Articulo de referencia

Randy Lee

Randy John Read [9] (nacido el 9 de junio de 1957) [4] es investigador principal del Wellcome Trust y profesor de cristalografía de proteínas en la Universidad de Cambridge . [1...

Randy John Read [9] (nacido el 9 de junio de 1957) [4] es investigador principal del Wellcome Trust y profesor de cristalografía de proteínas en la Universidad de Cambridge . [1] [10] [11] [12]

Educación

Read estudió en la Universidad de Alberta en Edmonton, Canadá, donde obtuvo una licenciatura en Ciencias en 1979, seguida de un doctorado en 1986 [4] por cristalografía de rayos X de serina proteasas y sus inhibidores proteicos, supervisado por Michael NG James . [2] [3]

Carrera e investigación

Después de su doctorado, Read fue nombrado profesor asistente de 1988 a 1993 y profesor asociado de 1993 a 1998 en la Universidad de Alberta. [4] A partir de 2017 [actualizar], los intereses de investigación de Read son la cristalografía de proteínas y la estimación de máxima verosimilitud . [1] Su investigación ha sido publicada en importantes revistas científicas revisadas por pares , incluidas Nature , [13] [14] [15] Science , [16] Journal of Applied Crystallography [5] Acta Crystallographica , [7] [17] [18] Structure , [19] [20] PNAS , [21] Journal of Molecular Biology [22] [23] y Journal of Clinical Endocrinology and Metabolism . [24]

Premios y honores

Read fue elegido miembro de la Royal Society (FRS) en 2014. Su nominación dice:

El profesor Read es conocido internacionalmente por sus contribuciones sobresalientes y fundamentales al desarrollo de software de cristalografía macromolecular . Su aplicación de algoritmos basados ​​en máxima verosimilitud para la solución de estructuras cristalinas macromoleculares mediante reemplazo molecular (una técnica que utiliza una estructura conocida de un homólogo para resolver una estructura desconocida) ha dado como resultado un software (Phaser) que es líder en el campo. También ideó y demostró una función objetivo de verosimilitud mejorada para el refinamiento de modelos que ha sido adoptada por todos los principales programas de refinamiento. Además, el profesor Read ha dirigido trabajos estructurales que han hecho contribuciones significativas a la comprensión de los mecanismos de las proteínas relevantes para las enfermedades ( toxinas bacterianas y serpinas ). [9]

