Hispanopedia Wiki
Articulo de referencia

Base de datos de objetivos terapéuticos

La Base de Datos de Objetivos Terapéuticos ( TTD ) es un repositorio farmacéutico y médico [1] construido por el Grupo de Investigación de Medicamentos Innovadores y Bioinformát...

Hispanopedia WikiContenido en espanolLectura gratuita

La Base de Datos de Objetivos Terapéuticos ( TTD ) es un repositorio farmacéutico y médico [1] construido por el Grupo de Investigación de Medicamentos Innovadores y Bioinformática (IDRB) en la Universidad de Zhejiang, China y el Grupo de Bioinformática y Diseño de Medicamentos en la Universidad Nacional de Singapur . Proporciona información sobre proteínas terapéuticas y ácidos nucleicos objetivos conocidos y explorados, [2] la enfermedad objetivo, [3] información de la vía [4] y los medicamentos correspondientes dirigidos a cada uno de estos objetivos. [1] Conocimiento detallado sobre la función del objetivo, secuencia, estructura 3D, propiedades de unión de ligando, nomenclatura de enzimas y estructura del fármaco, clase terapéutica y estado de desarrollo clínico. [1] TTD es de libre acceso sin ningún requisito de inicio de sesión en https://idrblab.org/ttd/.

Estadística

Esta base de datos contiene 3.730 dianas terapéuticas (532 exitosas, 1.442 de ensayos clínicos, 239 preclínicas/patentadas y 1.517 dianas de investigación) y 39.862 medicamentos (2.895 aprobados, 11.796 de ensayos clínicos, 5.041 preclínicas/patentadas y 20.130 medicamentos experimentales). Las dianas y medicamentos en TTD cubren 583 clases bioquímicas de proteínas y 958 clases terapéuticas de medicamentos, respectivamente. [1] La última versión de los códigos de la Clasificación Internacional de Enfermedades (CIE-11) publicada por la OMS se incorpora en TTD para facilitar la definición clara de enfermedad/clase de enfermedad. [5]

Validación de la diana terapéutica primaria

La validación de un objetivo normalmente requiere la determinación de que el objetivo se expresa en las células/tejidos relevantes para la enfermedad, [6] puede ser modulado directamente por un fármaco o una molécula similar a un fármaco con la potencia adecuada en un ensayo bioquímico, [7] y que la modulación del objetivo en modelos celulares y/o animales mejora el fenotipo de la enfermedad relevante. [8] Por lo tanto, TTD recopila tres tipos de datos de validación de objetivos: [9]

  • Potencia determinada experimentalmente de los fármacos contra su objetivo o sus objetivos primarios. [6]
  • Potencia o efectos evidentes de los fármacos contra modelos de enfermedad (líneas celulares, modelos ex vivo, in vivo) vinculados a su objetivo o objetivos primarios. [8]
  • Efectos observados de knockout, knockdown, interferencia de ARN, modelos in vivo tratados con anticuerpos o antisentido o transgénicos. [7]

Categorización de objetivos terapéuticos en función del estado clínico

Los objetivos terapéuticos en TTD se clasifican en objetivo exitoso, objetivo de ensayo clínico, objetivo preclínico, objetivo patentado y objetivo informado en la literatura, que se definen por el estado más alto de sus fármacos correspondientes.

  • Objetivo exitoso: al que se dirige al menos un fármaco aprobado;
  • Objetivo del ensayo clínico: no es el objetivo de ningún fármaco aprobado, pero sí es el objetivo de al menos un fármaco de ensayo clínico;
  • Objetivo preclínico: no es el objetivo de ningún fármaco aprobado o en ensayo clínico, pero es el objetivo de al menos un fármaco preclínico;
  • Objetivo patentado: no es el objetivo de ningún ensayo clínico/medicamento preclínico/aprobado, pero es el objetivo de al menos un medicamento patentado;
  • Objetivo reportado en la literatura: objetivo exclusivo de medicamentos en investigación.

