La base de datos de clasificación de transportadores (o TCDB ) es un sistema de clasificación aprobado por la Unión Internacional de Bioquímica y Biología Molecular (IUBMB) para las proteínas de transporte de membrana , incluidos los canales iónicos . [1] [2] [3]
Clasificación
El nivel superior de clasificación y algunos ejemplos de proteínas con estructura 3D conocida:
1.Canalesy poros
1.A canales de tipo α
- 1.A.1 Superfamilia de canales iónicos dependientes del voltaje
- 1.A.2 Familia de canales K + rectificadores internos
- 1.A.3 Familia de canales de Ca 2+ del receptor de rianodina-inositol-1,4,5-trifosfato
- 1.A.4 Familia de canales de Ca 2+ de potencial receptor transitorio
- 1.A.5 Familia de canales catiónicos de policistina
- 1.A.6 Familia de canales epiteliales de Na +
- 1.A.7 Familia de canales catiónicos del receptor P2X regulado por ATP
- 1.A.8 Principales superfamilias de proteínas intrínsecas
- 1.A.9 Receptor de neurotransmisores, bucle Cys, familia de canales iónicos controlados por ligando
- 1.A.10 Familia de receptores de neurotransmisores con canales iónicos regulados por glutamato
- 1.A.11 Familia de transportadores de canales de amonio
- 1.A.12 Familia de canales de cloruro intracelulares
- 1.A.13 Familia de canales de cloruro epiteliales
- 1.A.14 Familia de transferencia de genes mejorada en testículos
- 1.A.15 Familia de canales catiónicos no selectivos 2
- 1.A.16 Familia de transportadores de formato-nitrito
- 1.A.17 Familia de canales de cloruro dependientes del calcio
- 1.A.18 Familia Tic110 formadora de canales aniónicos de la envoltura del cloroplasto
- 1.A.19 Familia de canales de la matriz 2 del virus de la influenza tipo A
- 1.A.20 Familia de proteínas 3 que interactúan con BCL2/Adenovirus E1B
- 1.A.21 Familia Bcl-2
- 1.A.22 Canal iónico mecanosensible de gran conductancia
- 1.A.23 Canal iónico mecanosensible de pequeña conductancia
- 1.A.24 Familia de conexinas formadoras de uniones estrechas
- 1.A.25 Familia de inexinas formadoras de uniones en hendidura
- 1.A.26 Familia de transportadores E de Mg 2+
- 1.A.27 Familia de los fosfolemanes
- 1.A.28 Familia de transportadores de urea
- 1.A.29 Familia de canales de urea/amida
- 1.A.30 Superfamilia de energizadores de transporte de membrana externa bacterianos MotAB que translocan H+ o Na+
- 1.A.31 Familia de anexinas
- 1.A.32 Familia de canales NB del virus de la influenza tipo B
- 1.A.33 Familia de proteínas de choque térmico formadoras de canales catiónicos 70
- 1.A.34 Familia de complejos formadores de canales similares a uniones gap de Bacillus
- 1.A.35 Familia de transportadores de iones metálicos CorA
- 1.A.36 Familia de canales de cloruro intracelulares
- 1.A.37 Familia de canales de Ca2+ CD20
- 1.A.38 Familia de reguladores de pH del aparato de Golgi
- 1.A.39 Familia de canales CM2 del virus de la influenza tipo C
- 1.A.40 Familia de canales Vpu del virus de inmunodeficiencia humana tipo I
- 1.A.41 Reovirus aviar p10 Familia de vorporinas
- 1.A.42 Familia de proteínas virales R del VIH
- 1.A.43 Resistencia al alcanfor o familia exportadora de fluoruro
- 1.A.44 Proteína de la punta de la cola formadora de poros pb2 de la familia del fago T5
- 1.A.45 Familia de inyectosomas del fago P22
- 1.A.46 Familia de bestrofinas formadoras de canales aniónicos
- 1.A.47 Canal selectivo de aniones sensible a nucleótidos, familia ICln
- 1.A.48 Canal de aniones Familia Tweety
- 1.A.49 Coronavirus humano ns12.9 familia de viroporinas
- 1.A.50 Familia de fosfolamban (canal de Ca 2+ y regulador de la ATPasa de Ca 2+ )
- 1.A.51 La familia de canales de protones dependientes del voltaje (VPC)
- 1.A.52 La familia de canales de Ca 2+ activados por liberación de Ca 2+ (CRAC) (CRAC-C)
- 1.A.53 La familia del canal selectivo de cationes de viroporina P7 del virus de la hepatitis C (HCV-P7)
- 1.A.54 La familia de canales de fuga de Ca 2+ del retículo endoplasmático de presenilina (presenilina)
- 1.A.55 El canal de Ca 2+ asociado a vesículas sinápticas , familia Flower (Flor)
- 1.A.56 La familia de transportadores de cobre (Ctr)
- 1.A.57 La viroporina del coronavirus humano del SARS (SARS-VP)
- 1.A.58 La familia de proteínas de matriz 2 del virus de la influenza tipo B (BM2-C)
- 1.A.59 La familia de péptidos formadores de poros del virus de la bursitis, Pep46 (Pep46)
- 1.A.60 La familia de péptidos preformadores de reovirus de mamíferos, Mu-1 (Mu-1)
- 1.A.61 La familia de la cadena formadora de canales F (péptido gamma) de los nodavirus de insectos
- 1.A.62 La familia de canales catiónicos homotriméricos (TRIC)
- 1.A.63 La porina α-helicoidal de la membrana externa de Ignicoccus (familia I-OMP)
- 1.A.64 La familia de las plasmolipinas (Plasmolipin)
- 1.A.65 La familia de proteínas viroporina E del coronavirus (Viroporina E)
