Hispanopedia WikiRasMol es un programa informático escrito para la visualización de gráficos moleculares destinado y utilizado principalmente para representar y explorar estructuras de macromoléculas biológicas , como las que se encuentran en el Banco de Datos de Proteínas (PDB).
Historia
Fue desarrollado originalmente por Roger Sayle a principios de la década de 1990. [1]
Históricamente, fue una herramienta importante para los biólogos moleculares, ya que el programa extremadamente optimizado permitió que el software se ejecutara en computadoras personales (en ese entonces) modestamente potentes . Antes de RasMol, el software de visualización se ejecutaba en estaciones de trabajo gráficas que, debido a su costo, eran menos accesibles para los académicos. RasMol continúa siendo importante para la investigación en biología estructural y ha adquirido importancia en la educación.
RasMol tiene un historial de versiones de licencias complejo . A partir de la serie de versiones 2.7, [2] el código fuente de RasMol tiene una licencia dual bajo una Licencia Pública General GNU (GPL) o una licencia personalizada RASLIC . [3] A partir de la versión 2.7.5, la GPL es la única licencia válida para distribuciones binarias.
RasMol incluye un lenguaje de scripting , para realizar muchas funciones como seleccionar ciertas cadenas de proteínas , cambiar colores, etc. El software Jmol y Sirius han incorporado este lenguaje en sus comandos.
Los archivos del Banco de Datos de Proteínas (PDB) se pueden descargar para su visualización desde los miembros del Banco Mundial de Datos de Proteínas (wwPDB). Estos archivos han sido cargados por investigadores que han caracterizado la estructura de las moléculas , generalmente mediante cristalografía de rayos X , espectroscopia de RMN de proteínas o microscopía electrónica criogénica .
Comunicación entre procesos
Rasmol puede comunicarse con otros programas a través de Tcl / Tk en plataformas Unix y a través del intercambio dinámico de datos (DDE) en Microsoft Windows .
Con un programa de alineación de secuencias múltiples , la clase Java responsable se puede utilizar libremente en otras aplicaciones. [4]
Véase también
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- Lista de sistemas de gráficos moleculares
- Comparación de software para modelado de mecánica molecular
- Gráficos moleculares
- Editor de moléculas
- Lista de paquetes de software libre y de código abierto
Referencias
- ^ Roger Sayle y E. James Milner-White. "RasMol: gráficos biomoleculares para todos", Trends in Biochemical Sciences (TIBS), septiembre de 1995, vol. 20, n.º 9, pág. 374
- ^ Herbert J. Bernstein, "Cambios recientes en RasMol, recombinación de variantes", Trends in Biochemical Sciences (TIBS), septiembre de 2000, vol. 25, n.º 9, págs. 453-455
- ^ Licencia RASLIC
- ^ Programa de alineación múltiple
Enlaces externos
- Sitio web oficial
- Descargar RasMol (versiones de producción)
- Repositorio de origen (estable)
- Repositorio de código fuente (desarrollo)
- Temprano
- Más tarde