Articulo de referencia

TCOF1

El factor de biogénesis ribosómica Treacle 1 (TCOF1), también conocido como Treacle , es una proteína codificada en humanos por el gen TCOF1 . [ 5 ] [ 6 ] TCOF1 codifica una pro...

El factor de biogénesis ribosómica Treacle 1 (TCOF1), también conocido como Treacle , es una proteína codificada en humanos por el gen TCOF1 . [ 5 ] [ 6 ] TCOF1 codifica una proteína nucleolar con un dominio de homología LIS1. [ 7 ] La proteína Treacle participa en la transcripción del gen del ARNr mediante su interacción con el factor de unión corriente arriba (UBF). Las mutaciones en este gen se han asociado con el síndrome de Treacher Collins , un trastorno que incluye un desarrollo craneofacial anormal. Se han encontrado variantes de empalme transcripcional alternativas que codifican diferentes isoformas para este gen, pero hasta la fecha solo se han caracterizado tres de ellas. [ 6 ]

Gene

El gen TCOF1 se encuentra en el brazo largo (q) del cromosoma 5 entre las posiciones 32 y 33.1, desde el par de bases 150.357.629 hasta el par de bases 150.400.308. [ 8 ]

Función

TCOF1 participa en la producción de una molécula llamada ARN ribosómico (ARNr) dentro de las células. [ 7 ] TCOF1 es activo en el nucléolo , que es una pequeña región dentro del núcleo donde se produce el ARNr. [ 9 ] Como componente principal de las estructuras celulares llamadas ribosomas , el ARNr es esencial para el ensamblaje de proteínas. [ 10 ] Esta proteína es activa durante el desarrollo embrionario temprano en estructuras que se convertirán en huesos y otros tejidos de la cara. [ 11 ] Aunque se desconoce la función precisa de esta proteína, los investigadores creen que desempeña un papel fundamental en el desarrollo de los huesos faciales y estructuras relacionadas. [ 12 ]

Además de su interacción con UBF, se ha implicado a treacle en la metilación del precursor del ARN ribosómico maduro mediante la interacción con la proteína nucleolar pNop56. [ 13 ]

Importancia clínica

Se han identificado más de 120 mutaciones en el gen TCOF1 en personas con síndrome de Treacher Collins . La mayoría de estas mutaciones insertan o eliminan un pequeño número de unidades básicas de ADN ( pares de bases ) en el gen TCOF1. Las mutaciones en TCOF1 provocan la producción de una versión anormalmente pequeña y no funcional de la proteína treacle, o impiden que la célula la produzca. Los investigadores especulan que la pérdida de treacle reduce la producción de ARNr en las partes del embrión que se desarrollan en huesos y tejidos faciales. Se desconoce cómo la pérdida de la proteína treacle causa los problemas específicos del desarrollo facial que se observan en el síndrome de Treacher Collins. Por ejemplo, las mutaciones en el gen TCOF de estas personas suelen provocar paladar hendido . [ 14 ]

organismos modelo

Las mutaciones en este gen en los perros Jindo se han asociado con las diferencias craneales observadas entre los perros Jindo y los bóxer . [ 15 ]