Clasificación de dianas terapéuticas según tipos moleculares

Los tipos moleculares de objetivos terapéuticos en TTD incluyen proteínas, ácidos nucleicos y otras moléculas.

  • Proteína : el tipo de objetivo más común en el desarrollo de fármacos
  • Ácido nucleico : incluye dianas de ADN, ARNm, miARN y lncARN
  • Otras moléculas: como el ácido úrico, el hierro y las especies reactivas de oxígeno.

Diferentes tipos de medicamentos recolectados en TTD

Los principales tipos de medicamentos en TTD incluyen moléculas pequeñas, anticuerpos, fármacos de ácido nucleico, terapia celular, terapia genética y vacunas.

  • Moléculas pequeñas : los medicamentos más comunes en el mercado farmacéutico
  • Anticuerpo : incluye anticuerpos monoclonales y varias alternativas como conjugados anticuerpo-fármaco, anticuerpos biespecíficos, mezclas de IgG y proteínas de fusión de anticuerpos.
  • Fármaco de ácido nucleico: incluye principalmente oligonucleótidos antisentido, ARN interferentes pequeños, ARN activadores pequeños, microARN, ARNm, etc.
  • Terapia celular : inyectar, injertar o implantar células viables en un paciente para lograr un efecto medicinal.
  • Terapia genética : manipular la expresión genética o alterar las propiedades biológicas de las células vivas para producir el efecto terapéutico.
  • Vacuna : proporciona inmunidad adquirida activa contra una enfermedad infecciosa o maligna particular.

Principales avances en las diferentes versiones de TTD

Actualización 2024 (Res de ácidos nucleicos. 2023, doi: 10.1093/nar/gkad751)[1]

■ Capacidad de acción de los fármacos ilustrada por interacciones o regulaciones moleculares;

■ La farmacopea objetivo se caracteriza por diferentes características del sistema humano;

■ La farmacopea diana se refleja en diversas variaciones de expresión basadas en células;

Actualización 2022 (Res de ácidos nucleicos. 2022, 50: D1398-D1407)[10]

■ Panorama de actividad basado en la estructura y perfil de propiedades similares a las de los fármacos de los objetivos;

■ Profármacos junto con su fármaco original y su diana;

■ Co-objetivos modulados por fármacos aprobados/en ensayos clínicos;

■ Malos aglutinantes y no aglutinantes de objetivos;

Actualización 2020 (Res de ácidos nucleicos. 2020, 48: D1031-D1041)[11]

■ Reguladores diana (microARN y factores de transcripción) y proteínas que interactúan con la diana;

■ Agentes patentados y sus objetivos (estructuras y valores de actividad experimental si están disponibles);

Actualización 2018 (Res de ácidos nucleicos. 2018, 46: D1121-D1127)[12]

■ Perfiles de expresión diferencial y datos descargables de dianas en pacientes e individuos sanos;

■ Combinación de fármacos multiobjetivo y terapias combinadas;

Actualización 2016 (Res de ácidos nucleicos. 2016, 44: D1069-D1074)[13]

■ Enlaces cruzados de la mayoría de las entradas de fármacos y objetivos de TTD a las entradas de la vía correspondiente;

■ Acceso a múltiples objetivos y fármacos reticulados a cada una de estas entradas de la vía;

Actualización 2014 (Res de ácidos nucleicos. 2014, 42: D1118-D1123)[14]

■ Biomarcadores de enfermedades;

■ Andamios farmacológicos para fármacos/conductos;

Actualización 2012 (Res de ácidos nucleicos. 2012, 40: D1128-D1136)[15]

■ Información de validación de objetivos (fármaco-objetivo-enfermedad);

■ Modelos cuantitativos de relación estructura-actividad (QSAR) para compuestos;

Actualización 2010 (Res de ácidos nucleicos. 2010, 38: D787-D791)[16]

■ Medicamentos en ensayos clínicos y sus objetivos;

■ Búsqueda de objetivos de similitud y de fármacos.

