La Base de Datos Espectral para Compuestos Orgánicos ( SDBS ) es una base de datos en línea gratuita y consultable alojada por el Instituto Nacional de Ciencia y Tecnología Industrial Avanzada (AIST) en Japón, que contiene datos espectrales para aproximadamente 34.000 moléculas orgánicas. [ 1 ] La base de datos está disponible en inglés y en japonés e incluye seis tipos de espectros: espectros Raman láser, espectros de masas de ionización electrónica (EI-MS), espectros infrarrojos de transformada de Fourier (FT-IR), espectros de resonancia magnética nuclear de 1H ( 1H - NMR), espectros de resonancia magnética nuclear de 13C ( 13C - NMR) y espectros de resonancia paramagnética electrónica (EPR). [ 2 ] La construcción de la base de datos comenzó en 1982. La mayoría de los espectros fueron adquiridos y registrados en AIST y algunas de las colecciones aún se están actualizando. [ 3 ] Desde 1997, se puede acceder a la base de datos de forma gratuita, pero su uso requiere aceptar una exención de responsabilidad; El número total acumulado de accesos alcanzó los 550 millones a finales de enero de 2015. [ 4 ]
Contenido
Espectros Raman láser
La base de datos contiene aproximadamente 3500 espectros Raman. Los espectros se registraron en la región de 4000 a 0 cm⁻¹ con una longitud de onda de excitación de 4800 nm y una anchura de rendija de 100 a 200 micrómetros. Esta colección no se actualiza. [ 4 ]
Espectros de masas por ionización electrónica (EI-MS)
Los espectros EI-MS se midieron en espectrómetros JEOL JMS-01SG o JEOL JMS-700, mediante el método de ionización electrónica, con un voltaje de aceleración electrónica de 75 eV y un voltaje de aceleración iónica de 8 a 10 kV. Se utilizaron sistemas de entrada directa o de depósito. La precisión del número de masas es de 0,5. Esta colección contiene aproximadamente 25 000 espectros EI-MS y se está actualizando. [ 4 ]
Espectros infrarrojos por transformada de Fourier (FT-IR)
Los espectros FT-IR se registraron utilizando un espectrómetro Nicolet 170SX o un JASCO FT/IR-410. Para los espectros registrados en el espectrómetro Nicolet, los datos se almacenaron a intervalos de 0,5 cm⁻¹ en la región de 4000 a 2000 cm⁻¹ y de 0,25 cm⁻¹ en la región de 2000 a 400 cm⁻¹, con una resolución espectral de 0,25 cm⁻¹ . Para los espectros registrados en el espectrómetro JASCO, tanto la resolución como los intervalos fueron de 0,5 cm⁻¹ . Las muestras de sólidos se prepararon mediante los métodos de disco de KBr o pasta de Nujol , y las muestras de líquidos mediante el método de película líquida . Esta colección contiene aproximadamente 54 100 espectros y se está actualizando. [ 4 ]
Espectros de RMN de 1H
Los espectros de RMN de 1H se registraron a una frecuencia de resonancia de 400 MHz con una resolución de 0,0625 Hz o a 90 MHz con una resolución de 0,125 Hz. La adquisición espectral se llevó a cabo utilizando un ángulo de giro de 22,5 a 30,0 grados y un tiempo de repetición de pulso de 30 segundos. [ 4 ] Las muestras se prepararon disolviéndolas en cloroformo deuterado (CDCl3 ) , óxido de deuterio (D2O ) o dimetilsulfóxido deuterado (DMSO-d6 ) . [ 5 ] Cada espectro se acompaña de una lista de picos con sus respectivas intensidades y desplazamientos químicos expresados en ppm y en Hz. La mayoría de los espectros muestran la asignación de picos. Esta colección contiene aproximadamente 15.900 espectros y se está actualizando. [ 4 ]
Espectros de RMN de 13C
Los espectros de RMN de 13C se registraron en varios espectrómetros con frecuencias de resonancia que oscilan entre 15 MHz y 100 MHz y una resolución que oscila entre 0,025 y 0,045 ppm. Los espectros se adquirieron utilizando un ángulo de giro de pulso de 22,5 a 45 grados y un tiempo de repetición de pulso de 4 a 7 segundos. [ 4 ] Las muestras se prepararon disolviéndolas en CDCl3 , D2O o DMSO-d6 . [ 5 ] Cada espectro va acompañado de una lista de los picos observados con sus respectivos desplazamientos químicos en ppm y sus intensidades. La mayoría de los espectros muestran la asignación de picos. Esta colección contiene aproximadamente 14 200 espectros y se está actualizando. [ 4 ]
Espectros de resonancia paramagnética electrónica (RPE)
Esta colección contiene aproximadamente 2000 espectros. Las condiciones de medición y la preparación de la muestra se describen para cada espectro en particular. Esta colección dejó de actualizarse en 1987. [ 4 ]
Búsqueda en la base de datos
Búsquedas directas
La base de datos permite realizar búsquedas introduciendo uno o más de los siguientes parámetros: nombre químico (se puede solicitar una coincidencia parcial o completa), fórmula molecular , número de tipos de átomos presentes en la molécula (como un único valor o un rango de valores), peso molecular (como un único valor o un rango de valores), número de registro CAS o número SDBS. En todos los casos, se pueden utilizar los símbolos “%” o “*” como comodines. El resultado de la búsqueda incluye todos los espectros disponibles para los parámetros introducidos. Los resultados se pueden ordenar por peso molecular, número de carbonos o número SDBS en orden ascendente o descendente. [ 6 ]
Búsquedas inversas
Si se dispone del espectro de un compuesto químico desconocido, se puede realizar una búsqueda inversa introduciendo los valores del desplazamiento químico, la frecuencia o la masa de los picos en el espectro de RMN, FT-IR o EI-MS, respectivamente. Este tipo de búsqueda proporciona todos los compuestos químicos de la base de datos que presentan las características espectrales introducidas. [ 6 ]
Referencias
- ↑ Wagner, AB (2014). «Capítulo 6: Propiedades físicas y espectros». En Currano, J.; Roth, D. (eds.). Información química para químicos: una introducción . Royal Society of Chemistry. pp. 170–171 . ISBN 978-1-84973-551-3.
- ↑ Tanabe, K.; Hayamizu, K.; Ono, S.; Wasada, N.; Someno, K; Nokana, S.; Inazumi, Y. (1991). "Sistema de base de datos espectral SDBS en PC con CD-ROM" . Analytical Sciences . 7(supl.): 711–712 . doi : 10.2116/analsci.7.Supple_711 .
- ↑ "Introducción a la base de datos espectral (SDBS)" . Chemspider . Royal Society of Chemistry . Consultado el 19 de diciembre de 2017 .
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 "Introducción a la base de datos espectral (SDBS)" . Base de datos espectral para compuestos orgánicos, SDBS . Instituto Nacional de Ciencia y Tecnología Industrial Avanzada (AIST) . Recuperado el 19 de diciembre de 2017 .
- 1 2 Tsai, CS (2002). Introducción a la bioquímica computacional . Nueva York: Wiley-Liss, Inc. págs. 95–98 . ISBN 0-471-40120-X.
- 1 2 "SDBS Compounds and Spectral Search" . Base de datos espectral para compuestos orgánicos, SDBS . Instituto Nacional de Ciencia y Tecnología Industrial Avanzada (AIST) . Consultado el 21 de diciembre de 2017 .
Enlaces externos
- Sitio web de SDBS .
- bases de datos químicas
- Bases de datos en Japón
- Resonancia magnética nuclear
- Espectroscopia infrarroja
- Espectrometría de masas
- espectroscopia Raman