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Puerta de entrada a la ciencia

Los portales científicos proporcionan acceso a recursos avanzados para investigadores, educadores y estudiantes de ciencia e ingeniería. A través de interfaces en línea optimiza...

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Los portales científicos proporcionan acceso a recursos avanzados para investigadores, educadores y estudiantes de ciencia e ingeniería. A través de interfaces en línea optimizadas y fáciles de usar, los portales combinan una variedad de componentes de ciberinfraestructura (CI) para respaldar un conjunto de herramientas, aplicaciones y recopilaciones de datos específicas de la comunidad: [ 1 ] En general, estos recursos especializados y compartidos se integran como un portal web, una aplicación móvil o un conjunto de aplicaciones. [ 2 ] A través de los portales científicos, amplias comunidades de investigadores pueden acceder a diversos recursos que pueden ahorrar tiempo y dinero tanto para ellos como para sus instituciones. [ 3 ] Como se indica a continuación, las funciones y los recursos que ofrecen los portales científicos incluyen equipos e instrumentos compartidos, servicios computacionales, aplicaciones de software avanzadas, capacidades de colaboración, repositorios de datos y redes. [ 2 ]

equipos e instrumentos compartidos

  • telescopios
  • sensores
  • mesas vibratorias sísmicas

servicios computacionales

aplicaciones de software avanzadas

  • flujos de trabajo
  • herramientas de análisis
  • herramientas de simulación
  • herramientas de modelado
  • herramientas de visualización

capacidades de colaboración

repositorios de datos

redes

  • alta velocidad
  • ancho de banda alto

Historia

Durante décadas, existieron portales científicos de diversas formas que en aquel entonces no se denominaban portales científicos, pero en la última década, más proyectos se han agrupado en torno a este término. Por ejemplo, el Protein Data Bank : [ 4 ] comenzó en 1971 y continúa brindando un servicio crucial para su comunidad.

Los portales científicos suelen recibir otros nombres, dependiendo de la comunidad o región del mundo. Algunos nombres alternativos son [ 5 ].

Algunas de las primeras plataformas que ofrecían interfaces simplificadas para la computación en malla de alto rendimiento utilizaban la infraestructura informática TeraGrid , con sede en EE. UU. y financiada por la Fundación Nacional de Ciencias (NSF). TeraGrid (que ahora continúa bajo los auspicios del Extreme Science and Engineering Discovery Environment , o XSEDE) reunió a una comunidad diversa de desarrolladores de software, que de otro modo estarían aislados entre sí debido a la disparidad de sus campos de aplicación. En Australia, el organismo de investigación electrónica NeCTAR proporciona recursos y apoyo similares para las plataformas. Con el crecimiento de esta comunidad en EE. UU., Europa y Australasia, varias series de talleres ayudaron a los creadores y usuarios de plataformas a unirse en torno al concepto y formar una comunidad de práctica: Gateway Computing Environments (EE. UU., iniciado en 2005), International Workshop on Science Gateways (Europa, iniciado en 2009) e International Workshop on Science Gateways - Australia (iniciado en 2016).

Además, se ha multiplicado el software intermedio para dar soporte a las pasarelas, entre los que se incluyen:

Cuando algunos de los primeros portales (y otros recursos digitales) llegaron al final de su primer ciclo de financiación, los usuarios comenzaron a ver que algunos portales cerraban debido a la falta de financiación o al progreso insuficiente en la creación de una herramienta sostenible; esto impulsó una mayor investigación sobre las claves de la sostenibilidad para dichos proyectos. [ 12 ] [ 13 ] Reconociendo la necesidad de reutilizar el software y de intercambio comunitario, la Fundación Nacional de Ciencias de EE. UU. financió en 2016 el Instituto Comunitario de Portales Científicos, [ 2 ] que proporciona servicios y recursos subvencionados a los desarrolladores y usuarios de portales científicos. A nivel internacional, la Coalición Internacional sobre Portales Científicos reúne a organizaciones de múltiples países y continentes para compartir las mejores prácticas y las direcciones futuras en el campo.

