Articulo de referencia

Ruegeria

(Rüger and Höfle 1992) Uchino ''et al''. 1999 "},"subdivision_ranks":{"wt":"Species"},"subdivision_ref":{"wt":" {{cite web | url = https://lpsn.dsmz.de/genus/ruegeria | title = ...

Ruegeria es un género de bacterias de la familia Rhodobacteraceae . [ 1 ] Este género se conocía anteriormente como Agrobacterium marino antes de su reclasificación en 1998. De hecho, lleva el nombre de Hans-Jürgen Rüger, un microbiólogo alemán, por su contribución a la taxonomía de las especies marinas de Agrobacterium . [ 2 ]

Características

El género se caracteriza por miembros que son: [ 3 ]

  • Gram-negativas (como todas las Proteobacterias)
  • Células ovoides a alargadas de 0,6–1,6 × 1,0–4,0  μm
  • móvil mediante flagelos polares o no móvil
  • no formadores de esporas
  • aerobio
  • oxidasa y catalasa positiva
  • son incapaces de crecimiento fotosintético
  • La bacterioclorofila a está ausente.
  • La quinona principal es la ubiquinona 10.
  • El porcentaje molar de G+C del ADN es de 55 a 59.
  • miembro de la familia Rhodobacteraceae , que es fenotípica, metabólica y ecológicamente diversa y definida en base a datos de secuencias 16S

Filogenéticamente está muy cerca del género Silicibacter , pero ambos siguen siendo especies separadas debido a diferencias fenotípicas; dos especies para las que esto es problemático son Ruegeria lacuscaerulensis y Ruegeria pomeroyi . [ 4 ] [ 5 ]

Dos especies que han sido eliminadas del género son Marinovum algicola (Ruegeria algicola) y Thalassobius gelatinovorus (Ruegeria gelatinovora). [ 6 ] [y referencias allí citadas]

ARN pequeños no codificantes

Se ha demostrado la presencia de ARN pequeños bacterianos altamente abundantes en bacterias sometidas a limitación crónica de nutrientes. En Ruegeria pomeroyi, el análisis de RNAseq identificó 99 sRNA putativos. [ 7 ] Los mecanismos reguladores de los sRNA bacterianos se basan típicamente en la interacción directa ARN-ARN con un ARNm diana. [ 8 ] Los grupos de genes diana identificados por Rivers et al. fueron genes involucrados en el transporte, genes que median las interacciones célula-célula, la transducción de señales y la regulación transcripcional.

Referencias

  1. 1 2 "Entrada LPSN para Ruegeria " . Lista de nombres procariotas con estatus en la nomenclatura . Recuperado el 24 de abril de 2014 .
  2. ^ Uchino Y, Hirata A, Yokota A, Sugiyama J (1998). "Reclasificación de especies marinas de Agrobacterium : propuestas de Stappia stellulata gen. nov., comb. nov., Stappia aggregata sp. nom. rev., Ruegeria atlantica gen. nov., comb. nov., Ruegeria gelatinovora comb. nov., Ruegeria algicola comb. nov., y Ahrensia kieliense gen. nov., sp. nov., nom. Rdo" . J Gen Appl Microbiol . 44 (3): 201– 210. doi : 10.2323/jgam.44.201 . PMID 12501429 . 
  3. Don J. Brenner; Noel R. Krieg; James T. Staley (26 de julio de 2005) [1984 (Williams & Wilkins)]. George M. Garrity (ed.). Las Proteobacterias . Manual de Bacteriología Sistemática de Bergey. Vol. 2C (2.ª ed.). Nueva York: Springer. pp . 1388. ISBN    978-0-387-24145-6Biblioteca Británica n.º GBA561951.
  4. YI (H.), LIM (YW) y CHUN (J.): Evaluación taxonómica de los géneros Ruegeria y Silicibacter: una propuesta para transferir el género Silicibacter Petursdottir y Kristjansson 1999 al género Ruegeria Uchino et al. 1999. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2007, 57, 815-819.
  5. MURAMATSU (Y.), UCHINO (Y.), KASAI (H.), SUZUKI (K.) y NAKAGAWA (Y.): Ruegeria mobilis sp. nov., miembro de las Alphaproteobacteria aisladas en Japón y Palau. Int. J. Sistema. Evolución. Microbiol., 2007, 57, 1304-1309
  6. Ruegeria en LPSN ; Parte, Aidan C.; Sardà Carbasse, Joaquim; Meier-Kolthoff, Jan P.; Reimer, Lorenz C.; Göker, Markus (1 de noviembre de 2020). "La lista de nombres procariotas con estatus en la nomenclatura (LPSN) se traslada a la DSMZ" . Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva . 70 (11): 5607– 5612. doi : 10.1099/ijsem.0.004332 .
  7. Rivers, Adam R.; Burns, Andrew S.; Chan, Leong-Keat; Moran, Mary Ann (2016-01-01). " Identificación experimental de ARN pequeños no codificantes en la bacteria marina modelo Ruegeria pomeroyi DSS-3" . Frontiers in Microbiology . 7 : 380. doi : 10.3389/fmicb.2016.00380 . ISSN 1664-302X . PMC 4809877. PMID 27065955 .   
  8. Gottesman, Susan; Storz, Gisela (2011-12-01). "Reguladores de ARN pequeños bacterianos: funciones versátiles y variaciones en rápida evolución" . Cold Spring Harbor Perspectives in Biology . 3 (12) a003798. doi : 10.1101/cshperspect.a003798 . ISSN 1943-0264 . PMC 3225950. PMID 20980440 .   

Lecturas adicionales

Revistas científicas

  • Martens T, Heidorn T, Pukall R, Simon M, Tindall BJ, Brinkhoff T (2006). "Reclasificación de Roseobacter gallaeciensis Ruiz-Ponte et al. 1998 como Phaeobacter gallaeciensis gen. nov., comb. nov., descripción de Phaeobacter inhibens sp. nov., miembros productores de antibióticos del clado Roseobacter, reclasificación de Ruegeria algicola (Lafay et al. 1995) Uchino et al. 1998 como Marinovum algicola gen. nov., comb. nov. y descripciones modificadas de los géneros Roseobacter, Ruegeria y Leisingera" . Int. J. Sistema. Evolución. Microbiol . 56 (parte 6): 1293–1304 . doi : 10.1099/ijs.0.63724-0 . PMID 16738106 . 

Libros científicos

  • Garrity GM, Holt JG (2001). "Esquema taxonómico de las arqueas y bacterias" . En DR Boone, RW Castenholz (eds.). Manual de Bergey de bacteriología sistemática, volumen 1: las arqueas y las bacterias fototróficas y de ramificación profunda (2.ª  ed.). Nueva York: Springer Verlag. pp. 155–166 . ISBN  978-0-387-98771-2.