Articulo de referencia

Elemento de respuesta de transactivación

El elemento de respuesta de transactivación (TAR) es un elemento de ARN que se sabe que es necesario para la transactivación del promotor del VIH y para la replicación del VIH. ...

El elemento de respuesta de transactivación (TAR) es un elemento de ARN que se sabe que es necesario para la transactivación del promotor del VIH y para la replicación del VIH. La estructura en horquilla TAR del VIH es una estructura dinámica [ 1 ] que actúa como un sitio de unión para la proteína Tat , y esta interacción estimula la actividad del promotor de repetición terminal larga . [ 2 ]

Análisis posteriores han demostrado que el TAR del VIH es un pre-microARN que produce microARN maduros a partir de ambas hebras del bucle del tallo TAR. [ 3 ] Se cree que estos microARN impiden que las células infectadas sufran apoptosis al regular negativamente los genes ERCC1 , IER3 , [ 4 ] CDK9 y Bim . [ 5 ]

El poliomavirus humano 2 ( virus JC ) contiene una secuencia homóloga a TAR en su promotor tardío [ 6 ] que responde a Tat derivado del VIH-1. [ 7 ] [ 8 ]

Referencias

  1. Lu, Jia; Kadakkuzha, Beena M.; Zhao, Liang; et  al. (2011). "Vista de conjunto dinámico del panorama conformacional del ARN TAR del VIH-1 y el reconocimiento alostérico". Bioquímica . 50 (22): 5042– 5057. doi : 10.1021/bi200495d . PMID 21553929 . 
  2. Kulinski, T; Olejniczak M; Huthoff H; Bielecki L; Pachulska-Wieczorek K; Das AT; Berkhout B; Adamiak RW (2003). "El bucle apical de la horquilla de ARN TAR del VIH-1 se estabiliza mediante un par de bases entre bucles" . J Biol Chem . 278 (40): 38892–38901 . doi : 10.1074/jbc.M301939200 . PMID 12882959 . 
  3. Ouellet DL, Plante I, Landry P, et al. (abril de 2008). "Identificación de microARN funcionales liberados mediante el procesamiento asimétrico del elemento TAR del VIH-1" . Nucleic Acids Res . 36 (7): 2353–2365 . doi : 10.1093 / nar/gkn076 . PMC 2367715. PMID 18299284 .   
  4. Klase Z, Winograd R, Davis J, et al. (2009). "El miRNA TAR del VIH-1 protege contra la apoptosis alterando la expresión génica celular" . Retrovirology . 6 : 18. doi : 10.1186/1742-4690-6-18 . PMC 2654423. PMID 19220914 .   
  5. Narayanan, A; Iordanskiy, S; Das, R; Van Duyne, R; Santos, S; Jaworski, E; Guendel, I; Sampey, G; Dalby, E; Iglesias-Ussel, M; Popratiloff, A; Hakami, R; Kehn-Hall, K; Young, M; Subra, C; Gilbert, C; Bailey, C; Romerio, F; Kashanchi, F (5 de julio de 2013). "Los exosomas derivados de células infectadas por el VIH-1 contienen ARN del elemento de respuesta de transactivación" . The Journal of Biological Chemistry . 288 (27): 20014– 20033. doi : 10.1074/jbc.m112.438895 . PMC 3707700. PMID 23661700 .  
  6. Chowdhury, Mashiul; Taylor, J. Paul; Chang, Chun-Fan; Rappaport, Jay; Khalili, Kamel (1992). "Evidencia de que una secuencia similar a TAR es importante para la inducción del promotor tardío del virus JC por el Tat del virus de la inmunodeficiencia humana tipo 1" . Journal of Virology . 66 (12): 7355– 7361. doi : 10.1128/jvi.66.12.7355-7361.1992 . PMC 240440. PMID 1331525 .  
  7. ^ Nukuzuma, Souichi; Kameoka, Masanori; Sugiura, Shigeki; Nakamichi, Kazuo; Nukuzuma, Chiyoko; Miyoshi, Isao; Takegami, Tsutomu (2012). "La proteína exógena del virus de la inmunodeficiencia humana-1, Tat, mejora la replicación del virus JC de manera eficiente en líneas celulares de neuroblastoma". Revista de Virología Médica . 84 (4): 555– 561. doi : 10.1002/jmv.23239 . PMID 22337293 . S2CID 35625307 .  
  8. Krachmarov, Chavdar P.; Chepenik, Lara G.; Barr-Vagell, Sharon; Khalili, Kamel; Johnson, Edward M. (1996). "Activación del elemento de control transcripcional sensible a Tat del virus JC mediante la asociación de la proteína Tat del virus de la inmunodeficiencia humana 1 con la proteína celular Purα" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 93 (24): 14112– 14117. Bibcode : 1996PNAS...9314112K . doi : 10.1073/pnas.93.24.14112 . PMC 34556. PMID 8943069 .  
  • Página del elemento de respuesta de transactivación (TAR) en Rfam
  • Página de miRBase para hiv1-mir-TAR