Tanja Stadler es matemática y profesora de evolución computacional en el Instituto Federal Suizo de Tecnología ( ETH Zúrich ). Actualmente preside el Panel Asesor Científico Suizo sobre la COVID-19 y es vicepresidenta del Departamento de Ciencias e Ingeniería de Biosistemas de la ETH Zúrich .
Carrera
Tanja Stadler estudió matemáticas aplicadas y estadística en la Universidad Técnica de Múnich , la Universidad de Cardiff y la Universidad de Canterbury . [ 1 ] Continuó sus estudios en la Universidad Técnica de Múnich, donde obtuvo un doctorado en 2008 con la tesis «Árboles en evolución: modelos de especiación y extinción en filogenética» (bajo la dirección del Prof. Anusch Taraz y el Prof. Mike Steel). [ 2 ] Tras una estancia postdoctoral con el Prof. Sebastian Bonhoeffer en el Departamento de Ciencias de Sistemas Ambientales de la ETH Zúrich, fue ascendida a Jefa de Grupo Junior en la ETH Zúrich en 2011. En 2014, se convirtió en profesora adjunta en el Departamento de Ciencias e Ingeniería de Biosistemas de la ETH Zúrich , donde fue ascendida a profesora asociada en 2017 y a catedrática en 2021. [ 3 ]
Investigación
Contribuciones científicas
La investigación de Tanja aborda cuestiones fundamentales en las ciencias de la vida desde una perspectiva evolutiva, en particular en macroevolución , epidemiología , biología del desarrollo e inmunología . Sus preguntas de investigación incluyen aspectos fundamentales como la forma en que los procesos de especiación dieron lugar a la biodiversidad actual , así como cuestiones directamente relevantes para las sociedades humanas, como la propagación de patógenos como la COVID-19 o el Ébola . Tanja evalúa estas cuestiones desarrollando y aplicando herramientas filodinámicas estadísticas [ 4 ] para estimar la dinámica evolutiva y poblacional a partir de datos de secuenciación genómica, mientras que, paralelamente, lidera consorcios para producir dichos datos. Su enfoque único es una innovadora combinación de matemáticas , informática y biología .
Tanja realizó importantes contribuciones teóricas al campo de la filodinámica mediante el desarrollo de marcos estadísticos para utilizar los procesos de nacimiento y muerte en el contexto de los árboles filogenéticos. [ 5 ] En particular, sentó las bases para tener en cuenta el muestreo a lo largo del tiempo en los modelos de nacimiento y muerte, lo que permitió un análisis coherente de los datos de secuenciación genética recopilados a lo largo del tiempo durante las epidemias, así como un análisis coherente de los datos de especies fósiles (recopilados secuencialmente a lo largo del tiempo) y actuales. [ 6 ]
Tanja utilizó este marco, por ejemplo, para cuantificar la propagación del VHC, la propagación del Ébola durante el brote de 2014, evaluar la propagación del Zika , demostrar que las olas de influenza en una ciudad están impulsadas principalmente por los patrones de viaje y proporcionar información en tiempo real durante la pandemia de COVID-19 . [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ] En macroevolución, Tanja exploró en particular el impacto de la extinción de los dinosaurios en la diversificación de los mamíferos. [ 10 ] Más recientemente, está introduciendo el pensamiento estadístico de árboles en la biología del desarrollo . [ 11 ]
Su grupo fundó "Taming the BEAST" en 2016. BEAST 2 es una plataforma de software filogenético bayesiano ampliamente utilizada que permite inferir la dinámica evolutiva y poblacional a partir de datos de secuenciación genómica, a la cual el equipo de Tanja contribuyó con numerosos paquetes. "Taming the BEAST" es tanto una serie de talleres internacionales como un recurso en línea para enseñar el uso de BEAST 2. [ 12 ] [ 13 ]
En el campo de la epidemiología , Tanja lidera actualmente el uso de información sobre aguas residuales para comprender la propagación de patógenos. Es investigadora principal de un proyecto conjunto entre la ETH Zúrich y Eawag . Su equipo estima el número reproductivo del SARS-CoV-2 y la gripe a partir de aguas residuales y contribuye a la comprensión de la dinámica de las variantes. [ 14 ]
Difusión y participación política
Durante la pandemia de COVID-19 , Tanja fue presidenta del grupo de trabajo científico nacional suizo sobre COVID-19, asesorando a las autoridades y a los responsables de la toma de decisiones de Suiza desde agosto de 2021 hasta la disolución del grupo de trabajo en marzo de 2022. [ 15 ] Comenzó la presidencia tras haber sido miembro y posteriormente presidió el grupo de datos y modelización del grupo de trabajo. Fue responsable de la comunicación semanal de la situación de la pandemia al Gobierno Federal suizo y a las autoridades correspondientes. Además, presentó análisis científicos en sesiones informativas con todo el Gobierno Federal y con miembros de los poderes ejecutivos de los Gobiernos Federal y Cantonal, así como con diferentes divisiones del Parlamento suizo .
