Hispanopedia Wiki
Articulo de referencia

SF3B3

La subunidad 3 del factor de empalme 3B es una proteína que en humanos está codificada por el gen SF3B3 . [ 5 ] [ 6 ] Este gen codifica la subunidad 3 del complejo proteico del ...

Hispanopedia WikiContenido en espanolLectura gratuita

La subunidad 3 del factor de empalme 3B es una proteína que en humanos está codificada por el gen SF3B3 . [ 5 ] [ 6 ]

Este gen codifica la subunidad 3 del complejo proteico del factor de empalme 3b . El factor de empalme 3b, junto con el factor de empalme 3a y una unidad de ARN 12S, forma el complejo de ribonucleoproteínas nucleares pequeñas U2 (U2 snRNP). El complejo factor de empalme 3b/3a se une al pre-ARNm aguas arriba del sitio de ramificación del intrón de manera independiente de la secuencia y puede anclar el U2 snRNP al pre-ARNm. El factor de empalme 3b también es un componente del espliceosoma menor de tipo U12. La subunidad 3 también se ha identificado como un componente del complejo coactivador de transcripción STAGA (SPT3-TAF(II)31-GCN5L acetilasa)-HAT (histona acetiltransferasa) y del complejo TFTC (complejo que contiene TAF(II) libre de proteína de unión a TATA). Estos complejos pueden funcionar en la modificación de la cromatina, la transcripción, el empalme y la reparación del ADN. [ 6 ]

Interacciones

Se ha demostrado que SF3B3 interactúa con SF3B1 , [ 5 ] [ 7 ] la proteína homóloga SPT3 de iniciación de la transcripción [ 8 ] y TAF9 . [ 8 ]

Referencias

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000189091 – Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000033732 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. 1 2 Das BK; Xia L; Palandjian L; Gozani O; Chyung Y; Reed R (febrero de 2000). "Caracterización de un complejo proteico que contiene las proteínas del espliceosoma SAPs 49, 130, 145 y 155" . Mol Cell Biol . 19 (10): 6796–802 . doi : 10.1128/mcb.19.10.6796 . PMC 84676. PMID 10490618 .  
  6. 1 2 "Gen Entrez: factor de empalme SF3B3 3b, subunidad 3, 130kDa" .
  7. ↑ Will, Cindy L; Urlaub Henning; Achsel Tilmann; Gentzel Marc; Wilm Matthias; Lührmann Reinhard (septiembre de 2002). " Caracterización de nuevas proteínas SF3b y 17S U2 snRNP, incluyendo un homólogo humano de Prp5p y una proteína SF3b DEAD-box" . EMBO J. 21 ( 18): 4978–88 . doi : 10.1093/emboj/cdf480 . ISSN 0261-4189 . PMC 126279. PMID 12234937 .   
  8. 1 2 Martinez, E; Palhan VB; Tjernberg A; Lymar ES; Gamper AM; Kundu TK; Chait BT; Roeder RG (octubre de 2001). "El complejo STAGA humano es un coactivador de transcripción acetilante de cromatina que interactúa con factores de empalme de pre-ARNm y de unión al daño del ADN in vivo" . Mol . Cell. Biol . 21 (20): 6782– 95. doi : 10.1128/MCB.21.20.6782-6795.2001 . ISSN 0270-7306 . PMC 99856. PMID 11564863 .   

