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Articulo de referencia

Tombusviridae

Tombusviridae es una familia de virus vegetales de ARN monocatenario de sentido positivo . La familia contiene 19 géneros en 3 subfamilias. [ 1 ] [ 2 ] El nombre deriva del viru...

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Tombusviridae es una familia de virus vegetales de ARN monocatenario de sentido positivo . La familia contiene 19 géneros en 3 subfamilias. [ 1 ] [ 2 ] El nombre deriva del virus del enanismo arbustivo del tomate (TBSV). [ 3 ]

genoma

Mapa del genoma de Tombusviridae

Todos los virus de la familia tienen un genoma lineal no segmentado (monopartito) , con la excepción de los Dianthovirus, cuyo genoma es bipartito. [ 4 ] El genoma tiene una longitud aproximada de 4,6–4,8 kb, carece de caperuza 5' y cola de poli(A), y codifica de 4 a 6 ORF . La polimerasa codifica un codón de parada ámbar que es el sitio de un evento de lectura continua dentro del ORF1, produciendo dos productos necesarios para la replicación. El virus no codifica ninguna helicasa . [ 5 ]

Estructura

El ARN está encapsulado en una cápside icosaédrica (T=3) , compuesta por 180 unidades de una única proteína de cubierta de 27–42K de tamaño; el virión mide 28–35 nm de diámetro y no está envuelto. [ 1 ] [ 6 ] 

Ciclo vital

La replicación viral es citoplasmática y lisogénica. La entrada en la célula huésped se logra mediante penetración. La replicación sigue el modelo de replicación de virus de ARN de cadena positiva. La transcripción de virus de ARN de cadena positiva, utilizando el modelo de terminación prematura de la transcripción de ARN subgenómico, es el método de transcripción. La traducción se lleva a cabo mediante escaneo con fugas, cambio de marco de lectura ribosómico -1, iniciación viral y supresión de la terminación. El virus sale de la célula huésped mediante movimiento viral guiado por túbulos. Las plantas son el huésped natural. Las vías de transmisión son mecánicas, por semillas y por contacto. [ 1 ] [ 7 ]

Los virus de esta familia se transmiten principalmente por el suelo; algunos son transmitidos por especies de hongos del orden Chytridiales , otros por vectores desconocidos. Los viriones pueden propagarse por el agua, el crecimiento de las raíces en suelo infectado, el contacto entre plantas, el polen o las semillas, según la especie del virus. Estos virus pueden transmitirse con éxito mediante injertos o inoculación mecánica, y tanto el virión como el material genético son infecciosos. [ 6 ]

Replicación

Los miembros de la familia Tombusviridae se replican en el citoplasma mediante el uso de plantillas de cadena negativa. El proceso de replicación deja un excedente de cadenas de ARN de sentido positivo (+), y se cree que el ARN viral no solo actúa como plantilla para la replicación, sino que también es capaz de manipular y regular la síntesis de ARN . [ 5 ]

Se ha demostrado que el nivel de síntesis de ARN se ve afectado por las propiedades cis-activas de ciertos elementos del ARN (como el ARN1 y el ARN2 [ 8 ] [ 9 ] ), que incluyen secuencias promotoras centrales que regulan el sitio de iniciación para la síntesis de la cadena de ARN complementaria. Se cree que este mecanismo es reconocido por la ARN polimerasa dependiente de ARN , que se encuentra codificada en el genoma. [ 5 ] [ 7 ] [ 10 ]

Se ha descubierto que los virus de la familia Tombusviridae utilizan la enzima metabólica del huésped GAPDH en el centro de replicación. GAPDH puede unirse a la cadena de ARN negativo (−) y mantenerla en el complejo de replicasa, permitiendo que las cadenas de ARN positivo (+) sintetizadas a partir de ella se exporten y se acumulen en la célula huésped. La disminución de la expresión de GAPDH redujo la acumulación de ARN viral y eliminó el exceso de copias de ARN positivo (+). [ 11 ]

Notas

Las investigaciones han demostrado que las plantas infectadas por tombusvirus contienen ARN interferentes defectuosos que se originan directamente del genoma de ARN del virus, sin genoma del huésped. Los ARN DI virales, debido a su pequeño tamaño y elementos cis-activos, son buenos modelos tanto in vivo como in vitro para estudiar la replicación del ARN. [ 12 ] [ 13 ] [ 14 ]

El ARN subgenómico se utiliza en la síntesis de algunas proteínas; se genera por la terminación prematura de la síntesis de la cadena negativa. Los sgRNA y las plantillas de sentido negativo de sgRNA se encuentran en las células infectadas. [ 6 ]