- 1.A.66 La familia Pardaxin (Pardaxin)
- 1.A.67 La familia de transportadores de membrana Mg 2+ (MMgT)
- 1.A.68 La familia de viroporinas hidrofóbicas pequeñas virales (V-SH)
- 1.A.69 La familia de canales receptores de olores heteroméricos (HORC)
- 1.A.70 La molécula contra los microbios A (MamA)
- 1.A.71 La familia de canales de proteína soluble en ácido cerebral (canal BASP1)
- 1.A.72 La superfamilia Mer
- 1.A.73 La familia de proteínas de lisis de colicina (CLP)
- 1.A.74 La familia Mitsugumin 23 (MG23)
- 1.A.75 El nociceptor mecánico, familia piezo (piezo)
- 1.A.76 La familia del transportador de magnesio 1 (MagT1)
- 1.A.77 La familia de uniportadores Mg 2+ /Ca 2+ (MCU)
- 1.A.78 La familia de canales selectivos de K + en endosomas y lisosomas (KEL)
- 1.A.79 La proteína de captación de colesterol (ChUP) o familia de captación de ARN bicatenario
- 1.A.80 La familia de viroporinas NS4a (NS4a)
- 1.A.81 La familia de canales Ca 2+ de baja afinidad (LACC)
- 1.A.82 La familia de canales de mecanotransducción de células ciliadas (HCMC)
- 1.A.83 La familia de viroporinas VP2 del virus SV40 (SV40 VP2)
- 1.A.84 La familia de canales Ca 2+ moduladores de la homeostasis del calcio (CALHM-C)
- 1.A.85 La familia de viroporinas del poliovirus 2B (Viroporina 2B)
- 1.A.86 Familia de viroporinas L2 del virus del papiloma humano tipo 16 (HPV16)
- 1.A.87 La familia de canales de calcio mecanosensibles (MCA)
- 1.A.88 La familia de canales de potasio fúngicos (F-Kch)
- 1.A.89 La familia de viroporinas del coronavirus humano 229E (229E Viroporin)
- 1.A.90 Familia de viroporinas del metaneumovirus humano (HMPV) (HMPV-Viroporin)
- 1.A.91 La familia de proteínas asexuales ligadas a la citoadherencia 3.2 de Plasmodium falciparum (Clag3)
- 1.A.92 La familia de viroporinas VP10 (RVP10) del reovirus
- 1.A.93 La familia de la proteína no estructural 3 viroporina (NS3) del virus de la lengua azul
- 1.A.94 Familia de viroporinas de glucoproteína 4 no estructural (NSP4) del rotavirus
- 1.A.95 La familia de viroporinas del efemeróvirus (EVVP)
- 1.A.96 La familia de viroporinas del poliomavirus humano (PVVP)
- 1.A.97 Familia de viroporinas E5 del virus del papiloma humano tipo 16 (HPV-E5)
- 1.A.98 Familia de proteínas P13 del virus linfotrópico de células T humanas 1 (HTLV1-P13)
- 1.A.99 La familia de proteínas de membrana pequeña de la envoltura del virus de la bronquitis infecciosa (IBV-E)
- 1.A.100 La familia putativa de viroporinas Rhabdoviridae, U5 (RV-U5)
- 1.A.101 La familia de formadores de poros peroxisomales Pex11 (Pex11)
- 1.A.102 Familia de viroporinas PB1-F2 (PB1-F2) de la influenza A
- 1.A.103 Familia SH (SV5-SH) del virus simio 5 (virus parainfluenza 5)
- 1.A.104 La propuesta de biosíntesis flagelar del canal Na + , la familia FlaH (FlaH)
- 1.A.105 La familia de dominios similares a quinasas de linaje mixto (MLKL)
- 1.A.106 La familia de canales de calcio activados por carga de calcio (CLAC)
- 1.A.107 La familia de las globinas formadoras de poros (globinas)
1.B.Porinas de barril βy otras proteínas de la membrana externa
- 1.B.1 Familia general de porinas bacterianas
- 1.B.2 Familia de porinas clamidiales (CP)
- 1.B.3 Familia de porinas de azúcar (SP)
- 1.B.4 Familia de porinas de Brucella-Rhizobium (BRP)
- 1.B.5 Familia de porinas OprP (POP) de Pseudomonas
- 1.B.6 Familia de porinas OmpA-OmpF (OOP)
- 1.B.7 Familia de porinas de Rhodobacter PorCa (RPP)
- 1.B.8 Familia de porinas mitocondriales y plástidas (MPP)
- 1.B.9 Familia de proteínas de membrana externa FadL (FadL)
- 1.B.10 Familia de porinas de membrana externa formadoras de canales específicos de nucleósidos (Tsx)
- 1.B.11 Familia de porinas usher fimbriales de membrana externa (FUP)
- 1.B.12 Familia de autotransportadores-1 (AT-1)
- 1.B.13 Familia de porinas exportadoras de alginato (AEP)
- 1.B.14 Familia de receptores de membrana externa (OMR)
- 1.B.15 Familia de porinas de rafinosa (RafY)
- 1.B.16 Familia de porinas amida y urea de cadena corta (SAP)
- 1.B.17 Familia del factor de membrana externa (OMF)
- 1.B.18 Familia de proteínas auxiliares de la membrana externa (OMA)
- 1.B.19 Familia de porinas OprB selectivas de glucosa (OprB)
- 1.B.20 Familia de secreción de dos socios (TPS)
- 1.B.21 Familia de porinas OmpG (OmpG)
- 1.B.22 Familia de las secretinas de la membrana bacteriana externa (secretinas)
- 1.B.23 Familia de porinas cianobacterianas (CBP)
- 1.B.24 Porina micobacteriana
- 1.B.25 Familia de porinas de membrana externa (Opr)
- 1.B.26 Familia de porinas de ciclodextrina (CDP)
- 1.B.31 Familia de porinas principales de la membrana externa (MomP) de Campylobacter jejuni
- 1.B.32 Familia de porinas de membrana externa fusobacterianas (FomP)
- 1.B.33 Familia de porinas de inserción de proteínas de membrana externa (complejo Bam) (OmpIP)
