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5'-3' exorribonucleasa 2

La exorribonucleasa 2 5'-3' (XRN2), también conocida como proteína similar a Dhm1, es una enzima exorribonucleasa que en humanos está codificada por el gen XRN2 . [ 5 ] El gen h...

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La exorribonucleasa 2 5'-3' (XRN2), también conocida como proteína similar a Dhm1, es una enzima exorribonucleasa que en humanos está codificada por el gen XRN2 . [ 5 ]

El gen humano que codifica XRN2 comparte similitud con el gen Dhm1 del ratón y los genes Dhp1 ( Schizosaccharomyces pombe ) o RAT1 ( Saccharomyces ) de la levadura. El gen de la levadura está involucrado en la recombinación homóloga y el metabolismo del ARN , como la síntesis, el transporte y la terminación del ARN. [ 6 ] Los estudios de complementación muestran que Dhm1 tiene una función similar en el ratón a la de Dhp1.

Función

El gen humano XRN2 está involucrado en el modelo de torpedo de terminación de la transcripción. [ 7 ]

El homólogo de C. elegans , XRN-2, está involucrado en la degradación de ciertos miRNAs maduros y su desprendimiento de los miRNAs de miRISC . [ 8 ]

En levaduras, se ha demostrado que la proteína Rat1 también participa en el modelo de terminación de la transcripción tipo torpedo. Cuando se detecta un sitio de poliadenilación en el ARN naciente y este escindido por la ARN polimerasa II , el factor Rtt103 recluta a Rat1 y lo une al extremo libre. La actividad exonucleasa de Rat1 degrada la cadena de ARN y detiene la transcripción al alcanzar a la polimerasa. [ 6 ]

Véase también

Referencias

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000088930 – Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000027433 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. ↑ Zhang M, Yu L, Xin Y, Hu P, Fu Q, Yu C, Zhao S (julio de 1999). "Clonación y mapeo del gen XRN2 en el cromosoma humano 20p11.1-p11.2". Genomics . 59 (2): 252–4 . doi : 10.1006/geno.1999.5866 . PMID 10409438 . 
  6. 1 2 David Tollervey (noviembre de 2004). "Terminación por torpedo". Nature . 432 (7016): 456– 457. doi : 10.1038/432456a . PMID 15565140. S2CID 6823163 .  
  7. ↑ West S, Gromak N, Proudfoot NJ (noviembre de 2004). "La exonucleasa humana 5' --> 3' Xrn2 promueve la terminación de la transcripción en sitios de escisión cotranscripcional" . Nature . 432 ( 7016): 522–5 . Bibcode : 2004Natur.432..522W . doi : 10.1038/nature03035 . PMID 15565158. S2CID 4365304 .  
  8. ↑ Chatterjee S, Grosshans H (septiembre de 2009). "El recambio activo modula la actividad de los microARN maduros en Caenorhabditis elegans". Nature . 461 (7263): 546– 9. Bibcode : 2009Natur.461..546C . doi : 10.1038/nature08349 . PMID 19734881. S2CID 4414841 .  