Referencias

  1. ^ abcde Zhou, Ying; Zhang, Yintao; Zhao, Donghai; Yu, Xinyuan; Shen, Xinyi; Zhou, Yuan; Wang, Shanshan; Qiu, Yunqing; Chen, Yuzong; Zhu, Feng (15 de septiembre de 2023). "TTD: base de datos de objetivos terapéuticos que describe la información sobre la farmacobilidad del objetivo". Investigación de ácidos nucleicos : gkad751. doi : 10.1093/nar/gkad751 . ISSN  1362-4962. PMC 10767903 . PMID  37713619. 
  2. ^ Hopkins AL, Groom CR (2002). "El genoma farmacológico". Nature Reviews Drug Discovery . 1 (9): 727–30. doi :10.1038/nrd892. PMID  12209152. S2CID  13166282.
  3. ^ Overington JP, Al-Lazikani B, Hopkins AL (2006). "¿Cuántos objetivos farmacológicos existen?". Nature Reviews Drug Discovery . 5 (12): 993–6. doi :10.1038/nrd2199. PMID  17139284. S2CID  11979420.
  4. ^ Zheng CJ, Han LY, Yap CW, Ji ZL, Cao ZW, Chen YZ (2006). "Objetivos terapéuticos: progreso de su exploración e investigación de sus características". Pharmacol. Rev. 58 ( 2): 259–79. doi :10.1124/pr.58.2.4. PMID  16714488. S2CID  3082221.
  5. ^ The Lancet, null (8 de junio de 2019). "ICD-11". Lancet . 393 (10188): 2275. doi : 10.1016/S0140-6736(19)31205-X . ISSN  1474-547X. PMID  31180012.
  6. ^ ab Lindsay, Mark A. (1 de octubre de 2003). "Descubrimiento de objetivos". Nature Reviews. Drug Discovery . 2 (10): 831–838. doi :10.1038/nrd1202. ISSN  1474-1776. PMID  14526386. S2CID  40029453.
  7. ^ ab Vidalin, Olivier; Muslmani, Machadiya; Estienne, Clément; Echchakir, Hamid; Abina, Amine M. (1 de octubre de 2009). "Validación de dianas in vivo mediante modelos de invalidación génica, interferencia de ARN y knockout funcional de proteínas: es el momento de combinar". Current Opinion in Pharmacology . 9 (5): 669–676. doi :10.1016/j.coph.2009.06.017. ISSN  1471-4973. PMID  19646923.
  8. ^ ab En general, Christopher M.; Kleifeld, Oded (15 de marzo de 2006). "Microambiente tumoral: opinión: validación de las metaloproteinasas de matriz como dianas farmacológicas y antidiana para la terapia del cáncer". Nature Reviews. Cáncer . 6 (3): 227–239. doi :10.1038/nrc1821. ISSN  1474-175X. PMID  16498445. S2CID  21114447.
  9. ^ Zhu, Feng; Shi, Zhe; Qin, Chu; Tao, Lin; Liu, Xin; Xu, Feng; Zhang, Li; Song, Yang; Liu, Xianghui; Zhang, Jingxian; Han, Bucong (1 de enero de 2012). "Actualización de la base de datos de dianas terapéuticas 2012: un recurso para facilitar el descubrimiento de fármacos orientado a dianas". Nucleic Acids Research . 40 (número de la base de datos): D1128–1136. doi :10.1093/nar/gkr797. ISSN  1362-4962. PMC 3245130 . PMID  21948793. 
  10. ^ Zhou, Ying; Zhang, Yintao; Lian, Xichen; Li, Fengcheng; Wang, Chaoxin; Zhu, Feng; Qiu, Yunqing; Chen, Yuzong (7 de enero de 2022). "Actualización de la base de datos de objetivos terapéuticos 2022: facilitación del descubrimiento de fármacos con datos comparativos enriquecidos de agentes específicos". Investigación de ácidos nucleicos . 50 (D1): D1398–D1407. doi :10.1093/nar/gkab953. ISSN  1362-4962. PMC 8728281 . PMID  34718717. 
