Articulo de referencia

UFM1

El modificador de pliegue de ubiquitina 1 , también conocido como UFM1 , es una proteína que en humanos está codificada por el gen UFM1 . [ 5 ] [ 6 ] UFM1 es una proteína simila...

El modificador de pliegue de ubiquitina 1 , también conocido como UFM1 , es una proteína que en humanos está codificada por el gen UFM1 . [ 5 ] [ 6 ]

UFM1 es una proteína similar a la ubiquitina que se conjuga con proteínas diana mediante la enzima activadora tipo E1 UBA5 y la enzima conjugadora tipo E2 UFC1 . [ 6 ] Este proceso se conoce a menudo como UFMylación . [ 7 ]

Función

UFM1 comparte varias propiedades comunes con la ubiquitina (Ub) y otras proteínas similares a la ubiquitina (UBL). Ufm1 tiene una estructura terciaria similar a la de Ub, pero carece de una similitud de secuencia evidente . Se sintetiza como una forma precursora inactiva (pro-Ufm1) que tiene dos aminoácidos adicionales además de la glicina conservada. El mecanismo de conjugación de Ufm1 es similar al de la ubiquitina. La Ufm1 madura tiene una glicina C-terminal expuesta , esencial para la posterior activación por su proteína E1 correspondiente (Uba5). Este paso de activación da como resultado la formación de un enlace tioéster de alta energía en presencia de ATP. Posteriormente, la Ufm1 se transfiere a su enzima E2 correspondiente (Ufc1) mediante un enlace tioéster similar con una cisteína en el sitio activo de E2. Ufm1 se conjuga con diversas proteínas diana y forma complejos con proteínas aún no identificadas. Por lo tanto, presumiblemente existen ligasas E3 (no se ha identificado ninguna hasta la fecha) que realizan el paso final en la conjugación de Ufm1 a los objetivos relevantes. La modificación de proteínas con Ufm1 también es reversible. Hasta la fecha se han identificado dos nuevas proteasas de cisteína ( UFSP1 y UFSP2 ) que escinden las fusiones C-terminales de péptidos con Ufm1 y también eliminan Ufm1 de los conjugados intracelulares nativos. Estas proteasas no tienen una homología evidente con las enzimas desconjugadoras de ubiquitina. Las proteínas para la conjugación de Ufm1 (Uba5, Ufc1 y Ufm1) están conservadas en animales y plantas (pero no en levaduras), lo que sugiere funciones importantes en organismos multicelulares. Aún se desconoce la función exacta de la modificación de Ufm1 in vivo , [ 8 ] pero el objetivo principal parece ser uL24/RPL26 en células humanas. [ 7 ]

Referencias

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000120686 Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000027746 Ensembl , mayo de 2017
  3. "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. "Gen Entrez: UFM1 modificador de pliegue de ubiquitina 1" .
  6. 1 2 Komatsu M, Chiba T, Tatsumi K, Iemura S, Tanida I, Okazaki N, et al. (mayo de 2004). "Un nuevo sistema de conjugación de proteínas para Ufm1, un modificador del pliegue de la ubiquitina" . The EMBO Journal . 23 (9): 1977– 1986. doi : 10.1038/sj.emboj.7600205 . PMC 404325. PMID 15071506 .   
  7. 1 2 Walczak CP, Leto DE, Zhang L, Riepe C, Muller RY, DaRosa PA, et al. (enero de 2019). " La proteína ribosomal RPL26 es el principal objetivo de la UFMylation" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 116 (4): 1299– 1308. doi : 10.1073/pnas.1816202116 . PMC 6347690. PMID 30626644 .   
  8. "Descripción general de Boston Biochem UFM1" . Archivado del original el 15 de octubre de 2007. Consultado el 21 de mayo de 2008 .

Lecturas adicionales

  • Zhang QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, et  al. (octubre de 2000). "Clonación y análisis funcional de ADNc con marcos de lectura abiertos para 300 genes previamente no definidos expresados ​​en células madre/progenitoras hematopoyéticas CD34+" . Genome Research . 10 (10): 1546– 1560. doi : 10.1101/gr.140200 . PMC 310934. PMID 11042152 .  
  • Yu Y, Zhang C, Zhou G, Wu S, Qu X, Wei H, et  al. (agosto de 2001). "Perfil de expresión génica en hígado fetal humano e identificación de genes específicos de tejido y etapa de desarrollo a través de perfiles de expresión compilados y clonación eficiente de cDNAs de longitud completa" . Genome Research . 11 (8): 1392– 1403. doi : 10.1101/gr.175501 . PMC 311073. PMID 11483580 .  
  • Komatsu M, Chiba T, Tatsumi K, Iemura S, Tanida I, Okazaki N, et  al. (mayo de 2004). "Un nuevo sistema de conjugación de proteínas para Ufm1, un modificador del pliegue de la ubiquitina" . The EMBO Journal . 23 (9): 1977– 1986. doi : 10.1038/sj.emboj.7600205 . PMC 404325. PMID 15071506 .  
  • Sasakawa H, Sakata E, Yamaguchi Y, Komatsu M, Tatsumi K, Kominami E, et  al. (Abril de 2006). "Estructura de la solución y dinámica de Ufm1, un modificador 1 del pliegue de ubiquitina". Comunicaciones de investigación bioquímica y biofísica . 343 (1): 21– 26. doi : 10.1016/j.bbrc.2006.02.107 . PMID 16527251 . 
  • Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, et  al. (2007). "Mapeo a gran escala de interacciones proteína-proteína humanas mediante espectrometría de masas" . Molecular Systems Biology . 3 (1): 89. doi : 10.1038/msb4100134 . PMC 1847948. PMID 17353931 .  
  • Resumen de toda la información estructural disponible en el PDB para UniProt : P61960 (Modificador 1 del pliegue de ubiquitina humana) en el PDBe-KB .