La proteína 4B asociada a la clasificación de proteínas vacuolares es una proteína que en humanos está codificada por el gen VPS4B . [ 5 ] [ 6 ]
La proteína codificada por este gen pertenece a la familia de proteínas AAA (ATPasas asociadas a diversas actividades celulares) y es el homólogo de la proteína Vps4 de la levadura.
En humanos, se han identificado dos parálogos de la proteína de levadura . Comparten un alto grado de similitud en la secuencia de aminoácidos entre sí y también con la proteína Vps4 de levadura y las proteínas de ratón. Estudios funcionales indican que ambos parálogos humanos se asocian con los compartimentos endosomales y participan en el tráfico intracelular de proteínas, de forma similar a la proteína Vps4 en levadura. El gen que codifica este parálogo se ha localizado en el cromosoma 18 ; el gen del otro ( VPS4A ) se encuentra en el cromosoma 16. [ 6 ]
Referencias
- 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000119541 – Ensembl , mayo de 2017
- 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000009907 – Ensembl , mayo de 2017
- ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
- ↑ Scheuring S, Rohricht RA, Schoning-Burkhardt B, Beyer A, Muller S, Abts HF, Kohrer K (septiembre de 2001). "Las células de mamíferos expresan dos proteínas VPS4, ambas implicadas en el tráfico intracelular de proteínas". J Mol Biol . 312 (3): 469–80 . doi : 10.1006/jmbi.2001.4917 . PMID 11563910 .
- 1 2 "Entrez Gene: VPS4B homólogo B de la proteína de clasificación vacuolar 4 (S. cerevisiae)" .
Lecturas adicionales
- Périer F, Coulter KL, Liang H, et al. (1994). "Identificación de un nuevo miembro mamífero de la familia NSF/CDC48p/Pas1p/TBP-1 mediante expresión heteróloga en levadura". FEBS Lett . 351 (2): 286– 90. doi : 10.1016/0014-5793( 94 )00879-5 . PMID 8082782. S2CID 31778093 .
- Mao M, Fu G, Wu JS, et al. (1998). "Identificación de genes expresados en células madre/progenitoras hematopoyéticas CD34+ humanas mediante etiquetas de secuencia expresada y clonación eficiente de ADNc de longitud completa" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 95 (14): 8175–80 . Bibcode : 1998PNAS...95.8175M . doi : 10.1073 / pnas.95.14.8175 . PMC 20949. PMID 9653160 .
- Scheuring S, Bodor O, Röhricht RA, et al. (1999). "Clonación, caracterización y expresión funcional del gen SKD1 de Mus musculus en levadura demuestra que los genes SKD1 de ratón y VPS4 de levadura son ortólogos y participan en el tráfico intracelular de proteínas". Gene . 234 (1): 149– 59. doi : 10.1016/S0378-1119(99)00163-8 . PMID 10393249 .
- Bishop N, Woodman P (2000). " La VPS4 de mamíferos con deficiencia de ATPasa se localiza en endosomas aberrantes y altera el tráfico de colesterol" . Mol. Biol. Cell . 11 (1): 227–39 . doi : 10.1091/mbc.11.1.227 . PMC 14770. PMID 10637304 .
- Zhang QH, Ye M, Wu XY, et al. (2001). "Clonación y análisis funcional de cDNAs con marcos de lectura abiertos para 300 genes previamente no definidos expresados en células madre/progenitoras hematopoyéticas CD34+" . Genome Res . 10 (10): 1546– 60. doi : 10.1101/gr.140200 . PMC 310934. PMID 11042152 .
- Howard TL, Stauffer DR, Degnin CR, Hollenberg SM (2002). "CHMP1 funciona como miembro de una familia recientemente definida de proteínas de tráfico de vesículas". J. Cell Sci . 114 (Pt 13): 2395–404 . doi : 10.1242/jcs.114.13.2395 . PMID 11559748 .
