Articulo de referencia

Modelo de naturaleza enredada

El modelo de naturaleza enmarañada [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ] es un modelo de ecología evolutiva desarrollado por Christensen, Di Collobiano, Hall y Jensen. Es un modelo basado en ...

El modelo de naturaleza enmarañada [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ] es un modelo de ecología evolutiva desarrollado por Christensen, Di Collobiano, Hall y Jensen. Es un modelo basado en agentes donde los «organismos» individuales interactúan, se reproducen, mutan y mueren a lo largo de muchas generaciones. Una característica notable del modelo es el equilibrio puntuado , transiciones abruptas y espontáneas entre estados estables de larga duración. Además de la ecología evolutiva, el modelo se ha utilizado para estudiar la sostenibilidad , [ 5 ] la ecología organizacional , [ 6 ] la hipótesis de Gaia , [ 7 ] la dinámica de la opinión, [ 8 ] y la evolución cultural, [ 9 ] entre otros temas.

Descripción del modelo

En el modelo, los individuos están representados por "genomas" binarios.a{\displaystyle a}de alguna longitud fijaL{\displaystyle L}Todos los individuos con el mismo genoma son equivalentes y se combinan en 'especies' con poblaciones.nortea{\displaystyle N_{a}}dóndenorte=aDnortea{\displaystyle N=\sum _{a}^{D}N_{a}}es la población total yD{\displaystyle D}el número de especies distintas.

Los individuos interactúan a través de una matriz de acoplamiento.J{\displaystyle J}. Normalmente, una fracción de las entradas potenciales se establecen en cero, al igual que las diagonales.Jaa=0{\displaystyle J_{aa}=0}y para los elementos distintos de ceroJabJba{\displaystyle J_{ab}\neq J_{ba}}.

En un único paso de actualización se selecciona un individuo y se reproduce con probabilidadpagoFF(Ha){\displaystyle p_{off}(H_{a})}y muere con probabilidadpagd{\displaystyle p_{d}}lo cual suele ser constante.

pagoFF(Ha)=miHa1+miHa{\displaystyle p_{off}(H_{a})={\frac {e^{H_{a}}}{1+e^{H_{a}}}}}

que es una función sigmoide de la aptitud

Ha=μnorte+1nortebJabnorteb{\displaystyle H_{a}=-\mu N+{\frac {1}{N}}\sum _{b}J_{ab}N_{b}}

Esto compara la interacción de cada individuo con todos los demás individuos según lo especificado por la matriz de acoplamiento.J{\displaystyle J}.μ{\displaystyle \mu }es el inverso de la capacidad de carga y controla el número total de individuos que pueden existir en el modelo. Cuando un individuo se reproduce asexualmente, existe una pequeña probabilidad fija.pagmetrot{\displaystyle p_{mut}}para que cada 'bit' del genoma cambie y genere así una nueva especie.

Típicamentenortepagd{\displaystyle {\frac {N}{p_{d}}}}Se considera que las probabilidades de reproducción y muerte constituyen una generación, y el modelo se ejecuta durante miles de generaciones.

Dinámica del modelo

Poblaciónnorte{\displaystyle N}En el modelo de naturaleza enredada, a lo largo de 50 000 generaciones, existen tres estados estables con transiciones relativamente rápidas entre ellos.
Modelo de naturaleza enmarañada tras 10 000 generaciones. Existen 4 especies numerosas (núcleo) y muchas especies pequeñas (nube), con fuertes interacciones únicamente entre las especies del núcleo.

La representación gráfica de la población del modelo a lo largo del tiempo demuestra un equilibrio puntuado , estados cuasi estables de larga duración que terminan abruptamente y son reemplazados por otros nuevos. Durante un período estable, el modelo genera una red de interacciones mutualistas entre un pequeño número de especies numerosas, a menudo denominadas «núcleo» y «nube» [ 10 ].

