Hispanopedia WikiUnipept es una herramienta de investigación de código abierto para el análisis de biodiversidad de muestras metaproteómicas . También incluye una herramienta para seleccionar péptidos que se utilizarán como biomarcadores y otra para comparar el genoma de organismos en función de su contenido proteico. [ 2 ] [ 3 ] El software se desarrolla en la Universidad de Gante .
Unipept consta de una aplicación web y una herramienta de línea de comandos independiente. La aplicación web utiliza visualizaciones de datos interactivas para explorar conjuntos de datos. La herramienta de línea de comandos contiene la misma funcionalidad, pero está diseñada para su uso en flujos de procesamiento de datos automatizados. [ 4 ]
Referencias
- ↑ "Unipept Releases" . GitHub . Consultado el 14 de abril de 2019 .
- ↑ Mesuere, Bart; Devreese, Bart; Debyser, Griet; Aerts, Maarten; Vandamme, Peter; Dawyndt, Peter (2012). "Unipept: Análisis de biodiversidad basado en péptidos trípticos de muestras de metaproteoma". Journal of Proteome Research . 11 (12): 5773– 80. doi : 10.1021/pr300576s . ISSN 1535-3893 . PMID 23153116 .
- ^ Mesuere, Bart; Debyser, Griet; Aerts, Martín; Devreese, Bart; Vandamme, Peter; Dawyndt, Peter (2015). "El proceso de análisis de metaproteómica de Unipept". Proteómica . 15 (8): 1437– 1442. doi : 10.1002/pmic.201400361 . ISSN 1615-9853 . PMID 25477242 . S2CID 43820480 .
- ↑ "Documentación de la CLI de Unipept" . Consultado el 24 de agosto de 2015 .
Enlaces externos
- Página principal de Unipept
- Herramienta de línea de comandos Unipept
- Proyecto de código abierto Unipept
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