- 1.B.34 Porinas corinebacterianas
- 1.B.35 Familia de porinas específicas de oligogalacturonato (KdgM)
- 1.B.39 Porina bacteriana, familia OmpW (OmpW)
- 1.B.42 Familia de porinas exportadoras de lipopolisacáridos de membrana externa (LPS-EP)
- 1.B.43 Familia de porinas P1 de Coxiella (CPP1)
- 1.B.44 Probable translocación de proteínas de la familia de porinas de Porphyromonas gingivalis (PorT)
- 1.B.49 Familia de porinas de Anaplasma P44 (A-P44)
- 1.B.48 Transportadores tipo Curli
- 1.B.54 Familia de intimina /invasina (Int/Inv) o autotransportador-3
- 1.B.55 Familia de porinas de poliacetil-D-glucosamina (PgaA)
- 1.B.57 Familia de proteínas principales de membrana externa de Legionella (LM-OMP)
- 1.B.60 Familia de porinos Omp50 (Omp50 Porin)
- 1.B.61 Familia de porinas proteobacterianas delta (Delta-porinas)
- 1.B.62 Familia putativa de porinas bacterianas (PBP)
- 1.B.66 Familia putativa de porinas-2 de barril beta (BBP2)
- 1.B.67 Supuesta familia de porinas-4 de barril beta (BBP4)
- 1.B.68 Supuesta superfamilia de porinas-5 de barril beta (BBP5)
- 1.B.70 Familia de canales de membrana externa (OMC)
- 1.B.71 Familia de porinas proteobacterianas/verrucomicrobianas (PVP)
- 1.B.72 Familia de porinas de la membrana externa de la protoclamidia (PomS/T)
- 1.B.73 Familia de biogénesis/ensamblaje de cápsulas (CBA)
- 1.B.78 DUF3374 Familia de porinas asociadas al transporte de electrones (ETPorin)
1.CToxinas formadoras de poros(proteínas y péptidos)
- 1.C.3 Familia α- hemolisina (αHL)
- 1.C.4 Familia de las aerolisinas
- 1.C.5 Familia de ε-toxinas
- 1.C.11 Superfamilia de toxinas RTX
- 1.C.12 Complejo de ataque de membrana/superfamilia de perforinas
- 1.C.13 Familia de leucocidinas
- 1.C.14 Familia de citohemolisinas (CHL)
- 1.C.39 Familia de citolisinas dependientes del colesterol activadas por tiol
- 1.C.43 Familia de las liseninas
- 1.C.56 Familia de canales catiónicos HrpZ de Pseudomonas syringae
- 1.C.57 Familia de citotoxinas clostridiales
- 1.C.58 La familia de microcinas E492/C24 (Microcin E492)
- 1.C.74 Familia de citotoxinas de serpiente (SCT)
- 1.C.97 Familia de pleurotolisinas formadoras de poros
1.D Canales no sintetizados ribosómicamente
- 1.D.1 La familia de canales de gramicidina A
- 1.D.2 La familia de siringomicinas formadoras de canales
- 1.D.3 La familia de siringopeptinas formadoras de canales
- 1.D.4 La familia formadora de canales Tolaasin
- 1.D.5 La familia de antibióticos formadores de canales de alameticina o peptaibol
- 1.D.6 La familia de canales Ca 2+ de poli 3-hidroxibutirato complejados (cPHB-CC)
- 1.D.7 La familia de las beticolinas
- 1.D.8 La familia de las saponinas
- 1.D.9 La familia de canales iónicos de poliglutamina (PG-IC)
- 1.D.10 La familia de canales formadores de ceramidas
- 1.D.11 La familia de las surfactinas
- 1.D.12 La familia Beauvericin (Beauvericin)
- 1.D.13 Antibióticos peptídicos anfipáticos de administración de ADN (DAPA)
- 1.D.14 La familia de péptidos formadores de canales anfipáticos sintéticos Leu/Ser (l/S-SCP)
- 1.D.15 La familia de la daptomicina (Daptomycin)
- 1.D.16 La familia de heptapéptidos formadores de poros anfipáticos sintéticos (SAPH)
- 1.D.17 Familia de péptidos de lámina β formadores de poros y de diseño combinatorio
- 1.D.18 La familia de conjugados de guanosina y ácido biliar formadores de poros
- 1.D.19 Fármaco formador de canales de Ca 2+ , familia de las digitoxinas
- 1.D.20 La familia de agentes antibióticos/fúngicos macrólidos poliénicos formadores de poros (PMAA)
- 1.D.21 La familia de nanoporos lipídicos (LipNP)
- 1.D.22 El pigmento carotenoide translocador de protones, familia de la zeaxantina
- 1.D.23 Familia de antimicrobianos formadores de poros de feniletilenglicol (PEPA)
- 1.D.24 La familia de las esponjas marinas politeonamida B (pTB)
- 1.D.25 La familia de los foldámeros de arilamina (AAF)
- 1.D.26 La familia del alcohol dihidrodeshidrodiconiferílico 9'-O-β-D-glucósido (DDDC9G)
- 1.D.27 La familia de isósteros de tiourea
- 1.D.28 La familia de lipopeptidil-butadieno
- 1.D.29 La familia de oligocolatos macrocíclicos
- 1.D.30 La familia de canales artificiales de pilar[5]areno con hidrazida adjunta (HAPA-C)
- 1.D.31 La familia de la anfotericina B
- 1.D.32 La familia de novicidinas formadoras de poros
- 1.D.33 La familia de politeonamidas B formadoras de canales
- 1.D.34 Los oligoésteres formadores de canales Bolaamphiphiles
- 1.D.35 La familia de lipodepsipéptidos cíclicos formadores de poros
- 1.D.36 La familia de canales iónicos de oligoborneno
- 1.D.37 La familia Hibicuslide C
- 1.D.38 La familia de nanotubos peptídicos cíclicos (cPepNT)
- 1.D.39 La familia de canales iónicos moleculares anfifílicos basados en azobenceno controlados por luz (AAM-IC)
