Aprendizaje automático en un estudio de asociación de todo el genoma para predecir la toxicidad genitourinaria tardía después de la radioterapia de próstata". Int J Radiat Oncol Biol Phys . 101 (1): 128–135. doi :10.1016/j.ijrobp.2018.01.054. PMC  5886789 . PMID  29502932.
  • Johnson, K; Chang-Claude, J; Critchley, AM; Kyriacou, C; Lavers, S; Rattay, T; Seibold, P; Webb, A; West, C; Symonds, RP; Talbot, CJ; Consortium, Requite (enero de 2019). "Las variantes genéticas predicen el momento óptimo de la radioterapia para reducir los efectos secundarios en pacientes con cáncer de mama". Clin Oncol (R Coll Radiol) . 31 (1): 9–16. doi : 10.1016/j.clon.2018.10.001 . hdl : 2381/43295 . PMID:  30389261.
  • Mbah, C; De Ruyck, K; De Schrijver, S.; De Sutter, C.; Schiettecatte, K.; Monten, C.; Paelinck, L.; De Neve, W.; Thierens, H.; West, C.; Amorim, G.; Thas, O.; Veldeman, L. (2018). "Un nuevo enfoque para modelar la radiosensibilidad general del paciente y predecir múltiples puntos finales de toxicidad para pacientes con cáncer de mama". Acta Oncologica . 57 (5): 604–12. doi : 10.1080/0284186X.2017.1417633 . PMID  29299946.
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