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Articulo de referencia

Herramienta sencilla de investigación sobre arquitectura modular

SMART ( Simple Modular Architecture Research Tool ) es una base de datos biológica que se utiliza para la identificación y el análisis de dominios proteicos dentro de secuencias...

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SMART ( Simple Modular Architecture Research Tool ) es una base de datos biológica que se utiliza para la identificación y el análisis de dominios proteicos dentro de secuencias de proteínas. [ 1 ] [ 2 ] SMART utiliza modelos ocultos de Markov de perfil construidos a partir de alineamientos de secuencias múltiples para detectar dominios proteicos en secuencias de proteínas. La versión más reciente de SMART contiene 1204 modelos de dominio. [ 3 ] Los datos de SMART se utilizaron para crear la colección de la Base de Datos de Dominios Conservados y también se distribuyen como parte de la base de datos InterPro . [ 4 ] La base de datos está alojada en el Laboratorio Europeo de Biología Molecular en Heidelberg.

Referencias

  1. ↑ Schultz J, Milpetz F, Bork P, Ponting CP (mayo de 1998). "SMART, una herramienta de investigación de arquitectura modular simple: identificación de dominios de señalización" ( PDF) . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 95 (11): 5857– 64. Bibcode : 1998PNAS...95.5857S . doi : 10.1073/pnas.95.11.5857 . PMC 34487. PMID 9600884 .  
  2. ↑ Letunic I, Doerks T, Bork P (enero de 2009). "SMART 6: actualizaciones recientes y nuevos desarrollos" . Nucleic Acids Res . 37 (número especial de bases de datos): D229–32. doi : 10.1093/nar/ gkn808 . PMC 2686533. PMID 18978020 .  
  3. ↑ Letunic, Ivica; Doerks, Tobias; Bork, Peer (enero de 2015). "SMART: actualizaciones recientes, nuevos desarrollos y estado en 2015" . Nucleic Acids Research . 43 (número especial de bases de datos): D257–260. doi : 10.1093 / nar/gku949 . ISSN 1362-4962 . PMC 4384020. PMID 25300481 .   
  4. ↑ Mulder NJ, Apweiler R, Attwood TK, et al. (septiembre de 2002). "InterPro: un recurso de documentación integrado para familias de proteínas, dominios y sitios funcionales" . Brief. Bioinformatics . 3 (3): 225– 35. doi : 10.1093/bib/3.3.225 . PMID 12230031 .  
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