localización subcelular

Las células de los organismos eucariotas se subdividen de forma compleja en compartimentos delimitados por membranas con funciones distintas. Algunos de los principales componentes de las células eucariotas son: el espacio extracelular , la membrana plasmática , el citoplasma , el núcleo , las mitocondrias , el aparato de Golgi , el retículo endoplasmático (RE), los peroxisomas , las vacuolas , el citoesqueleto , el nucleoplasma , el nucléolo , la matriz nuclear y los ribosomas .

Las bacterias también poseen localizaciones subcelulares que pueden separarse al fraccionar la célula. Las localizaciones más comunes incluyen el citoplasma , la membrana citoplasmática (también denominada membrana interna en bacterias Gram negativas ), la pared celular (que suele ser más gruesa en bacterias Gram positivas ) y el medio extracelular . El citoplasma, la membrana citoplasmática y la pared celular son localizaciones subcelulares, mientras que el medio extracelular claramente no lo es. La mayoría de las bacterias Gram negativas también poseen una membrana externa y un espacio periplásmico . A diferencia de los eucariotas, la mayoría de las bacterias carecen de orgánulos unidos a la membrana; sin embargo, existen algunas excepciones (por ejemplo, los magnetosomas ). ^{[ 1 ]}

La localización subcelular de las proteínas, determinada experimentalmente, se puede encontrar en UniProtKB , Compartments y en algunos recursos más especializados, como la base de datos del secretoma de bacterias lácticas .

También existen varias bases de datos de localización subcelular con predicciones computacionales , como la base de datos de secretoma y proteoma subcelular de hongos - versión 2 Archivada el 10/04/2016 en Wayback Machine (FunSecKB2), la base de datos de secretoma y proteoma subcelular de plantas Archivada el 06/04/2016 en Wayback Machine (PlantSecKB), MetazSecKB Archivada el 06/04/2016 en Wayback Machine para localizaciones subcelulares de proteínas de humanos y animales, y ProtSecKB para localizaciones subcelulares de proteínas de todos los protistas.

Proteome Analyst es un servidor web y un conjunto de herramientas en línea de libre acceso para predecir la localización subcelular de proteínas. ^{[ 2 ]}

• Orientación de proteínas
• Predicción de la localización subcelular de proteínas .