La proteína de unión a ADN monocatenario ( SSB ) es una proteína presente en la bacteria Escherichia coli ( E. coli ) que se une a las regiones monocatenarias del ácido desoxirribonucleico ( ADN ). [ 1 ] El ADN monocatenario se produce durante todos los aspectos del metabolismo del ADN: replicación, recombinación y reparación. Además de estabilizar este ADN monocatenario, las proteínas SSB se unen a numerosas proteínas implicadas en todos estos procesos y modulan su función.
La proteína SSB activa de E. coli está compuesta por cuatro subunidades idénticas de 19 kDa . La unión del ADN monocatenario al tetrámero puede ocurrir en diferentes "modos", ocupando la SSB un número variable de bases de ADN dependiendo de diversos factores, incluida la concentración de sal. Por ejemplo, el modo de unión (SSB) 65 , en el que aproximadamente 65 nucleótidos de ADN se enrollan alrededor del tetrámero de SSB y contactan con sus cuatro subunidades, se ve favorecido a altas concentraciones de sal in vitro . A concentraciones de sal más bajas, tiende a formarse el modo de unión (SSB) 35 , en el que unos 35 nucleótidos se unen a solo dos de las subunidades de SSB. Se requiere más investigación para dilucidar las funciones de los distintos modos de unión in vivo .
SSB bacteriano
Los dominios de la proteína SSB en bacterias son importantes en su función de mantener el metabolismo del ADN, más específicamente la replicación , reparación y recombinación del ADN. [ 2 ] Tiene una estructura de tres hebras beta a una sola lámina beta de seis hebras para formar un dímero de proteína . [ 3 ]
Véase también
Referencias
- ↑ Shishmarev D, Wang Y, Mason CE, Su XC, Oakley AJ, Graham B, et al. (febrero de 2014). "Modo de unión intramolecular del extremo C de la proteína de unión al ADN monocatenario de Escherichia coli determinado por espectroscopia de resonancia magnética nuclear" . Nucleic Acids Research . 42 (4): 2750– 2757. doi : 10.1093/nar/gkt1238 . PMC 3936761. PMID 24288378 .
- ↑ Meyer RR, Laine PS (diciembre de 1990). "La proteína de unión al ADN monocatenario de Escherichia coli" . Microbiological Reviews . 54 (4): 342–380 . doi : 10.1128/MMBR.54.4.342-380.1990 . PMC 372786. PMID 2087220 .
- ↑ Raghunathan S, Ricard CS, Lohman TM, Waksman G (junio de 1997). "Estructura cristalina del dominio de unión al ADN homotetramérico de la proteína de unión al ADN monocatenario de Escherichia coli determinada por difracción de rayos X de longitud de onda múltiple en la proteína selenometionil a una resolución de 2,9 Å" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 94 (13): 6652– 6657. doi : 10.1073/pnas.94.13.6652 . PMC 21213. PMID 9192620 .
Enlaces externos
- Proteínas de unión a ADN monocatenario en los encabezamientos de materias médicas (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU.
- SSB en PFAM
- Familias de proteínas
- replicación del ADN
- Proteínas
- sustancias que se unen al ADN
- proteínas de unión al ADN