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Articulo de referencia

Hifomicrobianos

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Los Hyphomicrobiales (sinónimo Rhizobiales ) son un orden de alfaproteobacterias Gram negativas .

Las rizobias , que fijan nitrógeno y son simbióticas con las raíces de las plantas, aparecen en varias familias diferentes. Las cuatro familias Nitrobacteraceae , Hyphomicrobiaceae , Phyllobacteriaceae y Rhizobiaceae contienen al menos varios géneros de bacterias microsimbióticas fijadoras de nitrógeno y noduladoras de leguminosas . Ejemplos de ello son los géneros Bradyrhizobium y Rhizobium . Las especies de Methylocystaceae son metanótrofas ; utilizan metanol (CH₃OH ) o metano (CH₄ ) como sus únicas fuentes de energía y carbono. Otros géneros importantes son los patógenos humanos Bartonella y Brucella , así como Agrobacterium , una herramienta importante en ingeniería genética .

Taxonomía

Familias aceptadas

géneros no asignados

El siguiente género no ha sido asignado a ninguna familia:

taxones provisionales

Estos taxones han sido publicados, pero no han sido validados según el Código Bacteriológico :

  • " Nordella " La Scola et al . 2004 [ 4 ]
  • " Propylenellaceae " Liu et al . 2021 [ 5 ]
    • " Propylenella " Liu et al . 2021 [ 5 ]
      • " Propylenella binzhouense " Liu et al . 2021 [ 5 ]
  • " Thermopetrobacter " Sislak 2013 [ 6 ]

Filogenia

La taxonomía actualmente aceptada se basa en la Lista de nombres procariotas con estatus en la nomenclatura [ 7 ] y la filogenia se basa en secuencias de genoma completo. [ 2 ] [ a ]

transformación genética natural

Se ha informado de la transformación genética natural en al menos cuatro especies de Hyphomicrobiales : Agrobacterium tumefaciens , [ 8 ] Methylobacterium organophilum , [ 9 ] Ensifer adhaerens , [ 10 ] y Bradyrhizobium japonicum . [ 11 ] La transformación genética natural es un proceso sexual que implica la transferencia de ADN de una célula bacteriana a otra a través del medio intermedio, y la integración de la secuencia donante en el genoma receptor por recombinación homóloga .

Véase también

Notas

  1. ↑ Aestuariivirgaceae , Alsobacteraceae , Ancalomicrobiaceae , Lichenibacteriaceae , Lichenihabitantaceae , Rhabdaerophilaceae y Segnochrobactraceae no están incluidas en este árbol filogenético.
  2. ↑ Phyllobacterium es distinto del resto de Phyllobacteriaceae .
  3. ↑ Prosthecomicrobium es distinto del resto de Hyphomicrobiaceae .

