Thomas Shaughnessy, primer barón Shaughnessy

Shaughnessy llegó a Montreal en noviembre de 1882 para trabajar para el Ferrocarril del Pacífico Canadiense como agente general de compras. EA James, telegrafista personal de Van Horne, lo describe como "un joven elegante y alerta, que usaba bastón y que en general daba muestras de ser lo que llamamos un hombre muy activo". ^{[ 2 ]} El perfeccionista Shaughnessy, siempre bien vestido (quien también parece haber sido obsesivo-compulsivo ; estaba obsesionado con la limpieza, se lavaba las manos repetidamente todos los días y, como presidente, se negaba a compartir un ascensor con nadie más ^{[ 3 ]} ), se hizo conocido por su estricto control de costos y su meticuloso escrutinio de las compras y otros gastos. El Diccionario de Biografías Canadienses afirma:

Shaughnessy tenía una visión esencialmente pesimista de la naturaleza humana... Estaba convencido de que, dada la oportunidad, proveedores, contratistas, transportistas, trabajadores y cualquier otra persona engañarían a la empresa. La vigilancia constante era esencial. Todo debía hacerse de acuerdo con las numerosas normas y reglamentos que él mismo introdujo. Disfrutaba rastreando incluso las transgresiones más pequeñas y luego humillando públicamente a los culpables, generalmente por escrito para asegurar que la información quedara registrada permanentemente. Incluso los contratistas y altos funcionarios de mayor confianza de la empresa estaban expuestos a su ira si, en sus esfuerzos por realizar el trabajo necesario a tiempo, pagaban precios superiores a los considerados apropiados o si incumplían de alguna otra manera su sistema. ^{[ 4 ]}

También gestionó los gastos retrasando los pagos el mayor tiempo posible con cualquier excusa, en la medida en que lo permitían la ley y las circunstancias prácticas: una práctica a la que la mayoría de las historias de la CPR atribuyen parte de la capacidad de la línea para mantenerse a flote, especialmente durante los primeros meses de 1885, cuando el tramo más difícil de la línea a lo largo del lago Superior se financiaba gracias a la confianza y el crédito de la corporación.

Shaughnessy se convirtió en subdirector general de CPR en 1885 y asistente del presidente en septiembre de 1889. En 1891, Shaughnessy pasó a ser director y vicepresidente del ferrocarril. Sucedió a Van Horne como presidente el 12 de junio de 1898. ^{[ 5 ]} Inmediatamente procedió a centralizar las operaciones financieras en la sede de la corporación en Montreal, asumiendo el control centralizado del presupuesto, las ganancias y las asignaciones, mientras que delegó el control operativo a los jefes de división en el terreno; una política que había estado instando a Van Horne desde hacía algún tiempo. Era un gran admirador de Van Horne y siempre estuvo agradecido por la amistad y la ayuda de su antiguo protector, pero fue franco sobre lo que consideraba el legado de Van Horne: una falta de organización y gestión sistemáticas.

Durante su presidencia, los servicios de barcos de vapor de Canadian Pacific , primero nacionales, luego de Vancouver a Asia (la línea Empress) y posteriormente transatlánticos, se expandieron y modernizaron constantemente, convirtiendo finalmente a esta compañía ferroviaria en una de las principales navieras del mundo. Para promover el turismo y el tráfico de pasajeros, se ampliaron o construyeron hoteles, chalets y campamentos de montaña, tanto nuevos como ya existentes, propiedad de CPR, desde las Provincias Marítimas hasta Victoria , todos ellos sujetos a los meticulosos estándares de limpieza de Shaughnessy. Bajo la dirección de Shaughnessy, CPR controlaba la Consolidated Mining and Smelting Company of Canada y el ferrocarril Crow's Nest Pass.

Bajo la administración de Shaughnessy, el kilometraje de la CPR en el oeste de Canadá casi se duplicó. La Canadian Northern Railway y la Grand Trunk Pacific Railway buscaron y a menudo recibieron subsidios para competir eficazmente con la impopular CPR (que, a su vez, se había beneficiado de fondos federales y subsidios de tierras en sus primeros años). Shaughnessy se defendió con firmeza ante la recién creada Junta de Comisionados Ferroviarios , argumentando con éxito que las tarifas más altas en el oeste de Canadá estaban justificadas por los elevados costos, un argumento que finalmente sería aceptado oficialmente por la Junta en 1914. Se decía de él: «Como operador de ferrocarriles, probablemente no tenga rival en este continente, lo que equivale a decir que no tiene igual en este sector en el mundo». ^{[ 6 ]}

Al estallar la Primera Guerra Mundial , Shaughnessy apoyó firmemente la guerra del Imperio y también destinó los recursos de la CPR a ella. Su labor en apoyo del esfuerzo bélico fue la razón de su elevación a la nobleza en 1916. Para entonces, el antiguo residente de Milwaukee era «un imperialista de pura cepa, un firme defensor de la monarquía, el imperio y la nación», ^{[ 7 ]} con una mentalidad tan británica que, según se informa, se le ofreció (pero rechazó) un puesto en el gabinete de H. H. Asquith . ^{[ 8 ]}

El menor de sus dos hijos (ambos estaban sirviendo en el extranjero), Alfred Thomas, murió en combate en Francia el 31 de marzo de 1916 mientras servía en la Fuerza Expedicionaria Canadiense . ^{[ 9 ]}

Shaughnessy renunció a la presidencia de la CPR en 1918, alegando el deterioro de su vista. Continuó siendo presidente de la junta directiva hasta su muerte.

Shaughnessy falleció el 10 de diciembre de 1923 tras sufrir un infarto el día anterior. En su lecho de muerte , instruyó a su sucesor al frente de la CPR, Edward Wentworth Beatty : «Mantenga la propiedad. Es una gran propiedad canadiense y una gran empresa canadiense». Su hijo mayor, William James Shaughnessy, le sucedió como segundo barón Shaughnessy. Fue sepultado en el cementerio Notre Dame des Neiges de Montreal. ^{[ 10 ]}