- 1.D.40 La familia de poros toroidales lipídicos inducidos por proteínas
- 1.D.41 La familia de los ionóforos de tipo esprotetonato (espirohexanólidos)
- 1.D.42 La familia de canales de areno-pilar tripéptido Phe-Arg[5] (TPPA-C)
- 1.D.43 La familia de canales de dinucleósido de guanosina adaptados a triazol (TT-GDN-C)
- 1.D.44 La familia de canales iónicos sintéticos con ferroceno redox-activo (ICRF)
- 1.D.45 La familia de poros de membrana de sonoporación y electroporación (SEMP)
- 1.D.46 La familia de nanoporos de ADN (DnaNP)
- 1.D.47 La familia de péptidos cíclicos sintéticos formadores de poros (PSCP)
- 1.D.48 La familia de siringomicina E formadora de poros
- 1.D.49 La familia de canales transmembrana de radicales carotenoides (CRC)
- 1.D.50 La familia de transportadores de aniones bis-catecol anfifílicos (AC-AT)
- 1.D.51 La familia de nanoporos de proteínas (ProNP)
- 1.D.52 La familia de nanoporos de macrociclos de oligoamidas aromáticas (OmnNP)
- 1.D.53 La familia de nanotubos peptídicos alfa y gamma (a,gPepNT)
- 1.D.54 La familia de canales iónicos hexil-benzoureido-15-corona-5-éter (HBEC) selectivos de potasio
- 1.D.55 La familia de nanoporos basados en porfirina (PorNP)
- 1.D.56 La familia de nanoporos oligoméricos alfa-aminoisobutirato (Aib) (AibNP)
- 1.D.57 La familia de electroporos lipídicos (LEP)
- 1.D.58 La familia de prodigiosenos transportadores de aniones (Prodigiosene)
- 1.D.59 La familia de las perenosinas transportadoras de aniones (perenosinas)
- 1.D.60 La familia de péptidos alfa, gamma-cíclicos (AGCP)
- 1.D.61 La familia de 2,6-bis(bencimidazol-2-il)piridinas anionofóricas (ABBP)
- 1.D.62 La familia de derivados de bis-triazolil diguanosina que forman canales (TDG)
- 1.D.63 La familia de nanoporos basados en péptidos (PepNP)
- 1.D.64 La familia de nanotubos de carbono (CarNT)
- 1.D.65 La familia de los anfidinol formadores de poros (Amphidinol)
- 1.D.66 La familia de nanoporos de macromoléculas helicoidales (HmmNP)
- 1.D.67 La familia de canales iónicos peptídicos helicoidales modificados con éter de corona (CEHP)
- 1.D.68 La familia de polímeros en bloque pleurónicos formadores de poros (PPBP)
- 1.D.69 La familia de nanoporos cónicos (ConNP)
- 1.D.70 La familia de nanoporos metálicos (Au/Ag/Pt/grafeno) (MetNP)
- 1.D.71 La familia de péptidos sintéticos TP359 (TP359)
- 1.D.72 La familia de receptores trípodes basados en triazina transportadores de cloruro (CCTTR)
- 1.D.73 La familia de nanoporos de sílice mesoporosos (SilNP)
- 1.D.74 La familia de poros rígidos sintéticos de p-octifenilo sensibles al estímulo (SSROP)
1.EHolins
1.FFusión de vesículasporos
- 1.F.1 La familia de poros de fusión de vesículas sinaptosómicas (poros SVF)
- 1.F.2 La familia de exocistos octaméricos (exocistos)
1.GFusión viralporos
- 1.G.1 La familia de proteínas de fusión de membrana formadoras de poros virales 1 (VMFP1)
- 1.G.2 La familia de proteínas de fusión de membrana formadoras de poros virales 2 (VMFP2)
- 1.G.3 La familia de proteínas de fusión de membrana formadoras de poros virales 3 (VMFP3)
- 1.G.4 La familia de proteínas de fusión de membrana formadoras de poros virales 4 (VMFP4)
- 1.G.5 La familia de proteínas de fusión de membrana formadoras de poros virales 5 (VMFP5)
- 1.G.6 La familia de proteínas de fusión hepadnavirales S (proteína HBV-S)
- 1.G.7 La familia de proteínas de fusión FAST del reovirus (R-FAST)
- 1.G.8 La familia de proteínas de fusión de arenavirus (AV-FP)
- 1.G.9 La familia de las sincitinas (Syncytin)
- 1.G.10 La familia del complejo de fusión de membrana del virus del herpes simple (HSV-MFC)
- 1.G.11 Familia del complejo de proteínas de entrada celular del virus de la viruela (PEP-C)
- 1.G.12 La familia de proteínas de fusión gp95 del virus de la leucosis aviar (ALV-gp95)
- 1.G.13 La familia de virus transmembrana pequeños asociados a la fusión (FAST) de orthoreovirus
- 1.G.14 La familia de proteínas formadoras de poros de fusión/hemaglutinina del virus de la influenza (Influenza-H/FPP)
- 1.G.15 Familia de la glicoproteína principal de envoltura GP64 (GP64) del virus de la polihedrosis nuclear de Autographa californica
- 1.G.16 La familia de péptidos de fusión (VIH-FP) del virus de inmunodeficiencia humana tipo 1 (VIH-1)
- 1.G.17 La familia de glicoproteínas de la envoltura del virus de la leucemia bovina (BLV-Env)
- 1.G.18 El péptido de fusión SARS-CoV en la familia de precursores de la glicoproteína de la espícula (SARS-FP)
- 1.G.19 Familia de complejos de fusión de membrana formadores de poros de rotavirus (CMC de rotavirus)
- 1.G.20 La familia de glicoproteínas de fusión de la envoltura Gc del hantavirus (Gc-EFG)
- 1.G.21 Familia Gp42 (Gp42) del virus de Epstein Barr (virus del herpes humano 4)