Taxonomía

La familia contiene las siguientes subfamilias y géneros (- virinae denota subfamilia y - virus denota género): [ 2 ]

Referencias

  1. 1 2 3 "Zona Viral" . ExPASy . Consultado el 15 de junio de 2015 .
  2. 1 2 "Taxonomía de virus: versión 2025" . Comité Internacional de Taxonomía de Virus . Consultado el 24 de marzo de 2026 .
  3. ↑ Habili, Nuredin; Symons, Robert H. (1989). "Relación evolutiva entre luteovirus y otros virus de ARN de plantas basada en motivos de secuencia en sus presuntas ARN polimerasas y helicasas de ácidos nucleicos" . Nucleic Acids Research . 17 (23): 9543– 9555. doi : 10.1093 / nar/17.23.9543 . PMC 335196. PMID 2557586 .  
  4. ↑ Sit, Tim L.; Lommel, Steven A. (2015). "Tombusviridae". Enciclopedia de Ciencias de la Vida . págs. 1–9 . doi : 10.1002/9780470015902.a0000756.pub3 . ISBN  978-0-470-01617-6.
  5. 1 2 3 "Tombusviridae". Taxonomía de virus . 2012. págs. 1111–1138 . doi : 10.1016/B978-0-12-384684-6.00096-3 . ISBN  978-0-12-384684-6.
  6. 1 2 3 ICTVdB—Base de datos universal de virus, versión 3 00.074. Tombusviridae
  7. 1 2 Nicholson, Beth L.; Lee, Pui Kei K.; White, KA (2012). "Los elementos internos de replicación del ARN son prevalentes en Tombusviridae" . Frontiers in Microbiology . 3 : 279. doi : 10.3389/fmicb.2012.00279 . PMC 3412338. PMID 22888327 .  
  8. ↑ Lommel SA, Weston-Fina M, Xiong Z, Lomonossoff GP (septiembre de 1988). "La secuencia de nucleótidos y la organización genética del ARN-2 del virus del mosaico necrótico del trébol rojo" . Nucleic Acids Research . 16 (17): 8587– 602. doi : 10.1093 / nar/16.17.8587 . PMC 338578. PMID 3047682 .  
  9. ↑ Mizumoto H, Tatsuta M, Kaido M, Mise K, Okuno T (noviembre de 2003). "Mejora de la traducción independiente de la caperuza por la región 3' no traducida del ARN1 del virus del mosaico necrótico del trébol rojo" . Journal of Virology . 77 (22): 12113–21 . doi : 10.1128/JVI.77.22.12113-12121.2003 . PMC 254280. PMID 14581548 .  
  10. ↑ White, K. Andrew; Nagy, Peter D. (2004). Avances en la biología molecular de los tombusvirus: expresión génica, replicación del genoma y recombinación . Progress in Nucleic Acid Research and Molecular Biology. Vol. 78. pp. 187–226 . doi : 10.1016/S0079-6603(04)78005-8 . ISBN   978-0-12-540078-7. PMID 15210331 . 
  11. ↑ Wang, Robert Yung-Liang; Nagy, Peter D. (2008). "El virus del enanismo arbustivo del tomate aprovecha la función de unión al ARN de una enzima metabólica del huésped para la síntesis de ARN genómico viral" . Cell Host & Microbe . 3 (3): 178– 187. doi : 10.1016/j.chom.2008.02.005 . PMID 18329617 . 
  12. ↑ NCBI: ARN interferente defectuoso-4 del virus del enanismo arbustivo del tomate (TBSV-P DI-4) y ARN interferente defectuoso-5 del virus del enanismo arbustivo del tomate (TBSV-P DI-5)
  13. ↑ Yamamura, Yoshimi; Scholthof, Herman B. (1 de septiembre de 2005). "Virus del enanismo arbustivo del tomate: un sistema modelo resistente para estudiar las interacciones virus-planta" . Molecular Plant Pathology . 6 (5): 491– 502. Bibcode : 2005MolPP...6..491Y . doi : 10.1111/j.1364-3703.2005.00301.x . PMID 20565674 . 
  14. ↑ Scholthof, Karen-Beth G.; Scholthof, Herman B.; Jackson, Andrew O. (1 de agosto de 1995). "El efecto de los ARN interferentes defectuosos en la acumulación de proteínas del virus del enanismo arbustivo del tomate e implicaciones para la atenuación de la enfermedad" . Virology . 211 (1): 324–328 . doi : 10.1006/viro.1995.1410 . PMID 7645230 . 
  • Viralzone : Tombusviridae
  • ICTV