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generación y análisis inicial de más de 15.000 secuencias de ADNc humanas y de ratón de longitud completa" . Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
- Beyer A, Scheuring S, Müller S, et al. (2003). "Análisis comparativos de secuencia y expresión de cuatro genes VPS4 de mamíferos". Gene . 305 (1): 47– 59. doi : 10.1016/S0378-1119(02)01205-2 . PMID 12594041 .
- Strack B, Calistri A, Craig S, et al. (2003). "AIP1/ALIX es un socio de unión para HIV-1 p6 y EIAV p9 que funciona en la gemación del virus" . Cell . 114 ( 6): 689– 99. doi : 10.1016/S0092-8674(03)00653-6 . PMID 14505569. S2CID 10733770 .
- von Schwedler UK, Stuchell M, Müller B, et al. (2003). "La red proteica de la gemación del VIH" . Cell . 114 ( 6): 701– 13. doi : 10.1016/S0092-8674(03)00714-1 . PMID 14505570. S2CID 16894972 .
- Fujita H, Umezuki Y, Imamura K, et al. (2005). "Las proteínas Vps de clase E de mamíferos, SBP1 y mVps2/CHMP2A, interactúan con una AAA-ATPasa SKD1/Vps4B y regulan su función". J. Ciencia celular . 117 (parte 14): 2997– 3009. doi : 10.1242/jcs.01170 . PMID 15173323 . S2CID 726248 .
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "Estado, calidad y expansión del proyecto de ADNc de longitud completa de los NIH: la colección de genes de mamíferos (MGC)" . Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928. PMID 15489334 .
- Katoh K, Suzuki H, Terasawa Y, et al. (2006). "La proteína penta-EF-hand ALG-2 interactúa directamente con el componente ESCRT-I TSG101 y se colocaliza de forma dependiente de Ca2+ en endosomas aberrantes con la ATPasa AAA dominante negativa SKD1/Vps4B" . Biochem . J. 391 ( Pt 3): 677–85 . doi : 10.1042/BJ20050398 . PMC 1276969. PMID 16004603 .
- Takasu H, Jee JG, Ohno A, et al. (2005). "Caracterización estructural del dominio MIT de Vps4b humano". Biochem. Biophys. Res. Commun . 334 (2): 460– 5. doi : 10.1016/j.bbrc.2005.06.110 . PMID 16018968 .
- Scott A, Chung HY, Gonciarz-Swiatek M, et al. (2005). " Estudios estructurales y mecanísticos de las proteínas VPS4" . EMBO J. 24 ( 20): 3658– 69. doi : 10.1038/sj.emboj.7600818 . PMC 1276703. PMID 16193069 .
- Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, et al. (2006). "Diversificación de la modulación transcripcional: identificación y caracterización a gran escala de promotores alternativos putativos de genes humanos" . Genome Res . 16 (1): 55– 65. doi : 10.1101/gr.4039406 . PMC 1356129. PMID 16344560 .
- Welsch S, Habermann A, Jäger S, et al. (2007). "El análisis ultraestructural de las proteínas ESCRT sugiere un papel para las membranas tubulares-vesiculares asociadas a endosomas en la función de ESCRT". Traffic . 7 (11): 1551– 66. doi : 10.1111/j.1600-0854.2006.00489.x . PMID 17014699 . S2CID 36879122 .
- Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, et al. (2006). "Dinámica de fosforilación global, in vivo y específica del sitio en redes de señalización" . Cell . 127 ( 3): 635– 48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. S2CID 7827573 .
- Lambert C, Döring T, Prange R (2007). "La maduración del virus de la hepatitis B es sensible a la inhibición funcional de ESCRT-III, Vps4 y γ2-adaptina" . J. Virol . 81 (17): 9050–60 . doi : 10.1128/JVI.00479-07 . PMC 1951427. PMID 17553870 .
- Genes en el cromosoma 18 humano
- Fragmentos de genes del cromosoma 18 humano