La proteína transmembrana 175 , o TMEM175 , es una proteína transmembrana que se cree que es un canal de potasio endolisosomal. Se predice que tiene muchos ortólogos en eucariotas .
Expresión
Según los perfiles EST humanos y de ratón y un perfil GEO de tejido humano, TMEM175 parece expresarse a un nivel relativamente alto (75-98%) en tejidos normales. [ 5 ] [ 6 ] TMEM175 parece estar regulado a la baja en el cáncer de ovario en estadio tres . [ 7 ]
Homología
La proteína transmembrana 175 no tiene parálogos. Sin embargo, sí tiene ortólogos en eucariotas. La siguiente tabla presenta algunos de los ortólogos encontrados mediante búsquedas en BLAST [ 8 ] y BLAT [ 9 ] . Esta lista no incluye todos los ortólogos de TMEM175. Su propósito es mostrar la diversidad de especies en las que se han encontrado ortólogos.
Modificación postraduccional prevista
Utilizando diversas herramientas en ExPASy [ 10 ], las siguientes son posibles modificaciones postraduccionales para TMEM175.
- 5 posibles sitios de fosforilación de CK2
- 2 posibles sitios de fosforilación de PKC
- Sitios de N-miristoilación alrededor de las regiones transmembrana
Los sitios de N-miristoilación se conservan en los vertebrados .
Referencias
- 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000127419 – Ensembl , mayo de 2017
- 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000013495 – Ensembl , mayo de 2017
- ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
- ↑ Visor de perfiles EST - Humano
- ↑ Visor de perfiles EST - Ratón
- ↑ [ Partheen K, Levan K, Osterberg L, Horvath G (noviembre de 2006). "El análisis de la expresión del adenocarcinoma ovárico seroso en estadio III distingue a un subgrupo de supervivientes" . European Journal of Cancer . 42 (16): 2846– 54. doi : 10.1016/j.ejca.2006.06.026 . PMID 16996261 .
- ↑ NCBI BLAST: Herramienta básica de búsqueda de alineación local
- ↑ Búsqueda de genoma BLAT
- ↑ Servidor de proteómica ExPASy
Lecturas adicionales
- "Estudio genético de la demencia con cuerpos de Lewy respalda la relación con las enfermedades de Alzheimer y Parkinson" . Institutos Nacionales de la Salud (NIH) . 16 de febrero de 2021. Consultado el 7 de agosto de 2023 .
- Genes en el cromosoma 4 humano
- Fragmentos de proteínas de membrana