UNKL

La proteína RING finger unkempt-like es una proteína que en humanos está codificada por el gen UNKL . ^{[ 5 ]}

Esta proteína se conoce comúnmente como dedo de zinc tipo UNK . Según NCBI.com, otros nombres para esta proteína incluyen ZC3H5L, C16orf28 y ZC3HDC5L. ^{[ 6 ]} Este gen es homólogo al dedo UNK de Drosophila , de ahí el término "dedo tipo UNK" para humanos. ^{[ 7 ]} La proteína UNKL es homóloga a la proteína UNK ya que comparten muchas similitudes en estructura y función. ^{[ 8 ]} La proteína UNKL también se puede encontrar en varios otros vertebrados debido a que forma parte del linaje de los vertebrados. ^{[ 9 ]} Según OMIM.org, "UNKL comparte un 87% y un 40% de identidad con los ortólogos de ratón y Drosophila, respectivamente". ^{[ 10 ]}

El gen UNKL para esta proteína pertenece a un grupo de genes denominados Proteínas de Dedo Anular (RNF). Según el Comité de Nomenclatura de Genes HUGO, las Proteínas de Dedo Anular son un motivo que contiene "un aminoácido Cys 3 HisCys 4... que se une a dos cationes de zinc". ^{[ 11 ]} Los dedos anulares son una molécula común utilizada para la ubiquitinación de ciertos sustratos. ^{[ 11 ]}

El gen UNKL se encuentra en el cromosoma 16 del genoma humano. ^{[ 12 ]} Debido a que el gen UNKL forma parte del genoma humano, puede desempeñar un papel en el desarrollo humano y en la regulación de ciertas vías biológicas. El cromosoma 16 es un cromosoma somático esencial para el desarrollo humano y la producción de moléculas como la hemoglobina . ^{[ 13 ]}

Raymond S. Brown informa que la proteína UNKL muestra "actividad de unión al ARN". ^{[ 14 ]} Raymond S. Brown afirma que este fenómeno se encuentra en proteínas "como la nucleocápside del VIH-1 (CCHC) [2, 3], la proteína σ3 del reovirus (C2H2) [4] y la proteína γb del virus del mosaico de la cebada rayada (C4C/H) [5]". ^{[ 14 ]}

La proteína en sí consta de una cadena de 680 aminoácidos , lo que le confiere un peso molecular de aproximadamente 73828 Da. ^{[ 12 ]} Esta proteína se puede encontrar en seis isoformas diferentes debido a ligeras diferencias en su composición genética. ^{[ 12 ]}

La proteína UNKL tiene varias regiones diferentes, algunas de las cuales se denominan "dedos". ^{[ 11 ]} Estas regiones reciben el nombre de dedos debido a su similitud estructural tridimensional con los dedos humanos. UNKL tiene dos tipos diferentes de dedos, que consisten en cuatro dedos de zinc cerca del extremo N y un dedo RING cerca del extremo C. ^{[ 10 ]}

La región del dedo anular (RING finger) de este gen tiene una longitud de entre 40 y 60 aminoácidos. ^{[ 11 ]} Esto hace que el peso del dedo anular sea de aproximadamente 720 a 1080 Da. El dedo anular se encuentra cerca de la región C-terminal. ^{[ 10 ]}

Los dedos de zinc de esta proteína se encuentran en la región N-terminal de la molécula. ^{[ 10 ]} El peso del dedo de zinc sería de aproximadamente 450 Da, ya que tiene una longitud de unos 25 aminoácidos. ^{[ 15 ]} Los dedos de zinc consisten en un motivo de 2 cisteínas y 2 histidinas y se consideran proteínas que se unen al ARN con fines reguladores. ^{[ 14 ]}

UNKL posiblemente forma parte de una molécula más grande conocida como el supuesto complejo de ligasa E3. ^{[ 16 ]} Según Quan Yang et al. en NCBI.com, "las ubiquitina ligasas E3 son una gran familia de enzimas que participan en una cascada de ubiquitinación de tres enzimas junto con la enzima activadora de ubiquitina E1 y la enzima conjugadora de ubiquitina E2". ^{[ 17 ]}

La proteína UNKL actúa como una transferasa en ciertas funciones moleculares, incluyendo un posible papel en el complejo de ligasa E3. ^{[ 18 ]} Estas ligasas E3 funcionan como facilitadoras de la ubiquitinación de una proteína sustrato. ^{[ 17 ]} La ubiquitinación es una modificación postraduccional en la que una proteína se une a otra proteína a través de una transferasa. ^{[ 19 ]} En el caso de UNKL, el sustrato que puede ser ubiquitinado por el complejo de ligasa E3 es el sustrato SMARCD2/BAF60b. ^{[ 20 ]}

Dado que se ha indicado que UNKL forma parte de la función de la ligasa E3, esto significa que también puede desempeñar un papel en la regulación y la respuesta al estrés celular. ^{[ 17 ]} Según Quan Yang et al. en NCBI.com, "las ligasas E3 están significativamente involucradas en la progresión del cáncer, como la proliferación, la invasión, la apoptosis, el daño y la reparación del ADN, el metabolismo, la inmunidad y muchos otros aspectos". ^{[ 17 ]}

Una parte importante de la regulación de UNKL es tener la capacidad de descomponer proteínas. ^{[ 21 ]} Esto puede hacerse por varias razones, como reciclar aminoácidos dentro de las proteínas, mantener la homeostasis o eliminar proteínas no funcionales.

Una de las isoformas alternativas de esta proteína, la isoforma 4, tiene funciones especializadas. Esto incluye interacciones especializadas con RAC1, una GTPasa . ^{[ 12 ]} La isoforma 4 de la proteína UNKL también tiene la capacidad de moverse entre el citoplasma y el núcleo. ^{[ 12 ]}

Dado que no se han realizado muchas investigaciones sobre las posibles funciones de esta proteína, la funcionalidad de la proteína UNLK aún se está investigando para comprender completamente los mecanismos biológicos y el propósito de esta molécula.