La serina/treonina-proteína quinasa SMG1 es una enzima que en humanos está codificada por el gen SMG1 . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] SMG1 pertenece a la familia de proteínas quinasas relacionadas con la fosfatidilinositol 3-quinasa .
Función
Este gen codifica una proteína implicada en la degradación de ARNm mediada por codones de terminación prematura (NMD) como parte del complejo de vigilancia del ARNm. La proteína posee actividad quinasa y se cree que participa en la NMD fosforilando la proteína reguladora de los transcritos sin sentido 1. Se han descrito variantes de transcripción con empalme alternativo, pero no se ha determinado su longitud completa. [ 8 ]
Interacciones
Se ha demostrado que SMG1 (gen) interactúa con PRKCI [ 9 ] y UPF1 . [ 10 ]
Referencias
- 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000157106 – Ensembl , mayo de 2017
- 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000030655 – Ensembl , mayo de 2017
- ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
- ↑ Ishikawa K, Nagase T, Nakajima D, Seki N, Ohira M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (1998). "Predicción de las secuencias codificantes de genes humanos no identificados. VIII. 78 nuevos clones de ADNc del cerebro que codifican proteínas grandes in vitro" . DNA Res . 4 (5): 307–13 . doi : 10.1093/dnares/4.5.307 . PMID 9455477 .
- ↑ Denning G, Jamieson L, Maquat LE, Thompson EA, Fields AP (junio de 2001). "Clonación de una nueva quinasa relacionada con la fosfatidilinositol quinasa: caracterización de la proteína de vigilancia del ARN SMG-1 humana" . J. Biol. Chem . 276 (25): 22709–14 . doi : 10.1074/jbc.C100144200 . PMID 11331269 .
- ↑ Morita T, Yamashita A, Kashima I, Ogata K, Ishiura S, Ohno S (marzo de 2007). "Los dominios N- y C-terminales distantes son necesarios para la actividad quinasa intrínseca de SMG-1, un componente crítico de la degradación de ARNm mediada por codones de terminación prematura" . J. Biol. Chem . 282 (11): 7799–808 . doi : 10.1074/jbc.M610159200 . PMID 17229728 .
- 1 2 "Gen Entrez: SMG1 PI-3-quinasa relacionada con la quinasa SMG-1" .
- ↑ Diaz-Meco MT, Municio MM, Sanchez P, Lozano J, Moscat J (enero de 1996). "Proteína que interactúa con Lambda, una proteína novedosa que interactúa específicamente con el dominio de dedo de zinc del isotipo atípico de la proteína quinasa C lambda/iota y estimula su actividad quinasa in vitro e in vivo" . Mol . Cell. Biol . 16 (1): 105–14 . doi : 10.1128/mcb.16.1.105 . PMC 230983. PMID 8524286 .
- ↑ Yamashita A, Ohnishi T, Kashima I, Taya Y, Ohno S (septiembre de 2001). "SMG-1 humano, una nueva proteína quinasa relacionada con la fosfatidilinositol 3-quinasa, se asocia con componentes del complejo de vigilancia del ARNm y participa en la regulación de la degradación del ARNm mediada por codones de terminación prematura" . Genes Dev . 15 (17): 2215–28 . doi : 10.1101/gad.913001 . PMC 312771. PMID 11544179 .
Lecturas adicionales
- Nakajima D, Okazaki N, Yamakawa H, Kikuno R, Ohara O, Nagase T (2002). "Construcción de clones de ADNc listos para expresión para genes KIAA: curación manual de 330 clones de ADNc de KIAA". Res. ADN . 9 (3): 99– 106. CiteSeerX 10.1.1.500.923 . doi : 10.1093/dnares/9.3.99 . PMID 12168954 .
- Abraham RT (2005). "La quinasa relacionada con ATM, hSMG-1, conecta las vías de vigilancia del genoma y del ARN". Reparación del ADN (Amst.) . 3 ( 8–9 ): 919–25 . doi : 10.1016/j.dnarep.2004.04.003 . PMID 15279777 .
- Diaz-Meco MT, Municio MM, Sanchez P, Lozano J, Moscat J (1996). "Proteína que interactúa con Lambda, una proteína novedosa que interactúa específicamente con el dominio de dedo de zinc de la isoforma atípica de la proteína quinasa C lambda/iota y estimula su actividad quinasa in vitro e in vivo" . Mol . Cell. Biol . 16 (1): 105–14 . doi : 10.1128/MCB.16.1.105 . PMC 230983. PMID 8524286 .
- Sanchez P, De Carcer G, Sandoval IV, Moscat J, Diaz-Meco MT (1998). "Localización de isoformas atípicas de la proteína quinasa C en endosomas dirigidos a lisosomas a través de la interacción con p62" . Mol . Cell. Biol . 18 (5): 3069–80 . doi : 10.1128/mcb.18.5.3069 . PMC 110686. PMID 9566925 .