- 1.G.22 La familia de la glicoproteína gO (gO) del citomegalovirus (virus del herpes humano 5)
1.H Canales paracelulares
- 1.H.1 La familia Claudin Tight Junction (Claudin1)
- 1.H.2 La familia de invertebrados PMP22-Claudin (Claudin2)
1.I Canales unidos a membrana
- 1.I.1 Familia de complejos de poros nucleares , incluidas las carioferinas
- 1.I.2 Familia de los plasmodesmos vegetales
2. Transportadores impulsados por potencial electroquímico
2.A Porteadores (Uniportadores,simportadores,antiportadores)
- 2.A.1 Superfamilia de facilitadores mayores (MFS), véase también permeasa de lactosa , permeasa de fosfato y transportador de glucosa
- 2.A.2 La familia de simportadores de cationes glicósido-pentósido-hexurónido (GPH)
- 2.A.3 La familia de organocationes de aminoácidos y poliaminas (APC)
- 2.A.4 Familia de facilitadores de difusión de cationes (CDF)
- 2.A.5 Familia de permeasas de zinc (Zn 2+ )-hierro (Fe 2+ )
- 2.A.6 Superfamilia de resistencia-nodulación-división celular , véase también proteína de membrana exportadora de proteína SecDF
- 2.A.7 La superfamilia de transportadores de fármacos y metabolitos (DMT)
- 2.A.8 La familia de simportadores gluconato:H + (GntP)
- 2.A.9 La familia de las insertasas de proteínas de membrana (YidC/Alb3/Oxa1)
- 2.A.10 La familia del transportador de 2-ceto-3-desoxigluconato (KdgT)
- 2.A.11 La familia de simportadores citrato-Mg 2+ :H + (CitM) citrato-Ca 2+ :H + (CitH) (CitMHS)
- 2.A.12 Familia de antiportadores ATP:ADP
- 2.A.13 La familia de captación de dicarboxilato C4 (Dcu)
- 2.A.14 Familia de la permeasa de lactato
- 2.A.15 La familia de transportadores de betaína/carnitina/colina (BCCT)
- 2.A.16 Familia de transportadores de dicarboxilato y resistencia al telurito
- 2.A.17 Familia de transportadores de oligopéptidos dependientes de protones
- 2.A.18 La familia de permeasas de aminoácidos/auxinas (AAAP)
- 2.A.19 La familia de antiportadores de cationes Ca 2+ (CaCA)
- 2.A.20 La familia de transportadores de fosfato inorgánico (PiT)
- 2.A.21 Familia de simportadores de soluto y sodio
- 2.A.22 La familia de simportadores de sodio y neurotransmisores
- 2.A.23 La familia de simportadores de dicarboxilato/aminoácido:catión (Na + o H + ) (DAACS)
- 2.A.24 La familia del transportador de 2-hidroxicarboxilato (2-HCT)
- 2.A.25 Familia de simportadores de cationes de alanina o glicina (AGCS)
- 2.A.26 La familia de simportadores de aminoácidos de cadena ramificada: cationes (LIVCS)
- 2.A.27 La familia de simportadores glutamato:Na + (ESS)
- 2.A.28 Ácidos biliares: Na + Familia Symporter
- 2.A.29 Familia portadora mitocondrial
- 2.A.30 Familia de cotransportadores de cationes y cloruros (CCC)
- 2.A.31 Familia de intercambiadores de aniones
- 2.A.32 La familia de transportadores de silicio (Sit)
- 2.A.33 Familia NhaA Na + :H + Antiportador (NhaA)
- 2.A.34 La familia de antiportadores Na + :H + (NhaB) de NhaB
- 2.A.35 La familia de antiportadores Na + :H + (NhaC) de NhaC
- 2.A.36 Familia de antiportadores de protones monovalentes de cationes-1 (CPA1)
- 2.A.37 Familia de antiportadores de protones monovalentes de cationes-2 (CPA2)
- 2.A.38 Familia de transportadores K + (Trk)
- 2.A.39 Familia de simportadores de nucleobases y cationes 1 (NCS1)
- 2.A.40 Familia de simportadores de nucleobases y cationes-2 (NCS2)
- 2.A.41 La familia de transportadores de nucleósidos concentrativos (CNT)
- 2.A.42 La familia de permeasas de aminoácidos aromáticos e hidroxi (HAAAP)
- 2.A.43 La familia del transportador de cistina lisosomal (LCT)
- 2.A.45 Familia de eflujos de arsenito-antimonita
- 2.A.46 La familia de simportadores benzoato:H + (BenE)
- 2.A.47 Anión divalente: Na + familia simportadora (DASS)
- 2.A.48 La familia de transportadores de folato reducido (RFC)
- 2.A.49 Familia de portadores/canales de cloruro (ClC)
- 2.A.50 La familia de captación de glicerol (GUP)
- 2.A.51 La familia de transportadores de iones de cromato (CHR)
- 2.A.52 La familia de transportadores Ni 2+ -Co 2+ (NiCoT)
- 2.A.53 Familia de la permeasa de sulfato (SulP)
- 2.A.54 La familia de transportadores tricarboxilato mitocondriales (MTC)
- 2.A.55 La familia de transportadores de iones metálicos (Mn 2+ -hierro) (Nramp)
- 2.A.56 La familia de transportadores periplásmicos independientes de ATP tripartitos (TRAP-T)
- 2.A.57 La familia de transportadores de nucleósidos equilibrantes (ENT)
- 2.A.58 La familia de simportadores de fosfato:Na + (PNaS)
- 2.A.59 La familia de resistencia arsenical-3 (ACR3)
- 2.A.60 Familia de transportadores de aniones orgánicos (OAT)
- 2.A.61 La familia de captación de dicarboxilato C4 (DcuC)
- 2.A.62 Familia de antiportadores NhaD Na + :H + (NhaD)
- 2.A.63 El catión monovalente (K + o Na + ): Familia del antiportador de protones-3 (CPA3)
- 2.A.64 Familia de diana de arginina gemela (Tat)