Referencias

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000070814 Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000024613 Ensembl , mayo de 2017
  3. "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. Jabs EW, Li X, Coss CA, Taylor EW, Meyers DA, Weber JL (septiembre de 1991). "Mapeo del locus del síndrome de Treacher Collins en 5q31.3----q33.3" . Genomics . 11 (1): 193–198 . doi : 10.1016/0888-7543(91)90118-X . PMID 1765376 . 
  6. ^ " Gen Entrez: TCOF1 Síndrome de Treacher Collins-Franceschetti 1" .
  7. 1 2 Valdez BC, Henning D, So RB, Dixon J, Dixon MJ (julio de 2004). "El producto del gen del síndrome de Treacher Collins (TCOF1) participa en la transcripción del gen del ADN ribosomal al interactuar con el factor de unión corriente arriba" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 101 (29): 10709– 10714. Bibcode : 2004PNAS..10110709V . doi : 10.1073/pnas.0402492101 . PMC 489999. PMID 15249688 .  
  8. "Cromosoma 5: 150.357.629-150.400.308 - Región en detalle - Homo_sapiens - Navegador del genoma Ensembl 113" . asia.ensembl.org . Consultado el 26 de febrero de 2025 .
  9. Wise CA, Chiang LC, Paznekas WA, Sharma M, Musy MM, Ashley JA, et al. (abril de 1997). "El gen TCOF1 codifica una supuesta fosfoproteína nucleolar que presenta mutaciones en el síndrome de Treacher Collins a lo largo de su región codificante" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 94 (7): 3110–3115 . doi : 10.1073/pnas.94.7.3110 . PMC 20330. PMID 9096354 .   
  10. "Ribosomas, Transcripción, Traducción | Aprende ciencia en Scitable" . www.nature.com . Consultado el 25 de febrero de 2025 .
  11. "Gen TCOF1: MedlinePlus Genetics" . medlineplus.gov . Consultado el 25 de febrero de 2025 .
  12. Dixon J, Jones NC, Sandell LL, Jayasinghe SM, Crane J, Rey JP, et al. (septiembre de 2006). "Tcof1/Treacle es necesario para las deficiencias en la formación y proliferación de células de la cresta neural que causan anomalías craneofaciales" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 103 (36): 13403– 13408. doi : 10.1073/pnas.0603730103 . PMC 1557391. PMID 16938878 .   
  13. Gonzales B, Henning D, So RB, Dixon J, Dixon MJ, Valdez BC (julio de 2005). "El producto del gen del síndrome de Treacher Collins (TCOF1) está involucrado en la metilación del pre-ARNr" . Human Molecular Genetics . 14 (14): 2035–2043 . doi : 10.1093/hmg/ddi208 . PMID 15930015 . 
  14. Dixon MJ, Marazita ML, Beaty TH, Murray JC (marzo de 2011). "Labio leporino y paladar hendido: comprensión de las influencias genéticas y ambientales" . Nature Reviews. Genetics . 12 (3): 167– 78. doi : 10.1038/nrg2933 . PMC 3086810. PMID 21331089 .  
  15. Kim RN, Kim DS, Choi SH, Yoon BH, Kang A, Nam SH, et al. (junio de 2012). " Análisis del genoma del perro doméstico (jindo coreano) mediante secuenciación masiva en paralelo" . DNA Research . 19 (3): 275–287 . doi : 10.1093/dnares/dss011 . PMC 3372376. PMID 22474061 .   