Referencias

  1. ^ abc Randy Leer publicaciones indexadas por Google Scholar
  2. ^ ab Fujinaga, Masao; Sielecki, Anita R.; Read, Randy J.; Ardelt, Wojciech; Laskowski, Michael; James, Michael NG (1987). "Estructuras cristalinas y moleculares del complejo de α-quimotripsina con su inhibidor, el tercer dominio ovomucoide de Turquía, a una resolución de 1,8 Å". Revista de Biología Molecular . 195 (2): 397–418. doi :10.1016/0022-2836(87)90659-0. ISSN  0022-2836. PMID  3477645.
  3. ^ ab Read, Randy John (1986). Estudios cristalográficos de rayos X sobre serina proteinasas y sus inhibidores proteicos (tesis doctoral). doi :10.7939/R33776175. hdl :10402/era.3098. ProQuest  250072156.
  4. ^ abcd Anónimo (2014). "Lea, profesor Randy John" . Who's Who (edición en línea de Oxford University Press  ). A & C Black. doi :10.1093/ww/9780199540884.013.43034. (Se requiere suscripción o membresía a una biblioteca pública del Reino Unido).
  5. ^ ab McCoy, AJ; Grosse-Kunstleve, RW; Adams, PD; Winn, MD; Storoni, LC; Read, RJ (2007). "Software cristalográfico Phaser". Revista de cristalografía aplicada . 40 (4): 658–674. Bibcode :2007JApCr..40..658M. CiteSeerX 10.1.1.322.8550 . doi :10.1107/S0021889807021206. PMC 2483472 . PMID  19461840.  
  6. ^ Adams, PD; Grosse-Kunstleve, RW; Hung, LW; Ioerger, TR; McCoy, AJ; Moriarty, NW; Read, RJ; Sacchettini, JC; Sauter, NK; Terwilliger, TC (2002). "PHENIX: Creación de un nuevo software para la determinación automatizada de la estructura cristalográfica". Acta Crystallographica Sección D . 58 (11): 1948–1954. Bibcode :2002AcCrD..58.1948A. doi : 10.1107/S0907444902016657 . hdl : 1969.1/180215 . PMID  12393927.
  7. ^ ab Adams, PD; Afonine, PV; Bunkóczi, GB; Chen, VB; Davis, IW; Echols, N.; Headd, JJ; Hung, LW; Kapral, GJ; Grosse-Kunstleve, RW; McCoy, AJ; Moriarty, NW; Oeffner, R.; Read, RJ; Richardson, DC; Richardson, JS; Terwilliger, TC; Zwart, PH (2010). "PHENIX: Un sistema integral basado en Python para la solución de la estructura macromolecular". Acta Crystallographica Sección D . 66 (2): 213–21. Código Bibliográfico :2010AcCrD..66..213A. doi :10.1107/S0907444909052925. PMC 2815670 . Número de modelo:  PMID20124702. 
  8. ^ Liebschner, Dorothee; Afonine, Pavel V.; Baker, Matthew L.; Bunkóczi, Gábor; Chen, Vincent B.; Croll, Tristan I.; Hintze, Bradley; Hung, Li-Wei; Jain, Swati; McCoy, Airlie J.; Moriarty, Nigel W.; Oeffner, Robert D.; Poon, Billy K.; Prisant, Michael G.; Read, Randy J. (1 de octubre de 2019). "Determinación de la estructura macromolecular utilizando rayos X, neutrones y electrones: desarrollos recientes en Phenix". Acta Crystallographica Sección D: Biología estructural . 75 (10): 861–877. Código Bibliográfico :2019AcCrD..75..861L. doi :10.1107/S2059798319011471. Revista de  Biología Molecular y Genética  . 
  9. ^ ab Anon (2014). "Profesor Randy Read FRS". Londres: royalsociety.org. Archivado desde el original el 5 de agosto de 2014.
  10. ^ Randy Lee publicaciones indexadas en la base de datos bibliográfica Scopus . (requiere suscripción)
  11. ^ Read, Randy (2017). «Randy Read's Homepage». Universidad de Cambridge. Archivado desde el original el 15 de mayo de 2013. [ enlace muerto ]
  12. ^ Randy Leer publicaciones de Europa PubMed Central
  13. ^ Zhou, A.; Carrell, RW; Murphy, MP; Wei, Z.; Yan, Y.; Stanley, PLD; Stein, PE; Pipkin, FB; Read, RJ (2010). "Un interruptor redox en el angiotensinógeno modula la liberación de angiotensina". Nature . 468 (7320): 108–11. Bibcode :2010Natur.468..108Z. doi :10.1038/nature09505. PMC 3024006 . PMID  20927107. 