Lecturas adicionales

  • Lehner B, Sanderson CM (2004). " Un marco de interacción de proteínas para la degradación del ARNm humano" . Genome Res . 14 (7): 1315–23 . doi : 10.1101/gr.2122004 . PMC 442147. PMID 15231747 .  
  • Deloukas P, Matthews LH, Ashurst J, et  al. (2001). "La secuencia de ADN y el análisis comparativo del cromosoma 20 humano" . Nature . 414 (6866): 865– 71. Bibcode : 2001Natur.414..865D . doi : 10.1038/414865a . PMID 11780052 . 
  • Beausoleil SA, Villén J, Gerber SA, et  al. (2006). "Un enfoque basado en probabilidades para el análisis de fosforilación de proteínas de alto rendimiento y la localización de sitios". Nat . Biotechnol . 24 (10): 1285– 92. doi : 10.1038/nbt1240 . PMID 16964243. S2CID 14294292 .  
  • Lu Y, Liu P, James M, et  al. (2010). "Las variantes genéticas que regulan en cis la expresión de Xrn2 contribuyen al riesgo de tumores pulmonares espontáneos" . Oncogene . 29 (7): 1041– 9. doi : 10.1038/onc.2009.396 . PMC 6019621. PMID 19915612 .  
  • Lejeune F, Li X, Maquat LE (2003). "La degradación de ARNm mediada por codones de terminación prematura en células de mamíferos implica actividades de descapuchamiento, desadenilación y exonucleolíticas" . Mol. Cell . 12 (3): 675–87 . doi : 10.1016/S1097-2765(03)00349-6 . PMID 14527413 . 
  • Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, et  al. (2001). "Hacia un catálogo de genes y proteínas humanas: secuenciación y análisis de 500 nuevos cDNA humanos completos que codifican proteínas" . Genome Res . 11 (3): 422–35 . doi : 10.1101/gr.GR1547R . PMC 311072. PMID 11230166 .  
  • Yang XC, Sullivan KD, Marzluff WF, Dominski Z (2009). "Estudios de las actividades exonucleasa y endonucleasa 5' de CPSF-73 en el procesamiento del pre-ARNm de histonas" . Mol . Cell. Biol . 29 (1): 31– 42. doi : 10.1128/MCB.00776-08 . PMC 2612496. PMID 18955505 .  
  • Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, et  al. (2006). "Dinámica de fosforilación global, in vivo y específica del sitio en redes de señalización" . Cell . 127 ( 3): 635– 48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. S2CID 7827573 .  
  • Scherl A, Couté Y, Déon C, et al .  (2002). "Análisis proteómico funcional del nucléolo humano" . Mol. Biol. Cell . 13 (11): 4100– 9. doi : 10.1091/mbc.E02-05-0271 . PMC 133617. PMID 12429849 .  
  • Kaneko S, Rozenblatt-Rosen O, Meyerson M, Manley JL (2007). "La proteína multifuncional p54nrb/PSF recluta la exonucleasa XRN2 para facilitar el procesamiento 3' del pre-ARNm y la terminación de la transcripción" . Genes Dev . 21 (14): 1779–89 . doi : 10.1101/gad.1565207 . PMC 1920172. PMID 17639083 .  
  • Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et  al. (2004). "Estado, calidad y expansión del proyecto de ADNc de longitud completa de los NIH: la Colección de Genes de Mamíferos (MGC)" . Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928. PMID 15489334 .  
  • Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et  al. (2004). "Secuenciación completa y caracterización de 21.243 cDNA humanos de longitud completa" . Nat. Genet . 36 (1): 40– 5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 . 
  • Gromak N, West S, Proudfoot NJ (2006). " Los sitios de pausa promueven la terminación transcripcional de la ARN polimerasa II de mamíferos" . Mol. Cell. Biol . 26 (10): 3986– 96. doi : 10.1128/MCB.26.10.3986-3996.2006 . PMC 1488997. PMID 16648491 .  
  • Andersen JS, Lam YW, Leung AK, et  al. (2005). "Dinámica del proteoma nucleolar". Nature . 433 ( 7021): 77– 83. Bibcode : 2005Natur.433...77A . doi : 10.1038/nature03207 . PMID 15635413. S2CID 4344740 .  
  • Li J, Zheng H, Ji C, et  al. (2005). "Una nueva variante de empalme del gen humano XRN2 se expresa principalmente en leucocitos sanguíneos". DNA Seq . 16 (2): 143– 6. doi : 10.1080/10425170500066771 . PMID 16147866. S2CID 35865401 .  
  • Equipo del Programa de Colección de Genes de Mamíferos, Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et  al. (2002). "Generación y análisis inicial de más de 15.000 secuencias de ADNc humanas y de ratón de longitud completa" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias . 99 (26): 16899– 16903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/ pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .  
  • Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, et  al. (2004). "Caracterización a gran escala de las fosfoproteínas nucleares de células HeLa" . Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 101 (33): 12130– 5. Bibcode : 2004PNAS..10112130B . doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC 514446. PMID 15302935 .  

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