Modelador epidemiológico espaciotemporal

El Modelador Epidemiológico Espaciotemporal ( STEM ) es un software libre disponible a través de la Fundación Eclipse . Desarrollado originalmente por IBM Research , STEM es un marco y una herramienta de desarrollo diseñados para ayudar a los científicos a crear y utilizar modelos espaciales y temporales de enfermedades infecciosas . STEM utiliza una arquitectura de software basada en componentes según el estándar OSGi . La plataforma Eclipse Equinox es una implementación de referencia de dicho estándar. Al utilizar una arquitectura de software basada en componentes, todos los componentes o elementos necesarios para un modelo de enfermedad, incluyendo el código y los datos, están disponibles como bloques de construcción de software que pueden intercambiarse, extenderse, reutilizarse o reemplazarse de forma independiente. Estos bloques de construcción o complementos se denominan "complementos" o "extensiones" de Eclipse. Los complementos de STEM contienen datos del denominador para las regiones administrativas de interés. Las regiones están indexadas mediante códigos estándar ( ISO3166 ). ^{[ 1 ]}

STEM incluye actualmente una gran cantidad de complementos para los 244 países y territorios dependientes definidos por el Estándar de Codificación Geográfica mantenido por la Organización Internacional de Normalización (ISO) . Estos complementos contienen datos globales , incluyendo datos geográficos , datos demográficos y modelos básicos de enfermedades . Los modelos de enfermedades distribuidos con STEM incluyen modelos epidemiológicos compartimentales . Otros complementos describen las relaciones entre regiones, incluyendo relaciones de proximidad o de vecindad, así como información sobre transporte , como conexiones por carretera y un modelo de transporte aéreo .

Las relaciones entre regiones pueden incluirse en modelos que describen la propagación de enfermedades. Para ello, STEM representa el mundo como un grafo . Los nodos corresponden a lugares o regiones, y las aristas describen las relaciones entre ellas. Tanto los nodos como las aristas pueden etiquetarse o enriquecerse con diversos datos y modelos. Esta representación gráfica se implementa mediante el marco de modelado Eclipse (EMF). Dado que un modelo puede construirse a partir de subgrafos independientes , STEM permite la composición de modelos . Los subgrafos predefinidos que definen diferentes países pueden ensamblarse mediante una interfaz de arrastrar y soltar. Se pueden añadir nuevos vectores de enfermedades a los modelos existentes simplemente añadiendo un nuevo conjunto de aristas. La arquitectura también fomenta la colaboración , ya que los usuarios pueden crear nuevos modelos y escenarios, además de intercambiarlos como componentes reutilizables, aprovechando así el trabajo de los demás. Al ser un proyecto de código abierto , se anima a los usuarios a crear sus propios complementos (tanto datos como modelos) y, si procede, a contribuir con su trabajo al proyecto.

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