  14. ^ Dimaio, F.; Terwilliger, TC; Read, RJ; Wlodawer, A.; Oberdorfer, G.; Wagner, U.; Valkov, E.; Alon, A.; Fass, D.; Axelrod, HL; Das, D.; Vorobiev, SM; Iwaï, H.; Pokkuluri, PR; Baker, D. (2011). "Reemplazo molecular mejorado mediante optimización de la estructura proteica guiada por la densidad y la energía". Nature . 473 (7348): 540–3. Bibcode :2011Natur.473..540D. doi :10.1038/nature09964. PMC 3365536 . PMID  21532589. 
  15. ^ Qian, B.; Raman, S.; Das, R.; Bradley, P.; McCoy, AJ; Read, RJ; Baker, D. (2007). "Predicción de la estructura de alta resolución y el problema de la fase cristalográfica". Nature . 450 (7167): 259–64. Bibcode :2007Natur.450..259Q. doi :10.1038/nature06249. PMC 2504711 . PMID  17934447. 
  16. ^ Jackson, enfermera registrada; Dorado, SM; Van Erp, PB; Carter, J; Westra, ER; Brouns, SJ; Van Der Oost, J; Terwilliger, TC; Leer, RJ; Wiedenheft, B (2014). "Biología estructural. Estructura cristalina del complejo de vigilancia guiado por ARN CRISPR de Escherichia coli". Ciencia . 345 (6203): 1473–9. doi : 10.1126/ciencia.1256328. PMC 4188430 . PMID  25103409. 
  17. ^ Brünger, AT; Adams, PD; Clore, GM; Delano, WL; Gros, P.; Grosse-Kunstleve, RW; Jiang, JS; Kuszewski, J.; Nilges, M.; Pannu, NS; Read, RJ; Rice, LM; Simonson, T.; Warren, GL (1998). "Sistema de cristalografía y RMN: un nuevo paquete de software para la determinación de la estructura macromolecular". Acta Crystallographica Sección D . 54 (5): 905–21. Bibcode :1998AcCrD..54..905B. doi :10.1107/S0907444998003254. PMID  9757107. S2CID  33910776.
  18. ^ Read, RJ; Kleywegt, GJ (2009). "Validación de estructura controlada por caso". Acta Crystallographica Sección D . 65 (Pt 2): 140–7. Bibcode :2009AcCrD..65..140R. doi :10.1107/S0907444908041085. PMC 2631636 . PMID  19171969. 
  19. ^ Read, RJ; Adams, PD; Arendall Wb, 3rd; Brunger, AT; Emsley, P; Joosten, RP; Kleywegt, GJ; Krissinel, EB; Lütteke, T; Otwinowski, Z; Perrakis, A; Richardson, JS; Sheffler, WH; Smith, JL; Tickle, IJ; Vriend, G; Zwart, PH (2011). "Una nueva generación de herramientas de validación cristalográfica para el banco de datos de proteínas". Estructura . 19 (10): 1395–412. doi :10.1016/j.str.2011.08.006. PMC 3195755 . PMID  22000512. {{cite journal}}: CS1 maint: nombres numéricos: lista de autores ( enlace )
  20. ^ Kleywegt, GJ ; Read, RJ (1997). "No es tu densidad promedio". Estructura . 5 (12): 1557–69. doi : 10.1016/s0969-2126(97)00305-5 . PMID  9438862.
  21. ^ Deane, JE; Graham, SC; Kim, NN; Stein, PE; McNair, R; Cachón-González, MB; Cox, TM; Read, RJ (2011). "Información sobre la enfermedad de Krabbe a partir de las estructuras de la galactocerebrosidasa". Actas de la Academia Nacional de Ciencias . 108 (37): 15169–73. doi : 10.1073/pnas.1105639108 . PMC 3174575 . PMID  21876145. 
  22. ^ Zhou, A; Wei, Z; Stanley, PL; Read, RJ; Stein, PE; Carrell, RW (2008). "La transición de S a R de la globulina transportadora de corticosteroides y el mecanismo de liberación de hormonas". Journal of Molecular Biology . 380 (1): 244–51. doi : 10.1016/j.jmb.2008.05.012 . PMID  18513745.
  23. ^ Stoop, AA; Eldering, E; Dafforn, TR; Read, RJ; Pannekoek, H (2001). "Diferentes requisitos estructurales para el inhibidor del activador del plasminógeno 1 (PAI-1) durante la transición de latencia y la inhibición de la proteinasa como lo evidencian las bibliotecas hipermutadas de PAI-1 mostradas en fagos". Journal of Molecular Biology . 305 (4): 773–83. doi :10.1006/jmbi.2000.4356. PMID  11162091. Archivado desde el original el 6 de mayo de 2022 . Consultado el 6 de mayo de 2022 .
  24. ^ Chan, WL; Carrell, RW; Zhou, A; Read, RJ (2013). "Cómo los cambios en la afinidad de la globulina transportadora de corticosteroides modulan la concentración de cortisol libre". The Journal of Clinical Endocrinology & Metabolism . 98 (8): 3315–22. doi :10.1210/jc.2012-4280. PMC 3813945 . PMID  23783094. 
Recuperado de "https://es.wikipedia.org/w/index.php?title=Randy_Read&oldid=1245485593"