Tanja contribuyó activamente con conocimientos científicos fundamentales al Grupo de Trabajo. Sus cálculos diarios del número reproductivo se convirtieron en una parte clave del monitoreo de la epidemia. [ 16 ] Los números reproductivos se emplearon en la "Ordenanza nacional del 19 de junio de 2020 sobre medidas durante la situación especial para combatir la epidemia de COVID-19". Además, el panel de control del número reproductivo se destacó cuando el Departamento de Salud de Sudáfrica informó al mundo sobre la nueva variante Omicron. Tanja también lideró el esfuerzo de secuenciación de SARS-CoV-2 más extenso realizado en Suiza, proporcionando resultados sobre la aparición y propagación de nuevas variantes. [ 17 ] A través de este esfuerzo, se detectaron las primeras variantes beta, gamma y delta en Suiza. [ 18 ] [ 19 ]
La plataforma cov-spectrum fue desarrollada por el equipo de Tanja y se volvió esencial para el seguimiento de variantes del SARS-CoV-2 . [ 20 ] Se utiliza ampliamente para facilitar la designación de linajes del SARS-CoV-2 y en políticas como la reunión del comité asesor de la FDA que discute posibles cepas de SARS-CoV-2 para una actualización de la vacuna. Durante el brote de mpox , el equipo lanzó mpox-spectrum en cuestión de días para rastrear el virus que se estaba propagando. [ 21 ]
Además de asesorar al gobierno e informar a los responsables políticos, se involucró activamente en la información pública sobre la situación de la pandemia. Tanja difundió con frecuencia los conocimientos científicos en noticieros y programas de televisión nacionales en Suiza, así como a través de conferencias de prensa federales. [ 22 ]
Vida personal
Stadler vive con su pareja y sus dos hijas en Basilea. [ 23 ]
Premios y distinciones
- 2008. Premio de doctorado de la TUM [ 1 ]
- 2012. Premio John Maynard Smith de la Sociedad Europea de Biología Evolutiva [ 24 ]
- 2013. Beca inicial del ERC [ 3 ]
- 2013. Premio ETH Latsis [ 3 ]
- 2013. Premio Zonta [ 25 ]
- 2016. Búho Dorado de la ETH para la enseñanza [ 26 ]
- 2021: Premio a la Excelencia para Profesionales de Media Carrera de PYMES.
- 2021: Premio Carus de la Academia Nacional Alemana de Ciencias Leopoldina [ 27 ]
- 2022: Premio Rössler [ 28 ]
- 2022: Investigador altamente citado por Clarivate [ 29 ]
- 2023: Miembro de la Academia Nacional Alemana de Ciencias Leopoldina [ 30 ]
Referencias
- 1 2 "CV Tanja Stadler" . Consultado el 1 de enero de 2020 .
- ↑ "Tesis doctoral de Tanja Stadler" (PDF) . Consultado el 1 de enero de 2019 .
- 1 2 3 "Premio ETH Latsis 2013" . 8 de noviembre de 2013. Consultado el 30 de diciembre de 2018 .
- ↑ Tanja Stadler (julio de 2015), "Llegando a la raíz de la propagación de epidemias con análisis filodinámico de datos genómicos", Trends in Microbiology , 23 (7): 383–386 , doi : 10.1016/j.tim.2015.04.007 , PMID 26139467
- ↑ Tanja Stadler (noviembre de 2009), "Sobre el muestreo incompleto bajo modelos de nacimiento-muerte y conexiones con el coalescente basado en el muestreo", Journal of Theoretical Biology , 261 (1): 58–66 , Bibcode : 2009JThBi.261...58S , doi : 10.1016/j.jtbi.2009.07.018 , PMID 19631666
- ↑ Tanja Stadler (julio de 2014), "El proceso fosilizado de nacimiento y muerte para la calibración coherente de estimaciones de tiempo de divergencia", PNAS , 111 (29): E2957– E2966, arXiv : 1310.2968 , Bibcode : 2014PNAS..111E2957H , doi : 10.1073/pnas.1319091111 , PMC 4115571 , PMID 25009181
- ↑ Tanja Stadler (diciembre de 2012), "Gráfico de la evolución temporal de nacimientos y muertes revela cambios temporales en la propagación de la epidemia del VIH y el virus de la hepatitis C (VHC)", PNAS , 110 (1): 228–233 , doi : 10.1073/pnas.1207965110 , PMC 3538216 , PMID 23248286
