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Target es el nombre de un proyecto de investigación colaborativa especializado en el procesamiento y la gestión de macrodatos en el norte de los Países Bajos. [ 1 ] Es una coope...

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Target es el nombre de un proyecto de investigación colaborativa especializado en el procesamiento y la gestión de macrodatos en el norte de los Países Bajos. [ 1 ] Es una cooperación público-privada, iniciada en 2009 y financiada con subvenciones gubernamentales. [ 2 ] Está dirigido por un consorcio de diez socios académicos y de la industria informática, coordinado por la Universidad de Groningen , e investiga la gestión de datos de proyectos científicos en las áreas de astronomía , ciencias de la vida , inteligencia artificial y diagnóstico médico .

En el proyecto Target colaboran diversas divisiones de la Universidad de Groningen, su centro médico , IBM , Oracle , ASTRON y las empresas holandesas de TI Elkoog/ Heeii y Nspyre.

El centro de computación de Target está alojado en el Centro de Tecnología de la Información, el centro de computación de la Universidad de Groningen, y consta de más de 10 petabytes de almacenamiento [ 3 ] [ 4 ] basado en la tecnología de almacenamiento GPFS de IBM , [ 5 ] un clúster de computación de alto rendimiento y un clúster de cuadrícula , que es parte de la Infraestructura de Cuadrícula Europea .

El centro de datos de Target está alojado en el Centro Donald Smits de Tecnología de la Información, ubicado en la Universidad de Groningen.

Historia

El proyecto se inició para transferir la experiencia de los astrónomos en el procesamiento masivo de datos a otras áreas de la ciencia. Target se basa en un entorno de computación distribuida llamado Astro-WISE. [ 6 ] [ 7 ] Astro-WISE se originó como una iniciativa del Grupo de Trabajo de Imágenes de Campo Amplio de OPTICON, que se estableció para considerar un sistema de estudio europeo estandarizado para facilitar la investigación, la reducción de datos y la minería de datos utilizando datos de la nueva generación de cámaras de estudio de campo amplio. [ 8 ] El proyecto Target se lanzó en 2009 después de recibir 32 millones de euros [ 9 ] de financiación por un período de cinco años del Fondo Europeo de Desarrollo Regional , el Ministerio de Asuntos Económicos de los Países Bajos (proyecto "Pieken in de Delta") y las provincias de Groningen y Drenthe . El proyecto se ejecuta bajo los auspicios de la Alianza de Provincias del Norte de los Países Bajos (SNN) y el municipio de Groningen.

Hallazgos tecnológicos

Al inicio del proyecto, uno de los objetivos era desarrollar un sistema de procesamiento integrado único, que consistiera en un sistema de archivos a escala de varios petabytes [ 10 ] y varios tipos diferentes de clústeres de computación y de cuadrícula [ 11 ] . Durante los primeros años, se hizo evidente que las diferentes disciplinas de la ciencia electrónica tienen diferentes requisitos de procesamiento de datos. En algunas áreas, se lleva a cabo un esfuerzo masivo de transmisión de datos , como en Lofar . En astronomía, el número de objetos de datos puede llegar a miles de millones, con un número limitado de columnas de datos [ 12 ] . En genómica , solo se necesita un pequeño número de filas, pero el número de columnas puede llegar a cientos de miles. Otras áreas, como la recuperación visual de texto en el motor de búsqueda Monk para manuscritos históricos, se encuentran en una posición intermedia, con cientos de millones de filas y miles de dimensiones. Además, las aplicaciones de genómica a menudo requieren un control de acceso estricto [ 13 ] , mientras que otras disciplinas no necesitan priorizar la privacidad. En consecuencia, los diversos subproyectos dentro de Target adoptaron un enfoque pragmático sobre qué aspectos de la tecnología WISE y componentes de la infraestructura de hardware de Target eran aplicables a su campo específico.

Proyectos

Target participa en varios proyectos científicos intensivos en datos en astronomía, visualización de Big Data (colaboración con el centro eScience en Ámsterdam), [ 14 ] algoritmos de reconocimiento de texto manuscrito , investigación médica sobre el envejecimiento saludable, desarrollo de herramientas de diagnóstico para la enfermedad de Parkinson y más.

Archivo a largo plazo de LOFAR

Target ha desarrollado y mantiene el archivo a largo plazo LOFAR .