Lecturas adicionales

  • Splendore A, Silva EO, Alonso LG, Richieri-Costa A, Alonso N, Rosa A, et  al. (octubre de 2000). "Alta tasa de detección de mutaciones en TCOF1 entre pacientes con síndrome de Treacher Collins revela agrupamiento de mutaciones y 16 nuevos cambios patogénicos" . Human Mutation . 16 (4): 315– 322. doi : 10.1002/1098-1004(200010)16:4 < 315::AID-HUMU4 > 3.0.CO ; 2 -H . PMID 11013442. S2CID 36109746 .  
  • Dixon MJ, Dixon J, Raskova D, Le Beau MM, Williamson R, Klinger K, et  al. (julio de 1992). "Mapeo genético y físico del locus del síndrome de Treacher Collins: refinamiento de la localización en el cromosoma 5q32-33.2". Human Molecular Genetics . 1 (4): 249– 253. doi : 10.1093/hmg/1.4.249 . PMID 1303194 . 
  • Maruyama K, Sugano S (enero de 1994). "Oligo-capping: un método simple para reemplazar la estructura de capuchón de los ARNm eucariotas con oligorribonucleótidos". Gene . 138 ( 1–2 ): 171–174 . doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 . 
  • Dixon MJ, Dixon J, Houseal T, Bhatt M, Ward DC, Klinger K, et  al. (mayo de 1993). "Reducción de la posición del locus del síndrome de Treacher Collins a un pequeño intervalo entre tres nuevos marcadores microsatélite en 5q32-33.1" . American Journal of Human Genetics . 52 (5): 907–914 . PMC 1682053. PMID 8488840 .  
  • "Clonación posicional de un gen implicado en la patogénesis del síndrome de Treacher Collins. El Grupo Colaborativo del Síndrome de Treacher Collins". Nature Genetics . 12 (2): 130– 136. Febrero de 1996. doi : 10.1038 /ng0296-130 . PMID 8563749. S2CID 34312227 .  
  • Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (septiembre de 1996). "Normalización y sustracción: dos enfoques para facilitar el descubrimiento de genes" . Genome Research . 6 (9): 791– 806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548 . 
  • Edwards SJ, Gladwin AJ, Dixon MJ (marzo de 1997). "El espectro mutacional en el síndrome de Treacher Collins revela un predominio de mutaciones que crean un codón de terminación prematura" . American Journal of Human Genetics . 60 (3): 515– 524. PMC 1712503. PMID 9042910 .  
  • Dixon J, Edwards SJ, Anderson I, Brass A, Scambler PJ, Dixon MJ (marzo de 1997). "Identificación de la secuencia codificante completa y la organización genómica del gen del síndrome de Treacher Collins" . Genome Research . 7 (3): 223– 234. doi : 10.1101/gr.7.3.223 . PMID 9074926 . 
  • Wise CA, Chiang LC, Paznekas WA, Sharma M, Musy MM, Ashley JA, et  al. (abril de 1997). "El gen TCOF1 codifica una supuesta fosfoproteína nucleolar que presenta mutaciones en el síndrome de Treacher Collins a lo largo de su región codificante" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 94 (7): 3110– 3115. Bibcode : 1997PNAS...94.3110W . doi : 10.1073/pnas.94.7.3110 . PMC 20330. PMID 9096354 .  
  • Paznekas WA, Zhang N, Gridley T, Jabs EW (septiembre de 1997). "El TCOF1 del ratón se expresa ampliamente, tiene motivos conservados en las fosfoproteínas nucleolares y se localiza en el cromosoma 18" . Biochemical and Biophysical Research Communications . 238 (1): 1– 6. doi : 10.1006/bbrc.1997.7229 . PMID 9299440 . 
  • Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (octubre de 1997). "Construcción y caracterización de una biblioteca de ADNc enriquecida en longitud completa y en el extremo 5'". Gene . 200 ( 1–2 ): 149–156 . doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID 9373149 . 
  • Marsh KL, Dixon J, Dixon MJ (octubre de 1998). "Las mutaciones en el gen del síndrome de Treacher Collins provocan una localización anómala de la proteína nucleolar treacle" . Human Molecular Genetics . 7 (11): 1795– 1800. doi : 10.1093/hmg/7.11.1795 . PMID 9736782 . 
  • Winokur ST, Shiang R (noviembre de 1998). "El producto del gen del síndrome de Treacher Collins (TCOF1), treacle, se dirige al nucléolo mediante señales en su extremo C" . Human Molecular Genetics . 7 (12): 1947–1952 . doi : 10.1093/hmg/7.12.1947 . PMID 9811939 . 
  • Jones NC, Farlie PG, Minichiello J, Newgreen DF (noviembre de 1999). "Detección de una actividad quinasa apropiada en los arcos branquiales I y II que coincide con la expresión máxima del producto génico del síndrome de Treacher Collins, treacle" . Human Molecular Genetics . 8 (12): 2239– 2245. doi : 10.1093/hmg/8.12.2239 . PMID 10545604 . 
  • Isaac C, Marsh KL, Paznekas WA, Dixon J, Dixon MJ, Jabs EW, et  al. (septiembre de 2000). " Caracterización del producto del gen nucleolar, treacle, en el síndrome de Treacher Collins" . Biología molecular de la célula . 11 (9): 3061–3071 . doi : 10.1091/mbc.11.9.3061 . PMC 14975. PMID 10982400 .  
  • Emes RD, Ponting CP (noviembre de 2001). "Un nuevo motivo de secuencia que vincula la lisencefalia, el síndrome de Treacher Collins y el síndrome orofacial-digital tipo 1, la dinámica de los microtúbulos y la migración celular" . Human Molecular Genetics . 10 (24): 2813– 2820. doi : 10.1093/hmg/10.24.2813 . PMID 11734546 . 
  • Splendore A, Jabs EW, Passos-Bueno MR (julio de 2002). "Detección de TCOF1 en pacientes de diferentes poblaciones: confirmación de puntos calientes mutacionales e identificación de una nueva mutación de sentido erróneo que sugiere un dominio funcional importante en la proteína treacle" . Journal of Medical Genetics . 39 (7): 493– 495. doi : 10.1136/jmg.39.7.493 . PMC 1735178. PMID 12114482 .  
  • Ohta S, Shiomi Y, Sugimoto K, Obuse C, Tsurimoto T (octubre de 2002). "Un enfoque proteómico para identificar proteínas de unión al antígeno nuclear de células proliferantes (PCNA) en lisados ​​de células humanas. Identificación del complejo humano CHL12/RFCs2-5 como una nueva proteína de unión a PCNA" . The Journal of Biological Chemistry . 277 (43): 40362– 40367. doi : 10.1074/jbc.M206194200 . PMID 12171929 .