Articulo de referencia

SMIM11

La proteína de membrana integral pequeña 11 es una proteína que en humanos está codificada por el gen SMIM11 . [ 3 ] [ 4 ] Gene Lugar SMIM11 se encuentra en la cadena positiva d...

La proteína de membrana integral pequeña 11 es una proteína que en humanos está codificada por el gen SMIM11 . [ 3 ] [ 4 ]

Gene

SMIM11 se encuentra en la cadena positiva del cromosoma 21 y tiene 4 exones . [ 4 ]

Expresión de SMIM11A en muestras de tejido humano

Expresión

La expresión de SMIM11 es más alta en el cerebro , la tiroides y el estómago , aunque también se expresa en muchos otros tejidos. [ 4 ]

No se conocen variantes de transcripción ni isoformas de SMIM11. [ 5 ]

Proteína

La proteína SMIM11 tiene 58 aminoácidos de longitud. Su peso molecular teórico es de 6 kDa y su pI teórico es de 9. [ 6 ] La proteína se localiza en el citoplasma y las mitocondrias, así como en los puntos de adhesión focal entre las células. [ 7 ] [ 8 ]

SMIM11 contiene un dominio transmembrana. [ 9 ] La proteína también posee un motivo de dileucina. Las modificaciones postraduccionales incluyen un sitio de ubiquitinación , así como dos sitios fosforilados , uno en una treonina y otro en una serina. [ 10 ] [ 11 ]

La proteína está compuesta principalmente por hélices alfa. [ 12 ] El extremo N-terminal de SMIM11 sobresale hacia la matriz extracelular, mientras que el extremo C-terminal se encuentra dentro del citoplasma de la célula. [ 13 ]

Estructura terciaria de SMIM11

Estructura cuaternaria e interacciones proteicas

Aún no se han identificado interacciones proteicas determinadas experimentalmente para SMIM11. [ 14 ]

Traducción conceptual de SMIM11

Homología y evolución

Parálogos

No existen parálogos ni dominios parálogos para SMIM11.

Ortólogos

SMIM11 tiene un gran número de ortólogos. Estos ortólogos abarcan desde otros mamíferos hasta aves, reptiles, anfibios y peces óseos. [ 15 ]

Tabla de ortólogos de SMIM11

Referencias

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000205670 Ensembl , mayo de 2017
  2. "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  3. "P58511 · SIM11_HUMAN" . www.uniprot.org . UniProt . Consultado el 23 de diciembre de 2022 .
  4. 1 2 3 "SMIM11 proteína de membrana integral pequeña 11 [ Homo sapiens (humano) ] " . ncbi.nlm.nih.gov . Centro Nacional de Información Biotecnológica , Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU . . Recuperado el 23-12-2022 .
  5. "Codificación de la proteína SMIM11A" . genecards.org .
  6. "Herramienta para calcular pI/Mw Expasy" . expasy.org .
  7. "Servidor PSORT II" . psort.hgc.jp .
  8. "Inmunohistoquímica de SMIM11A: El Atlas de Proteínas Humanas" . proteinatlas.org .
  9. "Proteína de membrana integral pequeña 11A de Homo sapiens (SMIM11A), ARNm" . ncbi.nlm.nih.gov . NCBI (Centro Nacional de Información Biotecnológica). 6 de julio de 2019.
  10. "Informe de iPTMnet para P58511 (SMIM11A)" . research.bioinformatics.udel.edu .
  11. "Servidor NetPhos 3.1" . cbs.dtu.dk .
  12. "Resultados de Phyre2 " . sbg.bio.ic.ac.uk.
  13. "Servidor TMHHM" . cbs.dtu.dk .
  14. "STRING FAM165B" . string-db.org .
  15. "NCBI Protein Blast" . blast.ncbi.nlm.nih.gov .