Articulo de referencia

Degradación del ARNm mediada por Staufen

La degradación de ARNm mediada por Staufen (SMD) es una vía metabólica que conduce a la degradación de transcritos de ARNm específicos. Según predicciones bioinformáticas, más d...

La degradación de ARNm mediada por Staufen (SMD) es una vía metabólica que conduce a la degradación de transcritos de ARNm específicos. Según predicciones bioinformáticas, más de 1000 transcritos de ARNm podrían ser potencialmente objetivo de SMD. [ 1 ] SMD ocurre cuando la proteína Staufen se une a elementos de tallo-bucle en la región 3'UTR . Este complejo Staufen/ARN es el objetivo de varias proteínas, incluidos los factores UPF1 y UPF2 , que escindirán los ARNm objetivo. [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ] [ 6 ] . SMD ocurre cuando la proteína Staufen se une a un ARNm y recluta factores SMD (es decir, UPF1 , UPF2 ) que degradan la molécula de ARN unida a Staufen. SMD afecta potentemente el metabolismo porque se ha informado que involucra la expresión génica en más de 1000 transcritos de ARNm. Se ha descrito que la SMD es un proceso por etapas: 1) dos partículas de proteína Staufen se unen al ARNm diana mediante sus dominios de unión a ARN de doble cadena (dsRBD) 3 y 4; 2) las dos partículas Staufen se dimerizan estableciendo interacciones no covalentes entre su motivo de intercambio de Staufen (SSM) y el dsRBD5 ubicado en sus extremos C'; 3) este complejo Staufen dimerizado es reconocido por factores SMD (es decir , UPF1 y UPF2 ). Se ha descrito que, tras la eliminación del SSM, las partículas Staufen se unen al ARNm diana pero no se dimerizan y forman un complejo Staufen no dimerizado . Este complejo inhibe la SMD. [ 7 ]

Degradación de ARNm mediada por Staufen. Cuando SSM está presente, dos proteínas Staufen se unen al mismo ARNm y los extremos C-terminales de las proteínas (que contienen SSM y dsRBD5, marcados en azul y amarillo respectivamente) se dimerizan y permanecen en contacto estrecho. Este es un complejo Staufen dimerizado . Cuando la dimerización de Staufen no ocurre (por ejemplo, debido a la deleción de SSM) y se forma un complejo Staufen no dimerizado , donde las partículas proteicas aún pueden unirse al mismo ARN con la misma afinidad y estequiometría, pero los extremos C-terminales de Staufen no interactúan entre sí y permanecen libres para moverse en todas direcciones. Se ha informado que este complejo inhibe la SMD. [ 7 ]

Referencias

  1. Lucas, Bronwyn A.; Lavi, Eitan; Shiue, Lily; Cho, Hana; Katzman, Sol; Miyoshi, Keita; Siomi, Mikiko C.; Carmel, Liran; Ares, Manuel; Maquat, Lynne E. (2018-01-30). "Evidencia de evolución convergente de la degradación de ARNm mediada por Staufen dirigida por SINE" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias . 115 (5): 968– 973. doi : 10.1073/pnas.1715531115 . PMC 5798355. PMID 29339519 .  
  2. Gleghorn, Michael L.; Gong, Chenguang; Kielkopf, Clara L.; Maquat, Lynne E. (2013-04). "Staufen1 se dimeriza a través de un motivo conservado y un dominio de unión a ARN bicatenario degenerado para promover la degradación del ARNm" . Nature Structural & Molecular Biology . 20 (4): 515– 524. doi : 10.1038/nsmb.2528 . ISSN 1545-9985 . PMC 4096160. PMID 23524536 .   {{cite journal}}: Compruebe los valores de fecha en: |date=( ayuda )
  3. Park, Eonyoung; Gleghorn, Michael L.; Maquat, Lynne E. (2013-01-08). "Staufen2 funciona en la degradación de ARNm mediada por Staufen1 uniéndose a sí mismo y a su parálogo y promoviendo la actividad helicasa de UPF1 pero no la actividad ATPasa" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias . 110 (2): 405– 412. doi : 10.1073/pnas.1213508110 . ISSN 0027-8424 . PMC 3545820. PMID 23263869 .   
  4. Park, Eonyoung; Maquat, Lynne E. (2013). "Degradación de ARNm mediada por Staufen" . WIREs RNA . 4 (4): 423– 435. doi : 10.1002/wrna.1168 . ISSN 1757-7012 . PMC 3711692. PMID 23681777 .   
  5. ^ Gowravaram, Manjeera; Schwarz, Juliane; Khilji, Sana K.; Urlaub, Henning; Chakrabarti, Sutapa (7 de noviembre de 2019). "Información sobre el ensamblaje y la arquitectura de un mRNP competente en desintegración de ARNm (SMD) mediada por Staufen" . Comunicaciones de la naturaleza . 10 (1): 5054. doi : 10.1038/s41467-019-13080-x . ISSN 2041-1723 . PMC 6838198 . PMID 31699982 .   
  6. Kim, Yoon Ki; Furic, Luc; DesGroseillers, Luc; Maquat, Lynne E. (2005-01). "Mammalian Staufen1 Recruits Upf1 to Specific mRNA 3′UTRs so to Elicit mRNA Degrade" . Cell . 120 (2): 195– 208. doi : 10.1016/j.cell.2004.11.050 . ISSN 0092-8674 . {{cite journal}}: Compruebe los valores de fecha en: |date=( ayuda )
  7. ^ Tripepi , Andrea; Shakoor, Huma; Zlobina, María; Klumpler, Tomaš; Kubíčková, Monika; Houser, José; Klapetek, Petr; Lukavsky, Peter Josef (2026). "El motivo de intercambio de Staufen es crucial para la dimerización, la estructura y la descomposición del ARNm mediada por Staufen" . Ciencia de las proteínas . 35 (7): e70669. doi : 10.1002/pro.70669 . ISSN 1469-896X . PMC 13270411 . PMID 42300088 .   {{cite journal}}: CS1 mantenimiento: número de artículo como número de página ( enlace )
Obtenido de " https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Staufen-mediated_mRNA_decay&oldid=1363519134 "