El sitio de utilización de Rho , también conocido por el acrónimo rut , es una secuencia de ARN en bacterias ubicada antes de la región terminadora que sirve como sitio de unión para la proteína conocida como factor rho . Esta secuencia es necesaria para la terminación de la transcripción del ADN dependiente de rho en bacterias. La característica común del sitio rut es la abundancia de residuos de citosina y la escasez de residuos de guanina , aunque estas secuencias varían ampliamente en diferentes genes con poca homología. [ 1 ]
Se han desarrollado algunos algoritmos para predecir dichos sitios. [ 2 ] [ 3 ]
Referencias
- ↑ Genes X de Lewin . Lewin, Benjamin., Krebs, Jocelyn E., Kilpatrick, Stephen T., Goldstein, Elliott S., Lewin, Benjamin. (10.ª ed.). Sudbury, Mass.: Jones and Bartlett. 2011. ISBN 9780763766320OCLC 456641931
{{cite book}}: CS1 mantenimiento: otros ( enlace ) - ↑ Di Salvo, Marco; Puccio, Simone; Peano, Clelia; Lacour, Stephan; Alifano, Pietro (7 de marzo de 2019). "RhoTermPredict: un algoritmo para predecir terminadores de transcripción dependientes de Rho basado en bases de datos de Escherichia coli, Bacillus subtilis y Salmonella enterica" . BMC Bioinformatics . 20 (1): 117. doi : 10.1186/s12859-019-2704-x . PMC 6407284. PMID 30845912 .
- ↑ Nadiras, Cédric; Eveno, Eric; Schwartz, Annie; Figueroa-Bossi, Nara; Boudvillain, Marc (19 de septiembre de 2018). " Un modelo de predicción multivariante para la terminación de la transcripción dependiente de Rho" . Nucleic Acids Research . 46 (16): 8245– 8260. doi : 10.1093/nar/gky563 . PMC 6144790. PMID 29931073 .
- Esbozos genéticos
- ARN