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Articulo de referencia

SOX17

La proteína SRY-box 17 está codificada en humanos por el gen SOX17 . [ 5 ] Gene El gen codifica un miembro de la familia SOX (SRY-related HMG-box) de factores de transcripción, ...

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La proteína SRY-box 17 está codificada en humanos por el gen SOX17 . [ 5 ]

Gene

El gen codifica un miembro de la familia SOX (SRY-related HMG-box) de factores de transcripción, ubicado en el cromosoma 8 q11.23.

Estructura

El gen SOX17 se encuentra dentro de un bucle de ADN que lo aísla de las regiones de control del ADN circundante, limitando así qué regiones de control pueden regular la expresión de SOX17. [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] Aproximadamente 230 kb río arriba de SOX17 se ha identificado una región diferencialmente (hipo)metilada (DMR) específica de tejido, que consta de elementos reguladores de SOX17 . [ 9 ] [ 8 ]

El DMR en particular contiene el potenciador específico del endodermo definitivo más distal en el locus SOX17 . [ 8 ] Recientemente, SOX17 se ha definido como un gen aislado topológicamente (TIG). Los TIG, por definición, son genes codificadores de proteínas (PCG) individuales dentro de dominios de bucle CTCF , que están principalmente enriquecidos en reguladores del desarrollo y se sugiere que están controlados de forma muy estricta a través de su arquitectura de dominio de bucle 3D. [ 8 ]

Función

SOX17 participa en la regulación del desarrollo embrionario de vertebrados y en la determinación del destino de las células endodérmicas. La proteína codificada actúa aguas abajo de la señalización de TGF beta (Activina) y la señalización canónica de WNT (Wnt3a). [ 10 ] [ 11 ] Especialmente la fosforilación correcta de SMAD2/3 dentro del ciclo celular correspondiente (fase G1 temprana) es crucial para la activación de genes endodérmicos cardinales (por ejemplo, SOX17) para ingresar al linaje endodérmico definitivo. [ 12 ] Además, la perturbación del límite centromérico de SOX17 - CTCF en la diferenciación temprana del endodermo definitivo, conduce a una falla masiva del desarrollo y a un llamado estado celular atrapado similar al mesendodermo, que puede ser rescatado por la expresión ectópica de SOX17. [ 8 ] En las gástrulas de Xenopus se ha demostrado que SOX17 modifica las respuestas Wnt, donde la especificidad genómica de la transcripción Wnt/β-catenina está determinada a través de interacciones funcionales entre SOX17 y los complejos transcripcionales β-catenina/Tcf. [ 11 ]

Referencias

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000164736 – Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000025902 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. ↑ "Entrez Gene: SRY-box 17" . Consultado el 7 de septiembre de 2017 .
  6. ↑ Rao SS, Huang SC, Glenn St Hilaire B, Engreitz JM, Perez EM, Kieffer-Kwon KR, et al. (octubre de 2017). "La pérdida de cohesina elimina todos los dominios de bucle" . Cell . 171 ( 2): 305–320.e24. Bibcode : 2017Cell..171..305R . doi : 10.1016/j.cell.2017.09.026 . hdl : 1721.1/118942 . PMC 5846482. PMID 28985562 .   
  7. ↑ Szabo Q, Bantignies F, Cavalli G (abril de 2019). "Principios del plegamiento del genoma en dominios de asociación topológica" . Science Advances . 5 (4) eaaw1668. Bibcode : 2019SciA....5.1668S . doi : 10.1126/sciadv.aaw1668 . PMC 6457944. PMID 30989119 .  
  8. 1 2 3 4 5 Wu HJ, Landshammer A, Stamenova EK, Bolondi A, Kretzmer H, Meissner A, et al. (agosto de 2021). "Aislamiento topológico de reguladores del desarrollo en genomas de mamíferos" . Nature Communications . 12 (1) 4897. Bibcode : 2021NatCo..12.4897W . doi : 10.1038/ s41467-021-24951-7 . PMC 8361032. PMID 34385432 .   
  9. ↑ Tsankov AM, Gu H, Akopian V, Ziller MJ, Donaghey J, Amit I, et al. (febrero de 2015). "Dinámica de la unión de factores de transcripción durante la diferenciación de células ES humanas" . Nature . 518 ( 7539): 344–349 . Bibcode : 2015Natur.518..344T . doi : 10.1038/nature14233 . PMC 4499331. PMID 25693565 .   
  10. ↑ Engert S, Burtscher I, Liao WP, Dulev S, Schotta G, Lickert H (agosto de 2013). "La señalización Wnt/β-catenina regula la expresión de Sox17 y es esencial para la formación del organizador y el endodermo en el ratón" . Development . 140 (15). Cambridge, Inglaterra: 3128–3138 . doi : 10.1242/dev.088765 . PMID 23824574 . 
  11. 1 2 Mukherjee S, Chaturvedi P, Rankin SA, Fish MB, Wlizla M, Paraiso KD, et al. (septiembre de 2020). LaBonne C, Morrisey EE (eds.). "Sox17 y β-catenina coocupan potenciadores sensibles a Wnt para controlar la red reguladora de genes del endodermo" . eLife . 9 e58029 . doi : 10.7554/eLife.58029 . PMC 7498262. PMID 32894225 .   
  12. ↑ Pauklin S, Vallier L (septiembre de 2013). "El estado del ciclo celular de las células madre determina la propensión al destino celular" . Cell . 155 ( 1): 135–147 . doi : 10.1016/j.cell.2013.08.031 . PMC 3898746. PMID 24074866 .  