Lecturas adicionales

  • Nomura N, Miyajima N, Sazuka T, et  al. (1995). "Predicción de las secuencias codificantes de genes humanos no identificados. I. Las secuencias codificantes de 40 nuevos genes (KIAA0001-KIAA0040) deducidas mediante el análisis de clones de ADNc muestreados aleatoriamente de la línea celular mieloide inmadura humana KG-1" . DNA Res . 1 (1): 27–35 . doi : 10.1093/dnares/1.1.27 . PMID 7584026 . 
  • Nomura N, Miyajima N, Sazuka T, et  al. (1995). "Predicción de las secuencias codificantes de genes humanos no identificados. I. Las secuencias codificantes de 40 nuevos genes (KIAA0001-KIAA0040) deducidas mediante el análisis de clones de ADNc muestreados aleatoriamente de la línea celular mieloide inmadura humana KG-1 (suplemento)" . DNA Res . 1 (1): 47– 56. doi : 10.1093/dnares/1.1.47 . PMID 7584028 . 
  • Bonaldo MF; Lennon G; Soares MB (1997). "Normalización y sustracción: dos enfoques para facilitar el descubrimiento de genes" . Genome Res . 6 (9): 791– 806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548 . 
  • Mintz PJ, Patterson SD, Neuwald AF, et  al. (1999). "Purificación y caracterización bioquímica de cúmulos de gránulos intercromáticos" . EMBO J. 18 ( 15): 4308–20 . doi : 10.1093/emboj/18.15.4308 . PMC 1171507. PMID 10428969 .  
  • Brand M, Moggs JG, Oulad-Abdelghani M, et  al. (2001). "La proteína de unión al ADN dañada por UV en el complejo TFTC vincula el reconocimiento del daño al ADN con la acetilación del nucleosoma" . EMBO J. 20 ( 12): 3187–96 . doi : 10.1093/ emboj /20.12.3187 . PMC 150203. PMID 11406595 .  
  • Gangloff YG, Pointud JC, Thuault S, et  al. (2001). "Los componentes TFIID humanos TAFII140 y BIP2 de Drosophila (TAFII155) son nuevos homólogos metazoarios de TAFII47 de levadura que contienen un pliegue de histona y un dedo PHD" . Mol . Cell. Biol . 21 (15): 5109–21 . doi : 10.1128/MCB.21.15.5109-5121.2001 . PMC 87236. PMID 11438666 .  
  • Will CL, Schneider C, MacMillan AM, et  al. (2001). "Una nueva proteína snRNP U2 y U11/U12 que se asocia con el sitio de ramificación del pre-ARNm" . EMBO J. 20 ( 16): 4536–46 . doi : 10.1093/ emboj /20.16.4536 . PMC 125580. PMID 11500380 .  
  • Martinez E, Palhan VB, Tjernberg A, et  al. (2001). "El complejo STAGA humano es un coactivador de la transcripción acetilante de la cromatina que interactúa con el empalme del pre-ARNm y los factores de unión al daño del ADN in vivo" . Mol . Cell. Biol . 21 (20): 6782– 95. doi : 10.1128/MCB.21.20.6782-6795.2001 . PMC 99856. PMID 11564863 .  
  • Jurica MS, Licklider LJ, Gygi SR, et  al. (2002). "Purificación y caracterización de espliceosomas nativos adecuados para el análisis estructural tridimensional" . RNA . 8 ( 4): 426–39 . doi : 10.1017/S1355838202021088 . PMC 1370266. PMID 11991638 .  
  • Scott MP, Zappacosta F, Kim EY, et  al. (2002). "Identificación de nuevos ligandos del dominio SH3 para la quinasa de la familia Src Hck. Proteína del síndrome de Wiskott-Aldrich (WASP), proteína que interactúa con WASP (WIP) y ELMO1" . J. Biol. Chem . 277 (31): 28238–46 . doi : 10.1074/jbc.M202783200 . PMID 12029088 . 
  • Will CL, Urlaub H, Achsel T, et  al. (2002). "Caracterización de nuevas proteínas SF3b y 17S U2 snRNP, incluyendo un homólogo humano de Prp5p y una proteína SF3b DEAD-box" . EMBO J. 21 ( 18): 4978–88 . doi : 10.1093/ emboj /cdf480 . PMC 126279. PMID 12234937 .  
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et  al. (2003). "Generación y análisis inicial de más de 15.000 secuencias de ADNc humanas y de ratón de longitud completa" . Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .  
  • Cavusoglu N; Brand M; Tora L; Van Dorsselaer A (2003). "Nuevas subunidades del complejo de transcripción que contiene TAFII libre de la proteína de unión TATA identificadas mediante espectrometría de masas de tiempo de vuelo con desorción/ionización láser asistida por matriz tras electroforesis en gel unidimensional". Proteomics . 3 (2): 217– 23. doi : 10.1002/pmic.200390030 . PMID 12601814 . S2CID 6035986 .  
  • Li J, Hawkins IC, Harvey CD, et  al. (2003). "Regulación del empalme alternativo por SRrp86 y sus proteínas interactuantes" . Mol . Cell. Biol . 23 (21): 7437– 47. doi : 10.1128/MCB.23.21.7437-7447.2003 . PMC 207616. PMID 14559993 .  
  • Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et  al. (2004). "Secuenciación completa y caracterización de 21.243 cDNA humanos de longitud completa" . Nat. Genet . 36 (1): 40– 5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 . 
  • Will CL, Schneider C, Hossbach M, et  al. (2004). "El snRNP U11/U12 humano 18S contiene un conjunto de proteínas novedosas que no se encuentran en el espliceosoma dependiente de U2" . RNA . 10 ( 6): 929– 41. doi : 10.1261/rna.7320604 . PMC 1370585. PMID 15146077 .  
  • Jin J, Smith FD, Stark C, et  al. (2004). "Análisis proteómico, funcional y basado en dominios de proteínas de unión a 14-3-3 in vivo involucradas en la regulación del citoesqueleto y la organización celular" . Curr . Biol . 14 (16): 1436– 50. doi : 10.1016/j.cub.2004.07.051 . PMID 15324660. S2CID 2371325 .  
  • Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et  al. (2004). "Estado, calidad y expansión del proyecto de ADNc de longitud completa de los NIH: la colección de genes de mamíferos (MGC)" . Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928. PMID 15489334 .  
  • Ewing RM, Chu P, Elisma F, et  al. (2007). "Mapeo a gran escala de interacciones proteína-proteína humanas mediante espectrometría de masas" . Mol . Syst. Biol . 3 (1): 89. doi : 10.1038/msb4100134 . PMC 1847948. PMID 17353931 .  
Obtenido de " https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=SF3B3&oldid=1300696446 "