- 2.A.65 La familia de transportadores de bilirrubina (BRT)
- 2.A.66 La superfamilia de flipasas de múltiples fármacos/oligosacáridos-lípidos/polisacáridos (MOP)
- 2.A.67 La familia de transportadores de oligopéptidos (OPT)
- 2.A.68 La familia del transportador de p-aminobenzoil-glutamato (AbgT)
- 2.A.69 La familia de portadores de eflujo de auxina (AEC)
- 2.A.70 La familia de simportadores malonato:Na + (MSS)
- 2.A.71 La familia de transportadores de folato-biopterina (FBT)
- 2.A.72 La familia de permeasas de captación de K + (KUP)
- 2.A.73 La familia de captación de ácidos grasos de cadena corta (AtoE)
- 2.A.74 La familia de transportadores endosómicos de múltiples fármacos (MET) 4 TMS
- 2.A.75 La familia de exportadores de L-lisina (LysE)
- 2.A.76 La resistencia a la familia Homoserina/Treonina (RhtB)
- 2.A.77 La familia de resistencia al cadmio (CadD)
- 2.A.78 La familia de exportadores de aminoácidos de cadena ramificada (LIV-E)
- 2.A.79 La familia de exportadores de treonina/serina (ThrE)
- 2.A.80 La familia de transportadores de tricarboxilato (TTT)
- 2.A.81 La familia de intercambiadores de aspartato:alanina (AAEx)
- 2.A.82 La familia de transportadores de solutos orgánicos (OST)
- 2.A.83 La familia de transportadores de bicarbonato dependientes de Na + (SBT)
- 2.A.84 La familia de exportadores de maltosa de cloroplastos (MEX)
- 2.A.85 La familia de exportadores de ácidos aromáticos (ArAE)
- 2.A.86 La familia del exportador autoinductor-2 (AI-2E) (anteriormente la familia PerM, TC n.° 9.B.22)
- 2.A.87 La familia del transportador de riboflavina procariota (P-RFT)
- 2.A.88 Familia de transportadores de captación de vitaminas (VUT o ECF)
- 2.A.89 La familia de transportadores de hierro vacuolar (VIT)
- 2.A.90 Familia de receptores/transportadores de vitamina A (STRA6)
- 2.A.91 Complejo de importación de ARNt mitocondrial (M-RIC) (anteriormente 9.C.8)
- 2.A.92 La familia de transportadores de colina (CTL)
- 2.A.94 La familia de las permeasas de fosfato (Pho1)
- 2.A.95 La familia de transportadores de aminoácidos neutros (NAAT) 6TMS
- 2.A.96 La familia de transportadores de captación de acetato (AceTr)
- 2.A.97 La familia de intercambiadores de K + /H + y Ca2 + /H + de la membrana interna mitocondrial (LetM1)
- 2.A.98 La familia de exportadores putativos de sulfato (PSE)
- 2.A.99 La familia de transportadores de captación de Ni 2+ 6TMS (HupE-UreJ)
- 2.A.100 La familia de las ferroportinas (Fpn)
- 2.A.101 La familia de captación de malonato (MatC) (anteriormente UIT1)
- 2.A.102 La familia de permeasas de captación de 4-toluenosulfonato (TSUP)
- 2.A.103 La familia de exportadores de precursores de mureína (MPE) bacterianos
- 2.A.104 La familia de exportadores de L-alanina (AlaE)
- 2.A.105 La familia de transportadores de piruvato mitocondrial (MPC)
- 2.A.106 La familia de antiportadores Ca 2+ :H + 2 (CaCA2)
- 2.A.107 La familia de exportadores de MntP Mn 2+ (MntP)
- 2.A.108 La familia de transportadores de hierro/plomo (ILT)
- 2.A.109 La familia de resistencias iónicas de telurio (TerC)
- 2.A.110 El transportador de hemo, familia de proteínas génicas sensibles al hemo (HRG)
- 2.A.111 La familia de antiportadores Na + /H +-E (NhaE)
- 2.A.112 La familia de antígenos del grupo sanguíneo KX (KXA)
- 2.A.113 La familia de transportadores de níquel/cobalto (NicO)
- 2.A.114 La familia de transportadores de péptidos putativos de inanición de carbono CstA (CstA)
- 2.A.115 La familia de exportadores de novobiocina (NbcE)
- 2.A.116 La familia de proteínas de direccionamiento de peptidoglicolípidos (GAP)
- 2.A.117 La familia de exportadores de clorhexidina (CHX)
- 2.A.118 La familia de antiportadores de aminoácidos básicos (ArcD)
- 2.A.119 La familia de exportadores organoarsénicos (ArsP)
- 2.A.120 La supuesta familia de permeasas de aminoácidos (PAAP)
- 2.A.121 La familia de transportadores de sulfato (CysZ)
- 2.A.122 La familia de proteínas auxiliares similares a holina LrgB/CidB (LrgB/CidB)
- 2.A.123 La familia Sweet; PQ-loop; Saliva; MtN3 (Sweet)
- 2.A.124 La familia de los exportadores de lisina (LysO)
- 2.A.125 La familia del transportador de riboflavina eucariota (E-RFT)
- 2.A.126 La familia de exportadores de ácidos grasos (FAX)
- 2.A.127 Familia de transportadores de cardiolipina (CLT) enterobacterianos
2.B Portadores no sintetizados ribosómicamente
- 2.B.1 La familia de portadores de valinomicina
- 2.B.2 La familia de las monensinas
- 2.B.3 La familia de las nigericinas
- 2.B.4 La familia de antibióticos macrotetrólidos (MA)
- 2.B.5 La familia de poliéteres macrocíclicos (MP)
- 2.B.6 La familia de las ionomicinas
- 2.B.7 La familia de translocación de fosfolípidos peptídicos de hélice α transmembrana (TMP-PLT)
- 2.B.8 La familia de la bafilomicina A1 (Bafilomicina)
