SARS-CoV-1

El coronavirus del síndrome respiratorio agudo severo 1 ( SARS-CoV-1 ), anteriormente conocido como coronavirus del síndrome respiratorio agudo severo ( SARS-CoV ), ^{[ 2 ]} es un coronavirus que causa el síndrome respiratorio agudo severo ( SARS ), la enfermedad respiratoria responsable del brote de SARS de 2002-2004 . ^{[ 3 ]} Es un virus de ARN monocatenario de sentido positivo y envuelto que infecta las células epiteliales dentro de los pulmones. ^{[ 4 ]} El virus entra en la célula huésped uniéndose a la enzima convertidora de angiotensina 2. [ ^{5 ] Infecta} a humanos , murciélagos y civetas de palma . ^{[ 6 ] [ 7 ]} El brote de SARS-CoV-1 se controló en gran medida mediante medidas simples de salud pública. Las pruebas a personas con síntomas (fiebre y problemas respiratorios), el aislamiento y la cuarentena de los casos sospechosos y la restricción de viajes tuvieron un efecto. El SARS-CoV-1 era más transmisible cuando los pacientes estaban enfermos, por lo que su propagación podía suprimirse eficazmente aislando a los pacientes con síntomas. ^{[ 8 ]}

El 16 de abril de 2003, tras el brote de SARS en Asia y casos secundarios en otras partes del mundo, la Organización Mundial de la Salud (OMS) emitió un comunicado de prensa en el que afirmaba que el coronavirus identificado por varios laboratorios era la causa oficial del SARS. Los Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades (CDC) de Estados Unidos y el Laboratorio Nacional de Microbiología (NML) de Canadá identificaron el genoma del SARS-CoV-1 en abril de 2003. ^{[ 9 ] [ 10 ]} Científicos de la Universidad Erasmus de Róterdam , Países Bajos, demostraron que el coronavirus del SARS cumplía los postulados de Koch , confirmándolo así como el agente causal. En los experimentos, los macacos infectados con el virus desarrollaron los mismos síntomas que los pacientes humanos con SARS. ^{[ 11 ]}

A finales de 2019 se descubrió un virus similar al SARS-CoV-1. Este virus, denominado coronavirus del síndrome respiratorio agudo grave 2 (SARS-CoV-2), es el agente causal de la COVID-19 , cuya propagación dio inicio a la pandemia de COVID-19 . ^{[ 12 ]} El grado de diferencia entre las proteínas de la espícula responsables de la entrada viral y el genoma de ambos virus indica que no comparten un ancestro común muy reciente. ^{[ 13 ]}

El síndrome respiratorio agudo severo (SARS) es la enfermedad causada por el SARS-CoV-1. Provoca una enfermedad a menudo grave y se caracteriza inicialmente por síntomas sistémicos como dolor muscular , dolor de cabeza y fiebre , seguidos en 2 a 14 días por la aparición de síntomas respiratorios, ^{[ 14 ]} principalmente tos, disnea y neumonía . Otro hallazgo común en pacientes con SARS es una disminución en el número de linfocitos circulantes en la sangre. ^{[ 15 ]}

En el brote de SARS de 2003, alrededor del 9 % de los pacientes con infección confirmada por SARS-CoV-1 fallecieron. ^{[ 16 ]} La tasa de mortalidad fue mucho mayor para los mayores de 60 años, llegando a alcanzar casi el 50 % en este grupo de pacientes. ^{[ 16 ]}

Este brote dio lugar a muchos programas de investigación, como Predict ^{[ 17 ]} y la subvención Understanding the Risk of Bat Coronavirus Emergence ^{[ 18 ]} , que tenían como objetivo identificar los riesgos zoonóticos antes de la transmisión a los humanos.

En marzo de 2003, la OMS estableció una red mundial de laboratorios líderes para colaborar en la identificación del agente causal del SARS. Inicialmente, los laboratorios de la red redujeron la búsqueda a miembros de las familias de paramixovirus y coronavirus. Los primeros hallazgos compartidos por los laboratorios apuntaban a los coronavirus con creciente consistencia. El 21 de marzo, científicos de la Universidad de Hong Kong anunciaron el aislamiento de un nuevo virus que se sospechaba firmemente que era el agente causal del SARS. ^{[ 19 ]}

La evidencia epidemiológica sugirió un origen zoonótico del virus: más del 33 % de los primeros casos detectados de SARS en Guangdong correspondieron a manipuladores de animales o alimentos. ^{[ 20 ]} Los estudios de seroprevalencia reforzaron este vínculo zoonótico (una alta proporción de manipuladores de animales asintomáticos en los mercados de la provincia de Guangdong tenían anticuerpos contra el SARS-CoV). ^{[ 20 ]}

El 12 de abril de 2003, científicos del Centro de Ciencias Genómicas Michael Smith en Vancouver terminaron de mapear la secuencia genética de un coronavirus que se cree está relacionado con el SARS. El equipo, liderado por Marco Marra y Caroline Astell , trabajó en colaboración con el Centro para el Control de Enfermedades de la Columbia Británica y el Laboratorio Nacional de Microbiología en Winnipeg , Manitoba , utilizando muestras de pacientes infectados en Toronto . ^{[ 21 ] [ 22 ]} El mapa se comparte con científicos de todo el mundo a través del sitio web del GSC. Donald Low , del Hospital Mount Sinai en Toronto, describió el descubrimiento como realizado con una "velocidad sin precedentes". ^{[ 23 ]} La secuencia del coronavirus del SARS ha sido confirmada posteriormente por otros grupos independientes.