En un período estable, una especie central tienepagoFF(Ha)pagd{\displaystyle p_{off}(H_{a})\simeq p_{d}}Para una nueva especiedo{\displaystyle c}para surgir y obtener una población significativa se requierepagoFF(Hdo)>pagd{\displaystyle p_{off}(H_{c})>p_{d}}. Resolviendo paraHdo{\displaystyle H_{c}}da

bJdobnortebnorte>μnorteregistro(1/pagd1){\displaystyle \sum _{b}J_{cb}{\frac {N_{b}}{N}}>\mu N-\log(1/p_{d}-1)}

como requisito para que la nueva especie sea viable. Esto significa que la nueva especie tiene que tener interacciones netas positivas suficientemente fuertes, especialmente con las especies centrales, que son las únicas con grandes valores denortebnorte{\displaystyle {\frac {N_{b}}{N}}}El lado derecho representa una "barrera", controlada por la población total, lo que dificulta la invasión de estados con gran población.

Si una nueva especie puede superar la barrera, crecerá rápidamente, a expensas de las especies existentes, ya sea a través de acoplamientos parasitarios.Jdob<0{\displaystyle J_{cb}<0}o bien agotando la capacidad de carga del sistema. Esto puede provocar una reestructuración del núcleo, con la incorporación de la nueva especie al mismo y un reajuste de las poblaciones, o bien un colapso total del sistema.

Véase también

Referencias

  1. Christensen, K.; Di Collobiano, SA; Hall, M.; Jensen, HJ (2002). "Naturaleza enredada: un modelo de ecología evolutiva". Journal of Theoretical Biology . 216 (1): 73– 84. arXiv : cond-mat/0104116 . Bibcode : 2002JThBi.216...73C . doi : 10.1006/jtbi.2002.2530 . PMID 12076129 . 
  2. Alemán, Andreas; Bravo de la Parra, Rafael; de Boer, Rob J.; Diekmann, Odo; Jagers, Peter; Kisdi, Eva; Kretzschmar, Mirjam; Lansky, Petr; Metz, Hans, eds. (2008). Modelado Matemático de Sistemas Biológicos . Modelado y Simulación en Ciencia, Ingeniería y Tecnología. vol. II. Birkhäuser Boston. ISBN  978-0-8176-4555-7.
  3. Jensen, Henrik Jeldtoft; Sibani, Paolo (2013). Dinámica estocástica de sistemas complejos: De las gafas a la evolución . Imperial College Press. ISBN 978-1-84816-995-1.
  4. Jensen, Henrik Jeldtoft (2022). Ciencia de la complejidad: El estudio de la emergencia . Cambridge University Press. ISBN 978-1-108-88316-0.
  5. Vázquez, P.; Del Río, JA; Cedano, KG; Martínez, M.; Jensen, HJ (2015). "Un modelo entrelazado para indicadores de sostenibilidad" . PLOS ONE . 10 (8) e0135250. Bibcode : 2015PLoSO..1035250V . doi : 10.1371/journal.pone.0135250 . PMC 4546502. PMID 26295948 .  
  6. Arthur, R.; Nicholson, A.; Sibani, P.; Christensen, M. (2017). "El modelo de naturaleza enmarañada para la ecología organizacional". Computational and Mathematical Organization Theory . 23 : 1–31 . doi : 10.1007/s10588-016-9226-3 (inactivo el 1 de julio de 2025).{{cite journal}}: CS1 maint: DOI inactivo desde julio de 2025 ( enlace )
  7. Arthur, R.; Nicholson, A. (2022). "Principios de selección para Gaia". Journal of Theoretical Biology . 533 110940. Bibcode : 2022JThBi.53310940A . doi : 10.1016/j.jtbi.2021.110940 . PMID 34710434 . 
  8. Rajpal, H.; Rosas, FE; Jensen, HJ (2019). "Modelo de visión del mundo entrelazada de la dinámica de la opinión" . Frontiers in Physics . 7 : 163. arXiv : 1901.06372 . Bibcode : 2019FrP.....7..163R . doi : 10.3389/fphy.2019.00163 .
  9. Nicholson, AE; Sibani, P. (2016). " La evolución cultural como un proceso estocástico no estacionario" . Complexity . 21 (6): 214– 223. doi : 10.1002/cplx.21743 . PMC 5300684. PMID 28190951 .  
  10. Becker, N.; Sibani, P. (2014). "Evolución y física del no equilibrio: Un estudio del modelo de naturaleza enredada". Europhysics Letters . 105 (1): 18005.