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Stefan Schuster

Stefan Schuster (nacido el 7 de noviembre de 1961 en Meissen ) es un biofísico alemán. Es profesor de bioinformática en la Universidad de Jena . Vida Stefan Schuster estudió bio...

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Stefan Schuster (nacido el 7 de noviembre de 1961 en Meissen ) es un biofísico alemán. Es profesor de bioinformática en la Universidad de Jena .

Vida

Stefan Schuster estudió biofísica en la Universidad Humboldt de Berlín y escribió su tesis doctoral bajo la supervisión del profesor Reinhart Heinrich en el Departamento de Biofísica Teórica de la misma universidad (Título: " Estudios teóricos sobre la interrelación entre la jerarquía temporal en sistemas de reacción enzimática y los principios de optimización "). En 2003 obtuvo una cátedra en el Departamento de Bioinformática de la Universidad Friedrich Schiller de Jena.

Stefan Schuster es uno de los portavoces del Centro de Bioinformática de Jena (JCB).

Stefan Schuster es actualmente editor de la revista BioSystems, de la editorial Elsevier .

Su hermano menor es el director de escena Robert Schuster .

Investigación

La investigación de Stefan Schuster abarca una amplia gama de temas en bioinformática y biología de sistemas . Estos incluyen, entre otros:

Stefan Schuster ha contribuido significativamente al desarrollo del análisis de modos elementales . [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] Este método se ha utilizado ampliamente desde entonces para determinar vías metabólicas y diversas aplicaciones en biotecnología , como el cálculo de rendimientos molares óptimos . Schuster y sus colaboradores utilizaron el método, por ejemplo, para analizar la producción de penicilina [ 9 ] y el metabolismo de NAD + [ 10 ] , así como para predecir la viabilidad de mutantes de Escherichia coli . [ 11 ] Contribuyó al desarrollo de software para el análisis de vías metabólicas. [ 12 ]

Una aplicación de gran interés bioquímico es la cuestión de si los humanos y otros animales superiores podrían convertir los ácidos grasos en azúcar . Si bien los libros de texto de bioquímica indican que esto sería inviable, los análisis in silico realizados por Christoph Kaleta , Stefan Schuster y colaboradores demostraron que, en principio, existen varias rutas interrelacionadas mediante las cuales la gluconeogénesis a partir de ácidos grasos es factible. Esta predicción teórica recibió considerable atención en artículos en línea . [ 13 ] [ 14 ]

La investigación sobre las vías metabólicas incluye el análisis del balance de flujo , que se utiliza, por ejemplo, para explicar el efecto Warburg . [ 15 ]

El libro de Reinhard Heinrich y Stefan Schuster, " La regulación de los sistemas celulares " [ 16 ], fue reseñado por Athel Cornish-Bowden [ 17 ] . Escribió: "Para el público general, sería un gran avance si libros como este pudieran ayudar a derrocar las ideas de pasos limitantes de la velocidad que han atormentado la concepción bioquímica del metabolismo durante tanto tiempo, impidiendo que la biotecnología lograra muchos de los objetivos prometidos cuando la ingeniería genética se hizo posible por primera vez. Para los especialistas que ya se ocupan del comportamiento cinético de los sistemas multienzimáticos, este es un libro que necesitan tener" .