- 2.B.9 La familia funcional de péptidos penetrantes de células (CPP)
- 2.B.10 La CPP sintética, familia transportana
- 2.B.11 La familia de ionóforos de tipo portador de calcimicina o A23187
- 2.B.12 La familia de las salinomicinas
- 2.B.13 La familia de antiportadores de aniones macrocíclicos tetrapirrólicos (TPMC-AA)
- 2.B.14 La familia de ionóforos (lasalocid) Lasalocid A o X-537A
- 2.B.15 La familia de portadores de cloruro basados en trípodes de tris-tiourea (TTT-CC)
- 2.B.16 La familia de portadores de aniones compuestos que contienen enlaces halógenos (HCAC)
- 2.B.17 La familia de cotransportadores (IDC) del derivado de isoftalamina H + :Cl−
- 2.B.18 La familia de cotransportadores H+:Cl − del derivado de piridina-2,6-dicarboxamina (PDCA)
- 2.B.19 La familia de derivados de Calix(4)pirrol (C4P)
- 2.B.20 La familia de intercambiadores de cloruro/bicarbonato de prodigiosina (Prodigiosin)
- 2.B.21 La familia de transportadores de aniones derivados de orto-fenilendiamina-bis-urea (oPDA-U)
- 2.B.22 La familia de transportadores de aniones funcionalizados con imidazolio (IAT)
- 2.B.23 Antiportador sintético homotetramérico transmembrana Zn 2+ /Co 2+ :protón, familia Rocker (Rocker)
- 2.B.24 La familia de transportadores de aniones 2,6-bis(bencimidazol-2-il)piridina (BBP-AC)
- 2.B.25 La familia de flip-flops lipídicos mediada por péptidos (PLFF)
- 2.B.26 La familia de conjugados bis(coloxi) funcionalizados con bis(imidazolil) (BIBCC)
- 2.B.27 La familia de transportadores de aniones Tris-Urea
- 2.B.29 La familia de los alcaloides marinos anionofóricos tambjamina
2.C Energizadores impulsados por gradiente de iones
- 2.C.1 La familia TonB-ExbB-ExbD/TolA-TolQ-TolR (TonB) de proteínas auxiliares para la energización del transporte activo mediado por el receptor de membrana externa (OMR)
3.A. Transportadores impulsados por hidrólisis de enlaces PP
- 3.A.1 Transportadores ABC que incluyen BtuCD, transportador de captación de molibdato, regulador de la conductancia transmembrana de la fibrosis quística y otros
- 3.A.2 La superfamilia de ATPasas de tipo F , ATPasas de tipo V y ATPasas de tipo A que translocan H + o Na +
- 3.A.3 La superfamilia de ATPasas de tipo P
- 3.A.4 La familia de eflujos de arsenito-antimonita
- 3.A.5 Vía secretora general (Sec) translocón (preproteína translocasa SecY)
- 3.A.6 La familia de la vía secretora de tipo III (relacionada con la virulencia) (IIISP)
- 3.A.7 La familia de la vía secretora de tipo IV (transferencia de proteína-ADN conyugal o VirB) (IVSP)
- 3.A.8 La familia de translocasas de proteínas mitocondriales (MPT)
- 3.A.9 La familia de translocasas de la proteína de la envoltura del cloroplasto (CEPT o Tic-Toc)
- 3.A.10 Familia de pirofosfatasas translocadoras de H + , Na +
- 3.A.11 La familia de transportadores de transformación del ADN relacionados con la competencia bacteriana (ADN-T)
- 3.A.12 La familia de translocadores de ADN septal (S-DNA-T)
- 3.A.13 La familia de exportadores de fagos filamentosos (FPhE)
- 3.A.14 La familia de exportadores de proteínas/fimbrilina (FPE)
- 3.A.15 Familia de la rama terminal principal secretora de proteínas de membrana externa (MTB)
- 3.A.16 La familia de retrotranslocones reticulares endoplasmáticos (ER-RT)
- 3.A.17 La familia del inyectoma del fago T7 (inyectoma T7)
- 3.A.18 La familia de exportadores nucleares de ARNm (ARNm-E)
- 3.A.19 La familia de complejos de reconocimiento/inserción (TRC) de TMS
- 3.A.20 La familia de importadores de proteínas peroxisomales (PPI)
- 3.A.21 La familia de complejos de inserción/biogénesis de proteínas de membrana ancladas en la cola C-terminal (TAMP-B)
- 3.A.22 La familia del complejo de exportación nuclear de ARNm TREX/TAP acoplado a transcripción (TREX)
- 3.A.23 La familia de vías secretoras de simbiosis/virulencia tipo VI (VISP)
- 3.A.24 Familia del sistema de secreción de proteínas tipo VII o ESX (T7SS)
- 3.A.25 La familia de maquinarias similares a ERAD específicas de simbiontes (SELMA)
- 3.A.26 La familia de translocones de proteínas exportadas (PTEX) de Plasmodium
3.B Transportadores impulsados por descarboxilación
- 3.B.1 La familia de descarboxilasas de ácidos carboxílicos transportadoras de Na + (NaT-DC)
3.C Transportadores impulsados por transferencia de metilo
- 3.C.1 La familia de la metiltetrahidrometanopterina transportadora de Na + :coenzima M metiltransferasa (NaT-MMM)
3.D. Transportadores impulsados por oxidorreducción
Incluyen una serie de proteínas transmembrana similares al citocromo b, entre ellas la coenzima Q-citocromo c reductasa (citocromo bc1); complejo citocromo b6f ; formiato deshidrogenasa, nitrato reductasa respiratoria ; succinato-coenzima Q reductasa (fumarato reductasa); y succinato deshidrogenasa . Véase cadena de transporte de electrones .
