Secuencias de señal de recombinación

Las secuencias señal de recombinación son secuencias conservadas de ADN no codificante que son reconocidas por el complejo enzimático RAG1/RAG2 durante la recombinación V(D)J en células B y T inmaduras . ^{[ 1 ]} Las secuencias señal de recombinación guían al complejo enzimático hacia los segmentos génicos V, D y J que se recombinarán durante la formación de las regiones variables de cadena pesada y ligera en los receptores de células T y las moléculas de inmunoglobulina . ^{[ 1 ]}

Las RSS están compuestas por secuencias heptaméricas altamente conservadas (7 pares de bases), secuencias espaciadoras y secuencias nonaméricas conservadas (9 pares de bases) que son adyacentes a las secuencias V, D y J en la región de la cadena pesada del ADN y a las secuencias V y J en la región de la cadena ligera del ADN. ^{[ 1 ] [ 2 ]} Las secuencias espaciadoras se encuentran entre las secuencias heptaméricas y nonaméricas y presentan variedad de pares de bases, pero siempre tienen 12 o 23 pares de bases de longitud. ^{[ 3 ]} Las secuencias heptaméricas suelen ser CACAGTGy las nonaméricas suelen ser . Los nucleótidos en negrita están más altamente conservados. ^{[ 3 ]} El complejo enzimático RAG1/RAG2 sigue la regla 12-23 al unir los segmentos V, D y J, emparejando RSS espaciadoras de 12 pb con RSS espaciadoras de 23 pb. ^{[ 1 ] [ 2 ]} Esto impide que dos genes diferentes que codifican la misma región se recombinen (ej. recombinación VV). ^{[ 1 ]} Los RSS se encuentran entre los segmentos V, D y J del ADN de la línea germinal de los linfocitos B y T en maduración y se eliminan permanentemente del producto final de ARNm de Ig una vez completada la recombinación V(D)J. ^{[ 1 ]}ACAAAAACC

El complejo enzimático RAG1/RAG2 reconoce las secuencias heptaméricas que flanquean las regiones codificantes V y J y corta su extremo 5', liberando el ADN intermedio entre las regiones codificantes V y J. ^{[ 1 ]} En la región codificante de la cadena pesada del ADN, el complejo enzimático RAG1/RAG2 reconoce las RSS que flanquean los segmentos D y J y las une, formando un bucle que contiene ADN intermedio. ^{[ 1 ] [ 4 ]} El complejo RAG1/RAG2 introduce entonces un corte en el extremo 5' de los heptámeros RSS adyacentes a las regiones codificantes en ambos segmentos D y J, eliminando permanentemente el bucle de ADN intermedio y creando una rotura de doble cadena que es reparada por las enzimas recombinasas VDJ. ^{[ 1 ] [ 4 ]} Este proceso se repite para la unión de V a DJ. ^{[ 1 ]} En el reordenamiento de la cadena ligera, solo se unen los segmentos V y J. ^{[ 1 ]}