La investigación epidemiológica molecular demostró que el virus aislado en 2002-2003 en el sur de China y el virus aislado en la misma área a finales de 2003 y principios de 2004 son diferentes, lo que indica eventos de cruce de especies separados. ^{[ 24 ]} La filogenia de las cepas del brote muestra que las provincias del suroeste, incluidas Yunnan, Guizhou y Guangxi, se comparan mejor con el SARS-CoV-1 humano que las de las otras provincias, pero la evolución de los virus es producto de la interacción con el huésped y su particularidad. ^{[ 25 ]}

A finales de mayo de 2003, estudios realizados con muestras de animales salvajes vendidos como alimento en el mercado local de Guangdong , China, encontraron que una cepa del coronavirus del SARS podía aislarse de las civetas de palma enmascaradas ( Paguma sp.), pero los animales no siempre presentaban signos clínicos. La conclusión preliminar fue que el virus del SARS cruzó la barrera de especies de la civeta de palma a los humanos, y más de 10.000 civetas de palma enmascaradas fueron sacrificadas en la provincia de Guangdong. El virus también se encontró posteriormente en perros mapache ( Nyctereuteus sp.), ^{[ 26 ]} tejones hurón ( Melogale spp.) y gatos domésticos. En 2004, científicos del Centro Chino para el Control y la Prevención de Enfermedades de la Universidad de Hong Kong y del Centro para el Control y la Prevención de Enfermedades de Guangzhou establecieron un vínculo genético entre el coronavirus del SARS que aparecía en las civetas y los humanos, confirmando las afirmaciones de que el virus podría haberse transmitido de la especie animal a los humanos. ^{[ 27 ]} Las civetas de palma infectadas en el mercado fueron rastreadas hasta granjas donde no se encontraron animales infectados. Se desconoce si el virus fue introducido originalmente en el mercado por las civetas, los humanos u otro animal. ^{[ 26 ]}

En 2005, dos estudios identificaron varios coronavirus similares al SARS en murciélagos chinos . ^{[ 28 ] [ 29 ]} Aunque el virus del SARS de murciélago no se replicó en cultivos celulares, en 2008, investigadores estadounidenses ^{[ 30 ]} alteraron la estructura genética del virus del SARS de murciélago con el dominio de unión al receptor humano tanto en el virus de murciélago como en los ratones, lo que demostró cómo podría ocurrir la zoonosis en la evolución. ^{[ 31 ]} El análisis filogenético de estos virus indicó una alta probabilidad de que el coronavirus del SARS se originara en murciélagos y se propagara a los humanos ya sea directamente o a través de animales mantenidos en mercados chinos. Los murciélagos no mostraron ningún signo visible de enfermedad, pero son los probables reservorios naturales de coronavirus similares al SARS.

Es probable que los murciélagos sean el reservorio natural, es decir, el huésped que albergaba el patógeno pero que no muestra efectos adversos y sirve como fuente de infección. No se encontró ningún progenitor directo del SARS-CoV en poblaciones de murciélagos, pero el WIV16 se encontró en una cueva en el municipio étnico Xiyang Yi , Yunnan, China, entre 2013 y 2016, y tiene una cepa viral genéticamente similar en un 96 %. ^{[ 32 ]} La hipótesis de que el SARS-CoV-1 surgió a través de recombinaciones de SARSr-CoV de murciélagos en la cueva de Yunnan donde se encontró el WIV16 o en otras cuevas de murciélagos aún no identificadas se considera altamente probable. ^{[ 33 ]}

Un árbol filogenético basado en secuencias del genoma completo del SARS-CoV-1 y coronavirus relacionados es:

El SARS-CoV-1 sigue la estrategia de replicación típica de la subfamilia de coronavirus . El receptor humano primario del virus es la enzima convertidora de angiotensina 2 (ACE2) y la hemaglutinina (HE), ^{[ 43 ]} identificadas por primera vez en 2003, ^{[ 44 ] [ 45 ]} y la proteína de la espícula viral carece de un sitio de escisión de furina. ^{[ 46 ]}

El SARS-CoV-1 humano parece haber tenido una historia compleja de recombinación entre coronavirus ancestrales que se alojaron en varios grupos de animales diferentes. ^{[ 47 ] [ 48 ]} Para que ocurra la recombinación, deben estar presentes al menos dos genomas de SARS-CoV-1 en la misma célula huésped. La recombinación puede ocurrir durante la replicación del genoma cuando la ARN polimerasa cambia de una plantilla a otra (recombinación por elección de copia). ^{[ 48 ]}

El SARS-CoV-1 es uno de los siete coronavirus conocidos que infectan a los humanos. Los otros seis son: ^{[ 49 ]}

• Coronavirus humano 229E (HCoV-229E)
• Coronavirus humano NL63 (HCoV-NL63)
• Coronavirus humano OC43 (HCoV-OC43)
• Coronavirus humano HKU1 (HCoV-HKU1)
• Coronavirus relacionado con el síndrome respiratorio de Oriente Medio (MERS-CoV)
• Coronavirus del síndrome respiratorio agudo grave 2 (SARS-CoV-2)

Cabe destacar que el SARS-CoV-1 es el segundo de los tres coronavirus conocidos que infectan a los humanos y utilizan ACE2 (los otros son HCoV-NL63 y SARS-CoV-2). ^{[ 50 ]}

• Carlos Urbani
• SL-CoV-WIV1

• Comunicado de prensa de la OMS en el que se identifica y nombra el virus del SARS.
• Mapa genético del virus del SARS. Archivado el 18 de agosto de 2006 en la Wayback Machine.
• Especial de ciencia sobre el virus del SARS (contenido gratuito: no se requiere registro)
• Recursos sobre el SARS de la Universidad McGill en Wayback Machine (archivado el 1 de marzo de 2005)
• Página principal de los Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades de EE. UU. (CDC) sobre el SARS
• La Organización Mundial de la Salud está en alerta.