Véase también

Referencias

  1. ↑ Wilkins‐Diehr, Nancy. "Número especial: portales científicos: interfaces comunitarias comunes a los recursos de la red." Concurrency and Computation: Practice and Experience 19, n.º 6 (2007): 743-749.
  2. 1 2 3 Lawrence, Katherine A., Michael Zentner, Nancy Wilkins‐Diehr, Julie A. Wernert, Marlon Pierce, Suresh Marru y Scott Michael. "Puertas de acceso a la ciencia hoy y mañana: perspectivas positivas de casi 5000 miembros de la comunidad investigadora", Concurrency and Computation: Practice and Experience 27, No. 16 (2015): 4252-4268.
  3. ↑ Kiss, Tamas. "Puertas de entrada científicas para una mayor adopción de infraestructuras de computación distribuida." Journal of Grid Computing (2012): 1-2
  4. ↑ Berman, HM (enero de 2008). "El Banco de Datos de Proteínas: una perspectiva histórica" ​​(PDF). Acta Crystallographica Sección A. A64 (1): 88–95. PMID 18156675. doi:10.1107/S0108767307035623 
  5. ↑ Shahand, S. (2015). Portales científicos para el análisis de macrodatos biomédicos (Tesis doctoral). Recuperado del Repositorio Académico Digital de la Universidad de Ámsterdam.
  6. ^ Pierce, Marlon E., Suresh Marru, Lahiru Gunathilake, Don Kushan Wijeratne, Raminder Singh, Chathuri Wimalasena, Shameera Ratnayaka y Sudhakar Pmidighantam. "Apache Airavata: diseño y direcciones de un marco de acceso a la ciencia". Concurrencia y Computación: Práctica y Experiencia 27, no. 16 (2015): 4282-4291. http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/cpe.3534/full
  7. ↑ Wang, Y., Kaplan, N., Newman, G., & Scarpino, R. "CitSci.org: Un nuevo modelo para gestionar, documentar y compartir datos de ciencia ciudadana," PLoS Biology, vol. 13, (10), 2015. DOI: https://dx.doi.org/10.1371/journal.pbio.1002280 .
  8. ↑ Merchant, Nirav, et al., "The iPlant Collaborative: Cyberinfrastructure for Enabling Data to Discovery for the Life Sciences," PLOS Biology (2016), doi: 10.1371/journal.pbio.1002342.
  9. ↑ Goff, Stephen A., et al., "The iPlant Collaborative: Cyberinfrastructure for Plant BIology," Frontiers in Plant Science 2 (2011), doi: 10.3389/fpls.2011.00034.
  10. ↑ Enis Afgan, Dannon Baker, Marius van den Beek, Daniel Blankenberg, Dave Bouvier, Martin Čech, John Chilton, Dave Clements, Nate Coraor, Carl Eberhard, Björn Grüning, Aysam Guerler, Jennifer Hillman-Jackson, Greg Von Kuster, Eric Rasche, Nicola Soranzo, Nitesh Turaga, James Taylor, Anton Nekrutenko y Jeremy Goecks. La plataforma Galaxy para análisis biomédicos accesibles, reproducibles y colaborativos: actualización de 2016. Nucleic Acids Research (2016) 44(W1): W3-W10 doi:10.1093/nar/gkw343
  11. ↑ M. McLennan, R. Kennell, "HUBzero: Una plataforma para la difusión y la colaboración en ciencia e ingeniería computacional", Computing in Science and Engineering, 12(2), pp. 48-52, marzo/abril de 2010.
  12. ↑ Maron, Nancy L., K. Kirby Smith y Matthew Loy. «Sostenimiento de los recursos digitales: una visión práctica de los proyectos actuales». Ithaka S+R. Última modificación: 14 de julio de 2009. https://doi.org/10.18665/sr.22408 .
  13. ↑ Wilkins-Diehr, N. y KA Lawrence (2010) “Abriendo puertas de acceso a la ciencia para el éxito futuro: los desafíos de la sostenibilidad de las puertas de acceso”, Taller sobre entornos de computación de puerta de acceso (GCE), 2010, pp. 1-10; 14 de noviembre de 2010. IEEE Computer Society (Biblioteca digital Xplore). doi: 10.1109/GCE.2010.5676121.
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