Articulo de referencia

Gráfico secundario (cinética)

En la cinética enzimática , un gráfico secundario utiliza la intersección o la pendiente de varios gráficos de Lineweaver-Burk para encontrar constantes cinéticas adicionales. [...

En la cinética enzimática , un gráfico secundario utiliza la intersección o la pendiente de varios gráficos de Lineweaver-Burk para encontrar constantes cinéticas adicionales. [ 1 ] [ 2 ]

Por ejemplo, cuando se representa un conjunto de curvas v por [S] de una enzima con un mecanismo de ping-pong (sustrato A variable, sustrato B fijo) en un gráfico de Lineweaver-Burk , se producirá un conjunto de líneas paralelas.

La siguiente ecuación de Michaelis-Menten relaciona la velocidad de reacción inicial v 0 con las concentraciones de sustrato [A] y [B]:

1v0=KMETROAvmáximo[A]+KMETROBvmáximo[B]+1vmáximo{\displaystyle {\begin{aligned}{\frac {1}{v_{0}}}&={\frac {K_{M}^{A}}{v_{\max }{[}A{]}}}+{\frac {K_{M}^{B}}{v_{\max }{[}B{]}}}+{\frac {1}{v_{\max }}}\end{aligned}}}

La intersección con el eje y de esta ecuación es igual a lo siguiente:

intersección con el eje y=KMETROBvmáximo[B]+1vmáximo{\displaystyle {\begin{aligned}{\mbox{intersección con el eje y}}={\frac {K_{M}^{B}}{v_{\max }{[}B{]}}}+{\frac {1}{v_{\max }}}\end{aligned}}}

La intersección con el eje y se determina en varias concentraciones fijas diferentes del sustrato B (y variando el sustrato A). Luego, los valores de la intersección con el eje y se grafican frente a 1/[B] para determinar la constante de Michaelis para el sustrato B.KMETROB{\displaystyle K_{M}^{B}}, como se muestra en la figura de la derecha. [ 3 ] La pendiente es igual aKMETROB{\displaystyle K_{M}^{B}}dividido porvmáximo{\displaystyle v_{\max }}y la intersección es igual a 1 sobrevmáximo{\displaystyle v_{\max }}.

Gráfico secundario del sistema enzimático peroxidasa de rábano picante y o -fenilendiamina (con peróxido de hidrógeno como segundo sustrato).

Trama secundaria en estudios de inhibición

También se puede utilizar un gráfico secundario para encontrar una constante de inhibición específica, K I .

Para un inhibidor enzimático competitivo , la constante de Michaelis aparente es igual a la siguiente:

aparente Kmetro=Kmetro×(1+[I]KI){\displaystyle {\begin{aligned}{\mbox{aparente }}K_{m}=K_{m}\times \left(1+{\frac {[I]}{K_{I}}}\right)\end{aligned}}}

Por lo tanto, la pendiente del gráfico de Lineweaver-Burk es igual a:

pendiente=Kmetrovmáximo×(1+[I]KI){\displaystyle {\begin{aligned}{\mbox{pendiente}}={\frac {K_{m}}{v_{\max }}}\times \left(1+{\frac {[I]}{K_{I}}}\right)\end{aligned}}}

Si se crea una gráfica secundaria a partir de los valores de pendiente de varias gráficas de Lineweaver-Burk con diferentes concentraciones de inhibidor [I], se puede determinar la constante de inhibición competitiva. La pendiente de la gráfica secundaria dividida por la intersección es igual a 1/K I. Este método permite hallar la constante K I , incluso cuando se desconocen la constante de Michaelis y los valores de v max .

Referencias

  1. A. Cornish-Bowden . Fundamentos de la cinética enzimática. Edición revisada, Portland: Londres, Inglaterra, (1995) págs. 30-37, 56-57.
  2. JN Rodriguez-Lopez, MA Gilabert, J. Tudela, RNF Thorneley y F. Garcia-Canovas. Bioquímica , 2000, 39 , 13201-13209.
  3. El sistema peroxidasa de rábano picante/o-fenilendiamina (HRP/OPD) presenta un mecanismo de dos pasos. MK Tiama y TM Hamilton, Journal of Undergraduate Chemistry Research , 4 , 1 (2005).