Gran parte de los datos del telescopio LOFAR se almacenan, se acceden desde y se archivan en el archivo a largo plazo de LOFAR, diseñado por ASTRON y Target. [ 15 ] [ 16 ] [ 17 ] Los datos se alojarán en el centro de datos de Target y en varios otros centros europeos.

Monje

Captura de pantalla de una página del Archivo del Gabinete de la Reina de los Países Bajos (KdK) en la que Monk encontró la palabra Groningen.

Monk es un sistema desarrollado por Schomaker y su grupo en el Instituto de Inteligencia Artificial (ALICE) de la Universidad de Groningen . Utiliza algoritmos de reconocimiento de patrones y aprendizaje automático para el reconocimiento de texto manuscrito en diversos archivos existentes. [ 18 ] [ 19 ] [ 20 ] Actualmente, Monk ha incorporado varios libros de los Archivos Nacionales de los Países Bajos , así como más de 70 colecciones históricas internacionales, con textos que abarcan desde manuscritos occidentales y medievales hasta manuscritos chinos. El sistema aplica aprendizaje automático continuo (24/7) a través de internet, lo que produce resultados fundamentales. [ 21 ] El sistema MONK utiliza los recursos computacionales y de almacenamiento de Target. Recientemente, se unió a una colaboración liderada por el Prof. Popovic del Departamento de Teología y Estudios Religiosos de la Universidad de Groningen, que utilizará una combinación de datación por carbono, paleografía y técnicas de reconocimiento de texto e imagen para intentar identificar a los autores de los manuscritos de los Rollos del Mar Muerto . [ 22 ]

Líneas de vida

LifeLines es un proyecto de investigación médica a largo plazo dirigido por el Centro Médico Universitario de Groningen (UMCG) . Se recopilará una serie de datos de genotipo y fenotipo de 165 000 personas cada cinco años durante un período total de treinta años, y los datos acumulados serán utilizados por investigadores y especialistas médicos para comprender mejor los procesos relacionados con el envejecimiento, con el fin de entender por qué la degradación de la salud relacionada con la edad varía tanto de una persona a otra. [ 23 ] Target proporciona a LifeLines la infraestructura para el almacenamiento, acceso y procesamiento de datos. Los datos de LifeLines, así como la infraestructura de SURFsara y Target, se utilizaron en el proyecto Genoma de los Países Bajos, dirigido por un consorcio del UMCG , LUMC , Erasmus MC, UMCU y la Universidad Libre de Ámsterdam . Los resultados del proyecto, que utilizaron la secuenciación del genoma completo para deducir la estructura poblacional y la historia demográfica de la población neerlandesa, se publicaron en la revista Nature Genetics . [ 24 ] [ 25 ]

DESTELLOS

Dirigido por K. Leenders, profesor de neurología en el UMCG , GLIMPS es un proyecto de investigación que busca encontrar herramientas de diagnóstico más rápidas y confiables para la enfermedad de Parkinson . [ 26 ] GLIMPS explora las posibilidades de usar algoritmos complejos basados ​​en imágenes y tomografías por emisión de positrones (PET) para la detección temprana de la enfermedad de Parkinson. Para probar la efectividad de dichos algoritmos, GLIMPS está construyendoUna amplia base de datos de tomografías PET procedentes de varios hospitales de los Países Bajos. Target es responsable de la creación y el mantenimiento de la base de datos GLIMPS, así como de garantizar el correcto funcionamiento de los algoritmos basados ​​en imágenes en sus instalaciones informáticas.

Otros

Además, Target participa en la gestión de datos para otros proyectos astronómicos, como el sondeo astronómico KiDs/VIKING [ 27 ] [ 28 ] utilizando OmegaCAM, [ 29 ] [ 30 ] el instrumento MUSE del ESO [ 31 ] (montado en el Very Large Telescope ) y MICADO (que se montará en el E-ELT ). Asimismo, el enfoque de gestión de datos centrado en los datos impulsado por Target ha sido adoptado por la misión Euclid de la ESA . [ 32 ] La empresa derivada del proyecto, Target Holding BV, también gestiona varios proyectos comerciales con empresas privadas en el norte de los Países Bajos. [ 33 ]

La divulgación y educación pública también forman parte del alcance del proyecto, y Target ha organizado numerosos eventos públicos. [ 34 ] El teatro Infoversum 3D es un proyecto derivado de Target y ofrece un espacio para la visualización y explicación de datos científicos para grandes grupos. [ 35 ] [ 36 ]

Referencias

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