  11. ^ Wang, Yunxia; Zhang, Song; Li, Fengcheng; Zhou, Ying; Zhang, Ying; Wang, Zhengwen; Zhang, Runyuan; Zhu, Jiang; Ren, Yuxiang; Tan, Ying; Qin, Chu (6 de noviembre de 2019). "Base de datos de objetivos terapéuticos 2020: recurso enriquecido para facilitar la investigación y el desarrollo temprano de terapias dirigidas". Investigación de ácidos nucleicos . 48 (D1): D1031–D1041. doi : 10.1093/nar/gkz981 . ISSN  1362-4962. PMC 7145558 . PMID  31691823. 
  12. ^ Li, Ying Hong; Yu, Chun Yan; Li, Xiao Xu; Zhang, Peng; Tang, Jing; Yang, Qingxia; Fu, Tingting; Zhang, Xiaoyu; Cui, Xuejiao; Tu, Gao; Zhang, Yang (4 de enero de 2018). "Actualización de la base de datos de dianas terapéuticas 2018: recurso enriquecido para facilitar la investigación de laboratorio a clínica de terapias dirigidas". Investigación de ácidos nucleicos . 46 (D1): D1121–D1127. doi :10.1093/nar/gkx1076. ISSN  1362-4962. PMC 5753365 . PMID  29140520. 
  13. ^ Yang, Hong; Qin, Chu; Li, Ying Hong; Tao, Lin; Zhou, Jin; Yu, Chun Yan; Xu, Feng; Chen, Zhe; Zhu, Feng; Chen, Yu Zong (4 de enero de 2016). "Actualización de la base de datos de dianas terapéuticas 2016: recurso enriquecido para la información sobre dianas de fármacos y vías específicas desde el laboratorio hasta la práctica clínica". Nucleic Acids Research . 44 (D1): D1069–1074. doi :10.1093/nar/gkv1230. ISSN  1362-4962. PMC 4702870 . PMID  26578601. 
  14. ^ Qin, Chu; Zhang, Cheng; Zhu, Feng; Xu, Feng; Chen, Shang Ying; Zhang, Peng; Li, Ying Hong; Yang, Sheng Yong; Wei, Yu Quan; Tao, Lin; Chen, Yu Zong (7 de enero de 2014). "Actualización de la base de datos de objetivos terapéuticos 2014: un recurso para terapias dirigidas". Investigación de ácidos nucleicos . 42 (Problema de la base de datos): D1118–1123. doi : 10.1093/nar/gkt1129. ISSN  1362-4962. PMC 3964951 . PMID  24265219. 
  15. ^ Zhu, Feng; Shi, Zhe; Qin, Chu; Tao, Lin; Liu, Xin; Xu, Feng; Zhang, Li; Song, Yang; Liu, Xianghui; Zhang, Jingxian; Han, Bucong; Zhang, Peng; Chen, Yuzong (8 de enero de 2012). "Actualización de la base de datos de dianas terapéuticas 2012: un recurso para facilitar el descubrimiento de fármacos orientado a dianas". Nucleic Acids Research . 40 (número de la base de datos): D1128–1136. doi :10.1093/nar/gkr797. ISSN  1362-4962. PMC 3245130 . PMID  21948793. 
  16. ^ Zhu, Feng; Han, BuCong; Kumar, Pankaj; Liu, XiangHui; Mamá, XiaoHua; Wei, Xiaona; Huang, Lu; Guo, YangFan; Han, LianYi; Zheng, ChanJuan; Chen, YuZong (7 de enero de 2010). "Actualización de TTD: base de datos de objetivos terapéuticos". Investigación de ácidos nucleicos . 38 (Problema de la base de datos): D787–791. doi : 10.1093/nar/gkp1014. ISSN  1362-4962. PMC 2808971 . PMID  19933260. 
  • Página de inicio de la base de datos de objetivos terapéuticos
  • Artículo en PubMed
  • Grupo de Investigación en Bioinformática e Investigación de Medicamentos Innovadores
Obtenido de "https://es.wikipedia.org/w/index.php?title=Base_de_datos_de_objetivos_terapéuticos&oldid=1195776807"