SKIDA1

SKIDA1 tiene ortólogos en especies de vertebrados. La especie menos emparentada con los humanos que posee un ortólogo de SKIDA1 es el anfioxo Branchiostoma belcheri . Los clados anfibios y condrictios tienen al menos dos especies con SKIDA1, pero SKIDA1 no se encuentra en todos los clados. No se han encontrado ortólogos en peces pulmonados ni en especies de invertebrados . ^{[ 11 ]}

SKIDA1 comparte el dominio Ski/Sno/Dac con el oncogén Ski (Ski), la proteína similar a Ski (Sno) y dachshund (Dac). ^{[ 12 ]} Comparte DUF4584 con la proteína asociada al complejo represor de policomb 2 de Elongin BC (EPOP). ^{[ 5 ]}

No hay consenso sobre si los humanos tienen una o dos isoformas de SKIDA1 . NCBI Gene afirma que hay una, mientras que UniProt afirma que hay dos. ^{[ 13 ] [ 14 ]} Es posible que la isoforma 2 esté registrada en NCBI Gene como DLN-1 (acceso BAE93016.1). La isoforma 1 tiene 908 aminoácidos de longitud, mientras que la isoforma 2 tiene 827 aminoácidos de longitud; a la isoforma 2 le faltan los aminoácidos 240-318 de la isoforma 1. ^{[ 14 ]} Se predice que la isoforma 1 pesa 98 kDa y tiene un punto isoeléctrico de 8,7, mientras que se predice que la isoforma 2 pesa 90 kDa y tiene un punto isoeléctrico de 7,6. ^{[ 15 ]}

Otras especies de mamíferos también poseen múltiples isoformas de SKIDA1, incluyendo carnívoros , roedores y primates . El número de isoformas varía según la especie: los guepardos tienen cinco isoformas registradas, los chimpancés tres y las ratas pardas dos. ^{[ 16 ]}

El gen humano SKIDA1 contiene dos regiones de polialanina, una de polihistidina y una de ácido poliglutámico. ^{[ 5 ]} Se desconoce si tienen alguna función. Las regiones de polialanina y polihistidina no están altamente conservadas entre los ortólogos ; por ejemplo, si bien se encuentran en el ortólogo del ratón doméstico , no se encuentran en el ortólogo del gorila occidental de tierras bajas . ^{[ 17 ] [ 18 ]} La región de ácido poliglutámico muestra mayor conservación y se encuentra abreviada en especies tan distantemente relacionadas con los humanos como la anguila de huellas de neumáticos . ^{[ 19 ]}

SKIDA1 contiene dos dominios : Ski/Sno/Dac y DUF4854. El dominio Ski/Sno/Dac se encuentra en el extremo N-terminal de la proteína. Este dominio también se encuentra en las proteínas Ski, Ski-like protein y dachshund. ^{[ 12 ]} Potencialmente, es un dominio de unión al ADN. ^{[ 20 ]}

El otro dominio, DUF4854, también se encuentra en EPOP, cerca de su extremo C-terminal . Sin embargo, el DUF4584 presente en EPOP tiene aproximadamente una quinta parte del tamaño del de SKIDA1. Los extremos C-terminales de SKIDA1 (aminoácidos 844-908) y EPOP (aminoácidos 313-379) comparten un 52% de identidad. El extremo C-terminal de EPOP se une a la subunidad SUZ12 del Complejo Represor de Polycomb 2 (PRC2), lo que sugiere que el de SKIDA1 también podría hacerlo. ^{[ 9 ]}

En los humanos, se predicen cinco promotores potenciales . Dos se alinean con la segunda mitad del transcrito de ARNm, lo que sugiere que no se utilizan o solo producen un polipéptido incompleto. ^{[ 21 ]}

El promotor que mejor se alinea con el inicio del transcrito de ARNm es potencialmente unido por muchos factores de transcripción , incluidos el factor de transcripción II B , el factor nuclear Y , la respuesta de crecimiento temprano 1 y el factor tipo Krueppel 6. [ ^{21 ] No} contiene una caja TATA .

SKIDA1 está regulado por microARN . miR-93 se une a la región 3'-UTR de SKIDA1 . ^{[ 22 ]} Se predice que varios microARN se unen a la región 3'-UTR de SKIDA1, incluidos miR-130 , miR-301 , miR-454 y miR-494 . ^{[ 23 ]}

SKIDA1 se SUMOila en cinco sitios. ^{[ 24 ]} Se predice que sitios adicionales se SUMOilarán. ^{[ 25 ] [ 26 ]} También se predice que SKIDA1 se fosforila y se O-GlcNAcila . ^{[ 27 ] [ 28 ]}

Se predice que SKIDA1 se localiza principalmente en el núcleo y en menor medida en el citosol . ^{[ 8 ]}

SKIDA1 se expresa en niveles altos en el cerebro , la tiroides y los testículos . Se expresa en niveles medios a bajos en el tejido adiposo , los ganglios linfáticos y el músculo esquelético . ^{[ 29 ] [ 30 ] [ 31 ] [ 32 ]} En ratones, se observa una expresión de media a alta en el bulbo olfatorio , la retina y la glándula salival . ^{[ 29 ]}

La expresión de SKIDA1 cambia durante el desarrollo del organismo. Su expresión es baja en el cigoto , alcanza su máximo durante el desarrollo embrionario y es baja después del nacimiento. En el ratón doméstico , se expresa más durante la organogénesis . ^{[ 33 ]} En el feto, su expresión es baja en el hígado, pero no en otros órganos. ^{[ 34 ]} La expresión en el hígado adulto es mucho mayor. Por el contrario, la expresión de SKIDA1 en el cerebro fetal es mayor que en el cerebro adulto. ^{[ 32 ]}

En la rana de uñas africana, SKIDA1 se expresa débilmente en la zona marginal de las gástrulas . Durante la neurulación , se expresa en el cerebro y la cresta neural craneal . Durante la formación de la cola, la expresión de SKIDA1 aumenta en las placodas sensoriales . Al final de la formación de la cola, la expresión neural se ha atenuado, excepto en el órgano olfativo . ^{[ 35 ]}