rpoN

El gen rpoN ( ARN polimerasa , limitación de nitrógeno N ) codifica el factor sigma sigma-54 (σ54, sigma N o RpoN), una proteína presente en Escherichia coli y otras especies de bacterias. RpoN antagoniza los factores sigma RpoS. ^{[ 1 ]}

Originalmente identificado como un regulador de genes involucrados en el metabolismo y la asimilación del nitrógeno en condiciones limitantes de nitrógeno, ^{[ 2 ]} se ha demostrado que σ54 de E. coli desempeña importantes funciones reguladoras en una variedad de otros procesos celulares. De manera similar, los homólogos de σ54 en otras especies regulan una amplia gama de procesos, incluyendo la síntesis flagelar y la virulencia. ^{[ 3 ]}

Los elementos promotores σ54 consisten en nucleótidos conservados ubicados en −12 y −24 con respecto al sitio de inicio de la transcripción. ^{[ 4 ]} Esto contrasta con los miembros de la  familia σ70, que reconocen elementos promotores conservados ubicados aproximadamente en −10 y −35 con respecto al sitio de inicio de la transcripción. ^{[ 5 ]} A diferencia de los miembros de la familia σ70, se ha demostrado que las proteínas σ54 se unen al ADN promotor independientemente de la ARN polimerasa central in vitro . ^{[ 6 ]} Otra característica distintiva de las proteínas σ54 es su requerimiento absoluto de proteínas activadoras, conocidas como proteínas de unión a potenciadores bacterianos (bEBP), para iniciar la transcripción. ^{[ 4 ] [ 7 ]} Por lo tanto, tanto las formas activas como inactivas de la ARN polimerasa:σ54 se unen a los promotores. ^{[ 8 ]}

Los elementos promotores regulados por RpoN tienen la siguiente secuencia consenso: TTGGCACGGTTTTTGCT. ^{[ 9 ]}