- ↑ Tanja Stadler (noviembre de 2020), "Caracterización de la propagación epidémica de la influenza A/H3N2 dentro de una ciudad a través de la filogenética", PLOS Pathogens , 16 (11) e1008984, doi : 10.1371/journal.ppat.1008984 , PMC 7676729 , PMID 33211775
- ↑ Tanja Stadler (febrero de 2021), "El origen y la propagación temprana del SARS-CoV-2 en Europa", PNAS , 118 (9), Bibcode : 2021PNAS..11812008N , doi : 10.1073/pnas.2012008118 , PMC 7936359 , PMID 33571105
- ↑ Tanja Stadler (marzo de 2021), "La filogenia de los mamíferos revela cambios recientes en la tasa de diversificación", Actas de la Academia Nacional de Ciencias , 108 (15): 6187– 6192, doi : 10.1073/pnas.1016876108 , PMC 3076834 , PMID 21444816
- ↑ Tanja Stadler (marzo de 2021), "Filodinámica para biólogos celulares", Science , 371 (6526), doi : 10.1126/science.aah6266 , PMID 33446527 , S2CID 231606785
- ↑ Tanja Stadler (junio de 2017), "Domando a la BESTIA", Systematic Biology , 67 (1): 170–174 , doi : 10.1093/sysbio/syx060 , PMC 5925777 , PMID 28673048
- ↑ Tanja Stadler (abril de 2019), "BEAST 2.5: Una plataforma de software avanzada para el análisis evolutivo bayesiano", PLOS Computational Biology , 15 (4) e1006650, Bibcode : 2019PLSCB..15E6650B , doi : 10.1371/journal.pcbi.1006650 , PMC 6472827 , PMID 30958812
- ↑ Tanja Stadler (mayo de 2022), "Estimación del número reproductivo efectivo del SARS-CoV-2 basada en aguas residuales", Environmental Health Perspectives , 130 (5), doi : 10.1289/EHP10050 , PMC 9135136 , PMID 35617001
- ↑ "Grupo de trabajo científico nacional suizo sobre la COVID-19" .
- ^ Scire, Jérémie; Huisman, Jana S.; Angustia, Daniel C.; Li, Jinzhou; Neher, Richard A.; Maathuis, Marloes H.; Bonhoeffer, Sebastián; Stadler, Tanja (2022). "Estimación y seguimiento mundial del número reproductivo efectivo del SARS-CoV-2" . eVida . 11 . doi : 10.7554/eLife.71345 . PMC 9467515 . PMID 35938911 .
- ↑ "Consorcio Suizo de Secuenciación del SARS-CoV-2 (S3C)" .
- ↑ Tanja Stadler (agosto de 2022), "Estimación y monitoreo mundial del número reproductivo efectivo del SARS-CoV-2", eLife , 11 , doi : 10.7554/eLife.71345 , PMC 9467515 , PMID 35938911
- ↑ Tanja Stadler (junio de 2022), "Avances en la epidemiología genómica abordando el cuello de botella bioinformático: desafíos, principios de diseño y un ejemplo suizo", Epidemics , 39 , doi : 10.1016/j.epidem.2022.100576 , PMC 9107180 , PMID 35605437
- ↑ "CoV-Spectrum: análisis de datos compartidos globalmente sobre el SARS-CoV-2 para identificar y caracterizar nuevas variantes" .
- ↑ "genspectrum" .
- ↑ "Pandemia de COVID-19" .
- ↑ "El cazador de datos • Fundación ETH Zúrich" . Fundación ETH Zúrich . Consultado el 1 de noviembre de 2024 .
- ↑ "Premio John Maynard Smith" . Consultado el 1 de enero de 2019 .
- ↑ "Premio Zonta" . Consultado el 1 de enero de 2019 .
- ↑ "ETH Golden Owl" . Consultado el 1 de enero de 2019 .
- ↑ "Leopoldina verleiht Carus-Medaillen an Tanja Stadler und Dominic Bresser" . Nachrichten aus der Wissenschaft »idw (en alemán). 2021-09-01 . Consultado el 2 de diciembre de 2023 .
- ↑ «Tanja Stadler recibirá el premio Rössler» . ETH Zúrich . 2022-06-23 . Consultado el 1 de noviembre de 2024 .
- ↑ "Tanja Stadler entre los investigadores de ETH más citados en 2022" . ETH Zúrich . 15 de noviembre de 2022. Consultado el 1 de noviembre de 2024 .
- ↑ «Mitglieder» . Nationale Akademie der Wissenschaften Leopoldina (en alemán). 29 de junio de 2023 . Consultado el 2 de diciembre de 2023 .
Enlaces externos
- Departamento de Ciencias e Ingeniería de Biosistemas de la ETH Zúrich – Grupo de Evolución Computacional
- GenSpectrum
- Aguas residuales RE
- Domando a la BESTIA
- Selección de artículos de prensa sobre la obra de Tanja Stadler
- Personas vivas
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