Análisis de tres taxones

El análisis de tres taxones (o TTS , análisis de tres elementos , 3ia ) es un método cladístico de reconstrucción filogenética. Introducido por Nelson y Platnick en 1991 ^{[ 2 ]} para reconstruir la filogenia de los organismos, este método también puede aplicarse a áreas biogeográficas . Intenta reconstruir árboles filogenéticos complejos dividiendo el problema en partes más simples. En lugar de intentar resolver las relaciones de todos los X taxones a la vez, considera los taxones de tres en tres. Es relativamente fácil generar enunciados de tres taxones (3is); es decir, enunciados de la forma "A y B están más estrechamente relacionados entre sí que con C". ^{[ 3 ]} Una vez que se ha considerado cada grupo de tres taxones, el método construye un árbol que es consistente con la mayor cantidad posible de enunciados de tres elementos. ^{[ 3 ]}

Desde un punto de vista teórico, el método tiene tres problemas principales: (1) la evolución de los caracteres se asume a priori como irreversible; (2) los 3is que no son lógicamente independientes se tratan como si lo fueran; (3) los 3is que se consideran soporte independiente para un árbol dado pueden ser mutuamente excluyentes en ese árbol. ^{[ 4 ]}

Un programa informático que implementa el análisis de tres taxones es LisBeth ^{[ 5 ]} (para estudios sistemáticos y biogeográficos). LisBeth se ha distribuido gratuitamente. ^{[ 6 ]} Un estudio reciente basado en simulaciones encontró que el análisis de tres taxones produce una buena potencia y una tasa de error intermedia entre la parsimonia con estados ordenados y la parsimonia con estados no ordenados. ^{[ 1 ]}

• Cladística