Multiplex Plus de segunda generación

Second Generation Multiplex Plus (SGM Plus) es un sistema de análisis de ADN desarrollado por Applied Biosystems . Se trata de una versión actualizada de Second Generation Multiplex . SGM Plus se utiliza en la Base de Datos Nacional de ADN del Reino Unido desde 1998.

Un perfil SGM Plus consta de una lista de 10 pares de números, uno por cada uno de los 10 marcadores genéticos , junto con dos letras (XX o XY) que indican el resultado de la prueba de determinación del sexo mediante amelogenina . Cada par de números representa los dos valores alélicos del marcador: uno se hereda de cada progenitor. Si ambos alelos son iguales, se registra un solo número, en lugar de un par.

Los marcadores genéticos (o loci ) utilizados por SGM Plus son todos repeticiones cortas en tándem (STR). Los marcadores utilizados son: VWA, D8S1179, D21S11, D18S51, TH01, FGA, D3S1358, D16S539, D2S1338 y D19S433. Cuando la designación de un marcador comienza con D, los dígitos que siguen inmediatamente a la D indican el cromosoma que contiene el marcador. Por ejemplo, D21S11 se encuentra en el cromosoma 21. SGM Plus también utiliza la prueba de determinación del sexo mediante amelogenina (amelo).

SGM Plus se diferencia de SGM en que SGM no utiliza los marcadores D3S1358, D16S539, D2S1338 y D19S433.

SGM Plus tiene ocho marcadores en común con CODIS : FGA, TH01, VWA, D3S1358, D8S1179, D16S539, D18S51 y D21S11. Se diferencia de CODIS en que utiliza los marcadores adicionales D2S1338 y D19S433 y no utiliza los cinco marcadores CSF1PO, TPOX, D5S818, D7S820 y D13S317. ^{[ 1 ]}

Los cebadores están marcados con los siguientes colorantes fluorescentes para su detección mediante electroforesis:

• 5-FAM
• JOSÉ
• NED

Los cebadores para cada locus están dispuestos en los colorantes en el siguiente orden, desde el de menor peso molecular hasta el de mayor peso molecular:

• 5-FAM: D3, VWA, D16, D2
• JOE: Amelo, D8, D21, D18
• NED: D19, THO, FGA

Los colorantes a los que se une cada cebador difieren de los del sistema original de perfilado de ADN SGM.

El perfil SGM Plus del sujeto GT36865 de un documento del Instituto Nacional de Estándares y Tecnología se muestra a continuación: ^{[ 2 ]}

Un perfil SGM Plus recuperado de una base de datos de ADN simplemente listaría los valores de los alelos: ^{[ 4 ]}

15,18; 6,9; 11,13; 22,22; 31,32.2; 14,17; 17,20; 11,12; 13,16.3; 15,16; XY

Cada valor representa el número de repeticiones en tándem dentro del alelo. Una repetición no estándar se designa mediante el número de unidades de repetición completas y el número de pares de bases de la repetición parcial, separados por un punto decimal.

La probabilidad de identidad (también conocida como probabilidad de coincidencia aleatoria) es la probabilidad de que dos individuos seleccionados al azar tengan un perfil genético idéntico.

Applied Biosystems estima que la probabilidad de identidad para SGM Plus es aproximadamente de 1 en 13 billones para los afroamericanos y de 1 en 3,3 billones para los estadounidenses caucásicos. ^{[ 5 ]}

La Comisión de Genética Humana ha informado que la probabilidad de coincidencia aleatoria se sitúa en torno a 1 entre un billón. Sin embargo, declaró: «Cuando se introdujo por primera vez el sistema de perfiles SGM Plus, hubo consenso en la comunidad científica en que las identificaciones con probabilidades de coincidencia inferiores a una entre mil millones no se citarían en los tribunales, para evitar sobreestimar el valor de la evidencia de ADN, teniendo en cuenta que las probabilidades de coincidencia son solo estimaciones, y para asegurar que la cifra utilizada fuera comprensible para personas no especializadas». ^{[ 6 ]}

El Servicio de la Fiscalía de la Corona del Reino Unido afirma: «El análisis de ADN SGM Plus discrimina muy bien entre individuos. La probabilidad de obtener una coincidencia entre los perfiles de dos individuos no emparentados por casualidad es muy baja, del orden de 1 entre mil millones. Sin embargo, aún no ha sido posible realizar las pruebas estadísticas necesarias para poder citar esta probabilidad de coincidencia, y en la práctica se utiliza una cifra de coincidencia por casualidad más conservadora de 1 entre 1.000 millones». ^{[ 7 ]}

• Perfil de ADN
• Base de datos nacional de ADN

• Base de datos de Internet de ADN con repeticiones cortas en tándem
• Manual del usuario del kit de amplificación por PCR AmpFlSTR SGM Plus