Referencias

  1. ↑ Parker CT, Garrity GM (1 de enero de 2003). Parker CT, Garrity GM (eds.). "Resumen taxonómico para las familias: Mabikibacteraceae ". Resúmenes de NamesforLife . NamesforLife, LLC. doi : 10.1601/tx.30673 .
  2. 1 2 Hördt A, López MG, Meier-Kolthoff JP, Schleuning M, Weinhold LM, Tindall BJ, et al. (2020). " El análisis de más de 1000 genomas de cepas tipo mejora sustancialmente la clasificación taxonómica de las alfaproteobacterias " . Frontiers in Microbiology . 11 : 468. doi : 10.3389/fmicb.2020.00468 . PMC 7179689. PMID 32373076 .   
  3. ↑ Dong L, Han MX, Wang D, Liu F, Asem MD, Jiao JY, Xiao M, Salam N, Li WJ (2019). " Flaviflagellibacter deserti gen. nov., sp. nov., un nuevo miembro del orden Rhizobiales aislado de un suelo desértico". Antonie van Leeuwenhoek . 112 (6): 947– 954. doi : 10.1007/s10482-019-01228-0 . PMID 30637538 . S2CID 58006833 .  
  4. ^ La Scola B, Barrassi L, Raoult D (2004). "Una nueva alfa-Proteobacterium, Nordella oligomobilis gen. nov., sp. nov., aislada mediante el uso de cocultivos de amebas" . Res Microbiol . 155 (1): 47– 51. doi : 10.1016/j.resmic.2003.09.012 . PMID 14759708 . 
  5. ^ Liu YL, Meng D, Wang F, Gong XF, Gu PF, Fan XY, Du ZJ, Zou JD, Li Q (2021 ) . " Propylenella binzhouense gen. nov., sp. nov. aislada de lodos activados y propuesta de Propylenellaceae fam. nov". Antonie van Leeuwenhoek . 114 (3): 225– 233. doi : 10.1007/s10482-020-01514-2 . PMID 33400070 . S2CID 230665484 .  
  6. ↑ Sislak CD (2013). Nuevas bacterias termófilas aisladas de fuentes hidrotermales marinas (MSc). Universidad Estatal de Portland. doi : 10.15760/etd.1485 . 1486.
  7. ↑ Euzéby JP, Parte AC. " Hyphomicrobiales " . Lista de nombres procariotas con estatus en la nomenclatura (LPSN) . Consultado el 15 de mayo de 2021 .
  8. ↑ Demanèche S, Kay E, Gourbière F, Simonet P (junio de 2001). "Transformación natural de Pseudomonas fluorescens y Agrobacterium tumefaciens en el suelo" . Applied and Environmental Microbiology . 67 (6): 2617–21 . Bibcode : 2001ApEnM..67.2617D . doi : 10.1128/AEM.67.6.2617-2621.2001 . PMC 92915. PMID 11375171 .  
  9. ↑ O'Connor M, Wopat A, Hanson RS (enero de 1977). "Transformación genética en Methylobacterium organophilum" . Journal of General Microbiology . 98 (1): 265–72 . doi : 10.1099/00221287-98-1-265 . PMID 401866 . 
  10. ↑ Zuniga-Soto E, Mullins E, Dedicova B (2015). "Transformación mediada por Ensifer: un protocolo eficiente sin Agrobacterium para la modificación genética del arroz" . SpringerPlus . 4 : 600. doi : 10.1186/s40064-015-1369-9 . PMC 4628045. PMID 26543735 .  
  11. ↑ Raina JL, Modi VV (agosto de 1972). "Unión de desoxirribonucleatos y transformación en Rhizobium jpaonicum" . Journal of Bacteriology . 111 (2): 356– 60. doi : 10.1128/JB.111.2.356-360.1972 . PMC 251290. PMID 4538250 .  

Lecturas adicionales

  • Kuykendall LD, Dazzo FB (2005). " Allorhizobium ". En Brenner DJ, Krieg NR, Staley JT, Garrity G (eds.). Las alfa-, beta-, delta- y épsilonproteobacterias, Las proteobacterias, Parte C, Manual de bacteriología sistemática de Bergey . Vol.  2 (2.ª  ed.). Springer, Nueva York, NY. pp. 345–346 . ISBN  978-0-387-24144-9.
  • Kuykendall LD (2005). "Género Azorhizobium ". En Brenner DJ, Krieg NR, Staley JT, Garrity G (eds.). Las alfa-, beta-, delta- y épsilonproteobacterias, Las proteobacterias, Parte C, Manual de bacteriología sistemática de Bergey . Vol.  2 (2.ª  ed.). Springer, Nueva York, NY. pp. 505–506 . ISBN  978-0-387-24144-9.
  • Kuykendall LD (2005). "Género Bradyrhizobium , familia Bradyrhizobiaceae"En Brenner DJ, Krieg NR, Staley JT, Garrity G (eds.). Las alfa-, beta-, delta- y épsilonproteobacterias, Las proteobacterias, Parte C, Manual de bacteriología sistemática de Bergey . Vol.  2 (2.ª  ed.). Springer, Nueva York, NY. págs. 438–443 . ISBN  978-0-387-24144-9.
  • Kuykendall LD, Young JM, Martínez-Romero, Kerr A, Sawada H (2005). "Género Rhizobium , un género altamente divergente en una familia revisada". En Brenner DJ, Krieg NR, Staley JT, Garrity G (eds.). Las alfa-, beta-, delta- y épsilonproteobacterias, Las proteobacterias, Parte C, Manual de bacteriología sistemática de Bergey . Vol.  2 (2.ª  ed.). Springer, Nueva York, NY. pp. 324–340 . ISBN  978-0-387-24144-9.
  • Chen WX, Wang ET, Kuykendall LD (2005). "Género Mesorhizobium , Familia Photobacteriaceae". En Brenner DJ, Krieg NR, Staley JT, Garrity G (eds.). Las alfa-, beta-, delta- y épsilonproteobacterias, Las proteobacterias, Parte C, Manual de bacteriología sistemática de Bergey . Vol.  2 (2.ª  ed.). Springer, Nueva York, NY. pp. 403–408 . ISBN  978-0-387-24144-9.