- Carmeliet P, Lampugnani MG, Moons L, Breviario F, Compernolle V, Bono F, Balconi G, Spagnuolo R, Oosthuyse B, Dewerchin M, Zanetti A, Angellilo A, Mattot V, Nuyens D, Lutgens E, Clotman F, de Ruiter MC, Gitenberger-de Groot A, Poelmann R, Lupu F, Herbert JM, Collen D, Dejana E (1999). "La deficiencia dirigida o el truncamiento citosólico del gen VE-cadherina en ratones perjudica la angiogénesis y la supervivencia endotelial mediada por VEGF" . Celúla . 98 (2): 147– 57. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81010-7 . PMID 10428027 . S2CID 2668221 .
- Loftus BJ, Kim UJ, Sneddon VP, Kalush F, Brandon R, Fuhrmann J, Mason T, Crosby ML, Barnstead M, Cronin L, Deslattes Mays A, Cao Y, Xu RX, Kang HL, Mitchell S, Eichler EE, Harris PC, Venter JC, Adams MD (1999). "Duplicaciones del genoma y otras características en 12 Mb de secuencia de ADN de los cromosomas humanos 16p y 16q". Genomics . 60 (3): 295– 308. doi : 10.1006/geno.1999.5927 . PMID 10493829 .
- Dias Neto E, Correa RG, Verjovski-Almeida S, Briones MR, Nagai MA, da Silva W, Zago MA, Bordin S, Costa FF, Goldman GH, Carvalho AF, Matsukuma A, Baia GS, Simpson DH, Brunstein A, de Oliveira PS, Bucher P, Jongeneel CV, O'Hare MJ, Soares F, Brentani RR, Reis LF, de Souza SJ, Simpson AJ (2000). "Secuenciación rápida del transcriptoma humano con etiquetas de secuencia expresadas en ORF" . Proc. Nacional. Acad. Ciencia. EE.UU . 97 (7): 3491– 6. Código bibliográfico : 2000PNAS...97.3491D . doi : 10.1073/pnas.97.7.3491 . PMC 16267 . PMID 10737800 .
- Yamashita A, Ohnishi T, Kashima I, Taya Y, Ohno S (2001). "SMG-1 humano, una nueva proteína quinasa relacionada con la fosfatidilinositol 3-quinasa, se asocia con componentes del complejo de vigilancia del ARNm y participa en la regulación de la degradación del ARNm mediada por codones de terminación prematura" . Genes Dev . 15 (17): 2215–28 . doi : 10.1101/gad.913001 . PMC 312771. PMID 11544179 .
- Eichler EE, Johnson ME, Alkan C, Tuzun E, Sahinalp C, Misceo D, Archidiacono N, Rocchi M (2002). "Orígenes divergentes y expansión concertada de dos duplicaciones segmentarias en el cromosoma 16" . J. Hered . 92 (6): 462–8 . doi : 10.1093/jhered/92.6.462 . PMID 11948212 .
- Chiu SY, Serin G, Ohara O, Maquat LE (2003). "Caracterización de Smg5/7a humano: una proteína con similitudes a SMG5 y SMG7 de Caenorhabditis elegans que funciona en la desfosforilación de Upf1" . RNA . 9 ( 1): 77–87 . doi : 10.1261/rna.2137903 . PMC 1370372. PMID 12554878 .
- Ohnishi T, Yamashita A, Kashima I, Schell T, Anders KR, Grimson A, Hachiya T, Hentze MW, Anderson P, Ohno S (2003). "La fosforilación de hUPF1 induce la formación de complejos de vigilancia de ARNm que contienen hSMG-5 y hSMG-7" . Mol. Cell . 12 (5): 1187–200 . doi : 10.1016/S1097-2765(03)00443-X . PMID 14636577 .
- Brumbaugh KM, Otterness DM, Geisen C, Oliveira V, Brognard J, Li X, Lejeune F, Tibbetts RS, Maquat LE, Abraham RT (2004). "La proteína de vigilancia del ARNm hSMG-1 funciona en las vías de respuesta al estrés genotóxico en células de mamíferos" . Mol. Cell . 14 (5): 585–98 . doi : 10.1016/j.molcel.2004.05.005 . PMID 15175154 .
- Kashima I, Yamashita A, Izumi N, Kataoka N, Morishita R, Hoshino S, Ohno M, Dreyfuss G, Ohno S (2006). "La unión de un nuevo complejo SMG-1-Upf1-eRF1-eRF3 (SURF) al complejo de unión de exones desencadena la fosforilación de Upf1 y la degradación de ARNm mediada por mutaciones sin sentido" . Genes Dev . 20 (3): 355– 67. doi : 10.1101/gad.1389006 . PMC 1361706. PMID 16452507 .
- Azzalin CM, Lingner J (2006). "El factor de vigilancia del ARN humano UPF1 es necesario para la progresión de la fase S y la estabilidad del genoma" . Curr . Biol . 16 (4): 433– 9. Bibcode : 2006CBio...16..433A . doi : 10.1016/j.cub.2006.01.018 . PMID 16488880. S2CID 17197870 .
- Genes en el cromosoma 16 humano
- CE 2.7.11
- restos de proteínas