Referencias

  1. ↑ Pfeiffer, T.; Schuster, S. (2005). "Enfoques de teoría de juegos para estudiar la evolución de sistemas bioquímicos". Trends in Biochemical Sciences . 30 (1): 20– 25. doi : 10.1016/j.tibs.2004.11.006 . PMID 15653322 . 
  2. ↑ Schuster, S. (1996). "Análisis de control en términos de variables generalizadas que caracterizan los sistemas metabólicos". Journal of Theoretical Biology . 182 (3): 259– 268. Bibcode : 1996JThBi.182..259S . doi : 10.1006/jtbi.1996.0163 . PMID 8944157 . 
  3. ↑ Schuster, S.; Marhl, M.; Höfer, T. (2002). "Modelado de oscilaciones de calcio simples y complejas: De respuestas de células individuales a señalización intercelular". European Journal of Biochemistry . 269 (5): 1333– 1355. doi : 10.1046/j.0014-2956.2001.02720.x . PMID 11874447 . 
  4. ↑ Bodenstein, C.; Heiland, I.; Schuster, S. (2012). "Compensación de temperatura y sincronización en ritmos circadianos". Biología Física . 9 (3) 036011. Bibcode : 2012PhBio...9c6011B . doi : 10.1088/1478-3975/9/3/036011 . ISSN 1478-3967 . PMID 22683844. S2CID 22888493 .   
  5. ↑ Schuster, S.; de Figueiredo, LF; Schroeter, A.; Kaleta, C. (2011). "Combinación del análisis de vías metabólicas con la teoría de juegos evolutiva. Explicación de la aparición de vías de bajo rendimiento mediante un enfoque de optimización analítica". Biosystems . 105 (2): 147– 153. Bibcode : 2011BiSys.105..147S . doi : 10.1016/j.biosystems.2011.05.007 . PMID 21620931 . 
  6. ↑ Schuster, S.; Hilgetag, C.; Woods, JH; Fell, DA (2002). "Rutas de reacción en sistemas de reacción bioquímica: propiedades algebraicas, procedimiento de cálculo validado y ejemplo del metabolismo de nucleótidos". Journal of Mathematical Biology . 45 (2): 153– 181. doi : 10.1007/s002850200143 . ISSN 0303-6812 . PMID 12181603 . S2CID 18109186 .   
  7. ↑ Schuster, S; Dandekar, T; Fell, DA (1999). "Detección de modos de flujo elementales en redes bioquímicas: una herramienta prometedora para el análisis de vías y la ingeniería metabólica". Trends in Biotechnology . 17 (2): 53– 60. doi : 10.1016/S0167-7799(98)01290-6 . PMID 10087604 . 
  8. ↑ Schuster, S.; Fell, DA; Dandekar, T. (2000). "Una definición general de vías metabólicas útil para la organización sistemática y el análisis de redes metabólicas complejas". Nature Biotechnology . 18 (3): 326– 332. doi : 10.1038/73786 . ISSN 1087-0156 . PMID 10700151 . S2CID 7742485 .   
  9. ↑ Prauße, MTE; Schäuble, S.; Guthke, R.; Schuster, S. (2016). "Cálculo de las diversas vías de síntesis de penicilina y sus rendimientos molares". Biotechnology and Bioengineering . 113 (1): 173– 181. doi : 10.1002/bit.25694 . PMID 26134880 . S2CID 31216001 .  
  10. ↑ de Figueiredo, LF; Gossmann, TI; Ziegler, M.; Schuster, S. (2011). "Análisis de la vía metabólica del NAD+" (PDF) . Biochemical Journal . 439 (2): 341– 348. doi : 10.1042/BJ20110320 . ISSN 0264-6021 . PMID 21729004 .  
  11. ↑ Stelling, J.; Klamt, S.; Bettenbrock, K.; Schuster, S.; Gilles, ED (2002). "La estructura de la red metabólica determina aspectos clave de la funcionalidad y la regulación". Nature . 420 (6912): 190– 193. Bibcode : 2002Natur.420..190S . doi : 10.1038/nature01166 . ISSN 0028-0836 . PMID 12432396 . S2CID 4301741 .   
  12. ↑ Kamp, A. von; Schuster, S. (2006). "Metatool 5.0: análisis rápido y flexible de modos elementales" . Bioinformatics . 22 (15): 1930– 1931. doi : 10.1093/bioinformatics/btl267 . ISSN 1367-4803 . PMID 16731697 .  
  13. ↑ Informationsdienst Wissenschaft
  14. ↑ Ärztezeitung 2011
  15. ↑ Schuster, S.; Boley, D.; Moller, P.; Stark, H.; Kaleta, C. (2015). "Modelos matemáticos para explicar el efecto Warburg: una revisión centrada en la producción de ATP y biomasa". Biochemical Society Transactions . 43 (6): 1187– 1194. doi : 10.1042/BST20150153 . ISSN 0300-5127 . PMID 26614659 .  
  16. ↑ Heinrich, R.; Schuster, S. (1996). La regulación de los sistemas celulares . Boston, MA: Springer US. ISBN 978-1-4613-1161-4OCLC 840281317​​ 
  17. ↑ Cornish-Bowden, A. (1998). "La regulación de los sistemas celulares, por Reinhart Heinrich y Stefan Schuster, Chapman and Hall, Nueva York, 1996. 372 pp". Boletín de Biología Matemática . 59 (5): 1027– 1028. doi : 10.1016/S0092-8240(97)00050-5 .
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