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Articulo de referencia

Streptomycetaceae

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Streptomycetaceae es una familia del orden Streptomycetales . Incluye el importante género Streptomyces . Este fue el origen de muchos antibióticos , en particular la estreptomicina , el primer antibiótico contra la tuberculosis .

Genómica

Los alineamientos de secuencias de genomas de actinomicetos han llevado a la identificación de tres indels característicos conservados que son únicos del orden Streptomycetales. La enzima PBGD contiene una inserción de cuatro aminoácidos que está presente en todas las especies de Streptomyces y Kitasatospora setae , pero no en ningún otro Actinomycetota. De manera similar, una inserción de un aminoácido está presente en una región conservada de la adenilato quinasa y se encuentra en todas las especies de Streptomyces y K. setae , pero no se encuentra en ningún otro Actinomycetota. También se han identificado cinco proteínas características conservadas que están presentes en varias especies de Streptomyces secuenciadas , pero no en K. setae ; sin embargo, como el genoma completo de K. setae aún no se ha secuenciado, estas proteínas pueden estar presentes en K. setae . Adicionalmente, se han identificado 11 proteínas características conservadas que están presentes en todas las especies de Streptomyces secuenciadas y K. setae . Se cree que estas proteínas son exclusivas del orden Streptomycetales, proporcionando así marcadores moleculares que pueden usarse para distinguir este grupo del resto de Actinomycetota. Los árboles filogenéticos indican que el orden Catenulisporales está estrechamente relacionado con el orden Streptomycetales. Esta inferencia está respaldada por una inserción/deleción conservada de un aminoácido que se encuentra exclusivamente en todas las especies de Streptomycetales y en Catenulisporales acidiphilia , la única especie de Catenulisporales cuyo genoma completo ha sido secuenciado. Además, se han identificado tres proteínas características conservadas que se encuentran en todas las especies de Streptomycetales y en C. acidiphilia . Tanto la inserción/deleción conservada como las proteínas características conservadas proporcionan evidencia de que los órdenes Streptomycetales y Catenulisporales están estrechamente relacionados. [ 5 ]

Filogenia

La taxonomía actualmente aceptada se basa en la Lista de nombres procariotas con estatus en la nomenclatura (LPSN) [ 3 ] y el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI). [ 4 ]

Notas

  1. ↑ Allostreptomyces no está incluido en este árbol filogenético.

Genera incertae sedis: [ 3 ]

Véase también

Referencias

  1. ↑ Cavalier-Smith T. (2002). "El origen neomurano de las arqueobacterias, la raíz negibacteriana del árbol universal y la megaclasificación bacteriana" . Int J Syst Evol Microbiol . 52 (Pt 1): 7–76 . doi : 10.1099/00207713-52-1-7 . PMID 11837318 . 
  2. ↑ Waksman SA, Henrici AT (1943). " La nomenclatura y clasificación de los actinomicetos " . J Bacteriol . 46 (4): 337– 341. doi : 10.1128/jb.46.4.337-341.1943 . PMC 373826. PMID 16560709. S2CID 8824754 .   
  3. 1 2 3 Streptomycetaceae en LPSN ; Freese, HM; Meier-Kolthoff, JP; Sardà Carbasse, J.; Afolayan, AO; Göker, M. (29 de octubre de 2025). "TYGS y LPSN en 2025: un recurso global de datos biológicos básicos para la clasificación y nomenclatura basadas en el genoma de procariotas dentro de la Diversidad Digital de DSMZ". Nucleic Acids Research . 53 : D1– D12. doi : 10.1093/nar/gkaf1110 .
  4. 1 2 C.L. Schoch; et al. "Streptomycetaceae" . Base de datos taxonómica del Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) . Recuperado el 28 de febrero de 2025 . 
  5. ↑ Gao, B.; Gupta, RS (2012). "Marco filogenético y firmas moleculares para los principales clados del filo Actinobacteria" . Microbiology and Molecular Biology Reviews . 76 (1): 66– 112. doi : 10.1128/MMBR.05011-11 . PMC 3294427. PMID 22390973 .  
  6. ↑ Nouioui I, Carro L, García-López M, Meier-Kolthoff JP, Woyke T, Kyrpides NC, Pukall R, Klenk HP, Goodfellow M, Markus Göker M (2018). " Clasificación taxonómica basada en el genoma del filo Actinobacteria " . Front. Microbiol . 9 : 2007. doi : 10.3389/fmicb.2018.02007 . PMC 6113628. PMID 30186281 .  
  7. ↑ "El LTP" . Consultado el 10 de diciembre de 2024 .
  8. ↑ "Árbol LTP_all en formato newick" . Consultado el 10 de diciembre de 2024 .
  9. ↑ "Notas de la versión LTP_10_2024" (PDF) . Consultado el 10 de diciembre de 2024 .
  10. ↑ "GTDB versión 10-RS226" . Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 1 de mayo de 2025 .
  11. ↑ "bac120_r226.sp_label" . Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 1 de mayo de 2025 .
  12. ↑ "Historial de taxones" . Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 1 de mayo de 2025 .