- 3.D.1 La familia de la NADH deshidrogenasa (complejo I) translocante de H + o Na +
- 3.D.2 La familia de las transhidrogenasas translocadoras de protones (PTH)
- 3.D.3 La superfamilia de la quinol-citocromo c reductasa translocante de protones
- 3.D.4 Superfamilia de la citocromo oxidasa translocante de protones (COX)
- 3.D.5 La familia de la NADH:quinona deshidrogenasa (Na-NDH o NQR) translocante de Na +
- 3.D.6 La familia de la NADH:ferredoxina oxidorreductasa (NFO o RNF) que transloca iones putativos (H + o Na + )
- 3.D.7 La familia de la H 2 :heterodisulfuro oxidorreductasa (HHO)
- 3.D.8 La familia de la formil metanofurano deshidrogenasa (FMF-DH) que bombea Na + o H +
- 3.D.9 La familia de la deshidrogenasa F420H2 translocante de H + (F420H2DH)
- 3.D.10 La familia de la succinato deshidrogenasa procariota (SDH)
3.E. Transportadores impulsados por absorción de luz
- Proteínas similares a la bacteriorrodopsina, incluida la rodopsina (véase también opsina )
- Centros de reacción fotosintética bacteriana y fotosistemas I y II
- Complejos de captación de luz de bacterias y cloroplastos
4. Translocadores de grupo
4.A Translocadores de grupos impulsados por fosfotransferencia
- 4.A.1 La familia de glucosa-glucósidos (Glc) de PTS
- 4.A.2 La familia de fructosa-manitol (Fru) de PTS
- 4.A.3 La familia PTS de lactosa-N,N'-diacetilquitobiosa-β-glucósido (Lac)
- 4.A.4 La familia PTS Glucitol (intestino)
- 4.A.5 La familia de galactitoles (Gat) de PTS
- 4.A.6 La familia PTS manosa-fructosa-sorbosa (Man)
- 4.A.7 La familia de L-ascorbato (L-Asc) de PTS
4.B Transportadores de captación de ribonucleósidos de nicotinamida
- 4.B.1 La familia de permeasas de captación de ribonucleósidos (NR) de nicotinamida (PnuC)
Transportadores acoplados a la ligasa de acil CoA 4.C
- 4.C.1 La familia propuesta de transportadores de ácidos grasos (FAT)
- 4.C.2 La familia de la carnitina O-acil transferasa (CrAT)
- 4.C.3 La familia de las acil-CoA tioesterasas (AcoT)
4.D Sintetasa de polisacáridos/exportadores
- 4.D.1 La supuesta familia de polimerización vectorial de glicosilo (VGP)
- 4.D.2 La familia de las glicosiltransferasas 2 (GT2)
- 4.D.3 La familia de las glicano glucosil transferasas (OpgH)
4.E. Translocadores de grupos catalizados por polimerasa de polifosfato vacuolar
- 4.E.1 La familia de polifosfato polimerasa vacuolar (acidocalcisoma) (V-PPP)
5. Transportadores de electrones
5.A Portadores de transferencia de 2 electrones transmembrana
- 5.A.1 La familia de la oxidorreductasa D (DsbD) que enlaza disulfuro
- 5.A.2 La familia de la oxidorreductasa B con enlaces disulfuro (DsbB)
- 5.A.3 La familia de oxidorreductasas que contienen molibdopterina (PMO) procariotas
5.B Portadores de transferencia de 1 electrón transmembrana
- 5.B.1 La familia de oxidasas de NADPH del fagocito ( gp91phox )
- 5.B.2 La familia eucariota del citocromo b561 (Cytb561)
- 5.B.3 La familia de transferencia de electrones de nanocables de Geobacter (G-NET)
- 5.B.4 La familia del supercomplejo del fotosistema I de las plantas (PSI)
- 5.B.5 La familia de las oxido-reductasas de metales extracelulares (EMOR)
- 5.B.6 La familia de la proteína 3 reductasa férrica del antígeno epitelial transmembrana (STEAP)
- 5.B.7 La familia YedZ (YedZ)
- 5.B.8 La familia de complejos de porina/citocromo de transferencia de electrones de membrana externa trans (ET-PCC)
- 5.B.9 La familia de porinas-citocromo c (Cyc2)
8. Factores accesorios que intervienen en el transporte
8.A Proteínas de transporte auxiliares
8.B Toxinas proteicas/peptídicas sintetizadas ribosómicamente que se dirigen a canales y transportadores
8.C Toxinas sintetizadas no ribosómicamente que se dirigen a canales y transportadores
9. Sistemas de transporte caracterizados de forma incompleta
9.A Transportadores reconocidos de mecanismo bioquímico desconocido
9.B Proteínas transportadoras putativas
9.C Transportadores caracterizados funcionalmente que carecen de secuencias identificadas
Referencias
- ^ Saier, Milton H.; Reddy, Vamsee S.; Tamang, Dorjee G.; Västermark, Åke (enero de 2014). "La base de datos de clasificación de transportadores". Investigación de ácidos nucleicos . 42 (D1): D251–D258. doi :10.1093/nar/gkt1097. PMC 3964967 . PMID 24225317.
- ^ Saier, MH; Yen, MR; Noto, K.; Tamang, DG; Elkan, C. (1 de enero de 2009). "La base de datos de clasificación de transportadores: avances recientes". Nucleic Acids Research . 37 (Base de datos): D274–D278. doi :10.1093/nar/gkn862. PMC 2686586 . PMID 19022853.
- ^ Saier, MH; Tran, CV; Barabote, RD (1 de enero de 2006). "TCDB: la base de datos de clasificación de transportadores para análisis e información de proteínas de transporte de membrana". Nucleic Acids Research . 34 (90001): D181–D186. doi :10.1093/nar/gkj001. PMC 1334385 . PMID 16381841.
Enlaces externos
- Base de datos de clasificación de transportadores
- Listado en qmul.ac.uk
- Saier MH, Tran CV, Barabote RD (enero de 2006). "TCDB: la base de datos de clasificación de transportadores para análisis e información de proteínas de transporte de membrana". Nucleic Acids Res . 34 (número de la base de datos): D181–6. doi :10.1093/nar/gkj001. PMC 1334385 . PMID 16381841.
- Busch W, Saier MH (2002). "El sistema de clasificación de transportadores (TC), 2002". Crit. Rev. Biochem. Mol. Biol . 37 (5): 287–337. doi :10.1080/10409230290771528. PMID 12449427. S2CID 10558982.
- Clasificación de los transportadores humanos en farmacología