Lecturas adicionales

  • Zhang W, Glöckner SC, Guo M, Machida EO, Wang DH, Easwaran H, et  al. (abril de 2008). " Inactivación epigenética del gen 17 que contiene la caja SRY, antagonista canónico de Wnt, en el cáncer colorrectal" . Cancer Research . 68 (8): 2764– 2772. doi : 10.1158/0008-5472.CAN-07-6349 . PMC 2823123. PMID 18413743 .  
  • Patterson ES, Addis RC, Shamblott MJ, Gearhart JD (agosto de 2008). "SOX17 activa directamente la transcripción de Zfp202 durante la diferenciación del endodermo in vitro". Physiological Genomics . 34 (3): 277– 284. doi : 10.1152/physiolgenomics.90236.2008 . PMID 18523156 . 
  • Ferrell RE, Kimak MA, Lawrence EC, Finegold DN (2008). "Análisis de genes candidatos en el linfedema primario". Lymphatic Research and Biology . 6 (2): 69– 76. doi : 10.1089/lrb.2007.1022 . PMID 18564921 . 
  • Séguin CA, Draper JS, Nagy A, Rossant J (agosto de 2008). "Establecimiento de progenitores endodérmicos mediante la expresión del factor de transcripción SOX en células madre embrionarias humanas" . Cell Stem Cell . 3 (2): 182– 195. doi : 10.1016/j.stem.2008.06.018 . PMID 18682240 . 
  • Semb H (octubre de 2008). "Progenitores endodérmicos expandibles: nuevas herramientas para explorar el endodermo y sus derivados" . Cell Stem Cell . 3 (4): 355– 356. doi : 10.1016/j.stem.2008.09.010 . PMID 18940723 . 
  • Fu DY, Wang ZM, Wang BL, Shen ZZ, Huang W, Shao ZM (febrero de 2010). "Sox17, el antagonista canónico de Wnt, se inactiva epigenéticamente por metilación del promotor en el cáncer de mama humano". Breast Cancer Research and Treatment . 119 (3): 601– 612. doi : 10.1007/s10549-009-0339-8 . PMID 19301122. S2CID 8614063 .  
  • Nonaka D (mayo de 2009). "Expresión diferencial de SOX2 y SOX17 en tumores de células germinales testiculares" . American Journal of Clinical Pathology . 131 (5): 731– 736. doi : 10.1309/AJCP7MNCNBCRN8NO . PMID 19369635 . 
  • Du YC, Oshima H, Oguma K, Kitamura T, Itadani H, Fujimura T, et  al. (octubre de 2009). "Inducción y regulación negativa de Sox17 y sus posibles funciones durante el curso de la tumorigénesis gastrointestinal". Gastroenterología . 137 (4): 1346– 1357. doi : 10.1053/j.gastro.2009.06.041 . hdl : 2297/25144 . PMID 19549530 . S2CID 6296792 .  
  • Stefanovic S, Abboud N, Désilets S, Nury D, Cowan C, Pucéat M (septiembre de 2009). "Interacción de Oct4 con Sox2 y Sox17: un interruptor molecular de la pluripotencia de las células madre a la especificación de un destino cardíaco" . The Journal of Cell Biology . 186 (5): 665– 673. doi : 10.1083/jcb.200901040 . PMC 2742180. PMID 19736317 .  
  • MacCarthy CM, Malik V, Wu G, Velychko T, Keshet G, Jauch R, et  al. (2024). "Super-SOX quimérico altamente cooperativo induce pluripotencia ingenua en diferentes especies". Cell Stem Cell . 31 (1): 127–147.e9. bioRxiv 10.1101/2022.09.23.509242 . doi : 10.1016/j.stem.2023.11.010 . PMID 38141611 .  

Este artículo incorpora texto de la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos , que es de dominio público .

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