TMEM8A

El gen humano TMEM8A se encuentra en el cromosoma 16 en la banda 16p13.3. ^{[ 4 ]}

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El segmento de este gen en el cromosoma 16 abarca desde el par de bases 420.773 hasta el 437.113, lo que hace que este gen tenga una longitud de 16.340 pares de bases. Este gen se encuentra en la cadena negativa del cromosoma. ^{[ 6 ]} No se conocen isoformas .

TMEM8A también se conoce como proteína transmembrana 8A, proteína transmembrana 6, proteína transmembrana de cinco dominios M83, TMEM6, TMEM8, proteína transmembrana 8 y M83. ^{[ 7 ]}

En humanos se encuentran dos parálogos de TMEM8A: C9orf127 y TMEM8C. Ambos parálogos se localizan en el cromosoma 9. ^{[ 8 ]}

El espacio de ortólogos de TMEM8A es bastante reducido, y la mayoría de los ortólogos se encuentran en mamíferos, y en particular en primates, con solo unas pocas excepciones.

El gen codifica una proteína también llamada TMEM8A. Esta proteína tiene una longitud de 771 aminoácidos, pero se ha demostrado que posee un péptido señal desde el aminoácido 1 hasta el 34; la forma madura de la proteína tiene una longitud de solo 737 aminoácidos. La forma precursora con el péptido señal intacto tiene un peso molecular de 84,780 kilodaltons y la forma madura con el péptido señal escindido tiene un peso molecular de 81,624 kilodaltons ^{[ 9 ].} TMEM8A tiene un punto isoeléctrico de la forma madura de pI=7,3. ^{[ 10 ]}

TMEM8A es una proteína transmembrana con cinco dominios transmembrana, lo que la convierte en una de las tres únicas proteínas del cuerpo humano con cinco dominios; las otras dos son CD47 y AC133. La proteína también contiene un dominio similar al EGF , una secuencia de entre treinta y cuarenta residuos de aminoácidos, presente en la secuencia del factor de crecimiento epidérmico (EGF), que se ha demostrado que está presente de forma más o menos conservada en un gran número de otras proteínas, principalmente animales. La importancia funcional de los dominios EGF en proteínas aparentemente no relacionadas aún no está clara. Sin embargo, una característica común es que estas repeticiones se encuentran en el dominio extracelular de proteínas unidas a la membrana o en proteínas secretadas. El dominio EGF incluye seis residuos de cisteína que, en el EGF, se ha demostrado que participan en enlaces disulfuro. La estructura principal es una lámina beta de dos hebras seguida de un bucle que conduce a una lámina beta corta de dos hebras en el extremo C-terminal. Los subdominios entre las cisteínas conservadas varían en longitud. ^{[ 11 ]}

Se ha demostrado que la proteína sufre glicosilación postraduccional en los aminoácidos 144, 407 y 431. ^{[ 12 ]} También existen tres enlaces disulfuro entre los aminoácidos 498 y 508, 502 y 521, y 523 y 532. Estos enlaces disulfuro son característicos de las proteínas con un dominio similar al EGF.

Se ha descubierto que TMEM8A se expresa de forma ubicua en todo el cuerpo humano; sin embargo, se ha demostrado que su expresión disminuye durante la activación de las células T CD4+ y CD8+. ^{[ 13 ]}

Existen tres variantes de transcripción naturales de TMEM8A. Una se localiza en el aminoácido 136, donde una treonina se sustituye por una alanina. Otra se encuentra en el aminoácido 310, donde una isoleucina se sustituye por una valina, y la tercera en el aminoácido 567, donde una arginina se sustituye por un triptófano. Ninguna de estas variantes produce cambios en la expresión ni mutaciones con pérdida o ganancia de función. ^{[ 14 ]}

Existen numerosos sitios de unión predichos para factores de transcripción en el promotor de TMEM8A. A continuación, se presenta una tabla con las mejores posibilidades, que cuentan con altos valores de confianza, conservación evolutiva y/o múltiples sitios de unión posibles en el promotor.

Se ha demostrado que TMEM8A interactúa con las siguientes proteínas.

• ALPL
• NDUFS5
• NME4
• MACF1
• G5
• ENSG00000234651
• ENSG00000237431
• ENSG00000237495